一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用，开发了72对扩增引物，其对应的72个InDel分子标记均匀分布在水稻12条染色体上，每条染色体有6个InDel分子标记。本发明专利技术可为检测药用野生稻或药用野生稻与栽培稻之间的分子多态性，以及药用野生稻中优良基因的定位或导入栽培稻后的选育提供低成本、高效率的标记资源，本发明专利技术开发InDel分子标记及其扩增引物的方法，在不经过药用野生稻和栽培稻的基因组测序情况下，能在较短时间内大量发展出区分用于检测药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记，克服了药用野生稻中优异基因发掘利用困难的现状。用野生稻中优异基因发掘利用困难的现状。用野生稻中优异基因发掘利用困难的现状。

【技术实现步骤摘要】
一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用


[0001]本专利技术属于分子生物学及植物分子遗传育种
，具体涉及一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物及其应用，以及开发其InDel分子标记和/或扩增引物的方法。

技术介绍

[0002]世界上至今发现约27种野生稻，中国分布有3种，分别为普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)、药用野生稻(Oryza officinalis Wall.)和疣粒野生稻(Oryza meyeriana Nees.)。其中，普通野生稻的染色体组和栽培稻(Oryza sativa L.)同为AA基因组，它们之间亲缘关系较为接近，而药用野生稻(CC基因组)和疣粒野生稻(GG基因组)与栽培稻的染色体组不一样，亲缘关系相对较远。普通野生稻在我国水稻育种历程中发挥了巨大作用，并取得了显著的效果。要实现水稻育种的新突破，选用非AA基因组的野生稻是新的途径。尤其药用野生稻，具有其独特的遗传性状，如植株高大、茎秆粗壮、高光效、高抗各种病虫害、耐冷、耐贫瘠等，这些性状本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记的InDel引物组合，其特征在于，所述InDel引物组合由72对InDel引物组成，每对InDel引物由正向引物和反向引物组成，72对InDel引物的编号为InDel1引物至InDel72引物，具体是：InDel1引物由SEQ ID NO：1所示的InDel1正向引物和SEQ ID NO：2所示的InDel1反向引物组成；InDel2引物由SEQ ID NO：3所示的InDel2正向引物和SEQ ID NO：4所示的InDel2反向引物组成；InDel3引物由SEQ ID NO：5所示的InDel3正向引物和SEQ ID NO：6所示的InDel3反向引物组成；InDel4引物由SEQ ID NO：7所示的InDel4正向引物和SEQ ID NO：8所示的InDel4反向引物组成；InDel5引物由SEQ ID NO：9所示的InDel5正向引物和SEQ ID NO：10所示的InDel5反向引物组成；InDel6引物由SEQ ID NO：11所示的InDel6正向引物和SEQ ID NO：12所示的InDel6反向引物组成；InDel7引物由SEQ ID NO：13所示的InDel7正向引物和SEQ ID NO：14所示的InDel7反向引物组成；InDel8引物由SEQ ID NO：15所示的InDel8正向引物和SEQ ID NO：16所示的InDel8反向引物组成；InDel9引物由SEQ ID NO：17所示的InDel9正向引物和SEQ ID NO：18所示的InDel9反向引物组成；InDel10引物由SEQ ID NO：19所示的InDel10正向引物和SEQ ID NO：20所示的InDel10反向引物组成；InDel11引物由SEQ ID NO：21所示的InDel11正向引物和SEQ ID NO：22所示的InDel11反向引物组成；InDel12引物由SEQ ID NO：23所示的InDel12正向引物和SEQ ID NO：24所示的InDel12反向引物组成；InDel13引物由SEQ ID NO：25所示的InDel13正向引物和SEQ ID NO：26所示的InDel13反向引物组成；InDel14引物由SEQ ID NO：27所示的InDel14正向引物和SEQ ID NO：28所示的InDel14反向引物组成；InDel15引物由SEQ ID NO：29所示的InDel15正向引物和SEQ ID NO：30所示的InDel15反向引物组成；InDel16引物由SEQ ID NO：31所示的InDel16正向引物和SEQ ID NO：32所示的InDel16反向引物组成；InDel17引物由SEQ ID NO：33所示的InDel17正向引物和SEQ ID NO：34所示的InDel17反向引物组成；InDel18引物由SEQ ID NO：35所示的InDel18正向引物和SEQ ID NO：36所示的InDel18反向引物组成；
InDel19引物由SEQ ID NO：37所示的InDel19正向引物和SEQ ID NO：38所示的InDel19反向引物组成；InDel20引物由SEQ ID NO：39所示的InDel20正向引物和SEQ ID NO：40所示的InDel20反向引物组成；InDel21引物由SEQ ID NO：41所示的InDel21正向引物和SEQ ID NO：42所示的InDel21反向引物组成；InDel22引物由SEQ ID NO：43所示的InDel22正向引物和SEQ ID NO：44所示的InDel22反向引物组成；InDel23引物由SEQ ID NO：45所示的InDel23正向引物和SEQ ID NO：46所示的InDel23反向引物组成；InDel24引物由SEQ ID NO：47所示的InDel24正向引物和SEQ ID NO：48所示的InDel24反向引物组成；InDel25引物由SEQ ID NO：49所示的InDel25正向引物和SEQ ID NO：50所示的InDel25反向引物组成；InDel26引物由SEQ ID NO：51所示的InDel26正向引物和SEQ ID NO：52所示的InDel26反向引物组成；InDel27引物由SEQ ID NO：53所示的InDel27正向引物和SEQ ID NO：54所示的InDel27反向引物组成；InDel28引物由SEQ ID NO：55所示的InDel28正向引物和SEQ ID NO：56所示的InDel28反向引物组成；InDel29引物由SEQ ID NO：57所示的InDel29正向引物和SEQ ID NO：58所示的InDel29反向引物组成；InDel30引物由SEQ ID NO：59所示的InDel30正向引物和SEQ ID NO：60所示的InDel30反向引物组成；InDel31引物由SEQ ID NO：61所示的InDel31正向引物和SEQ ID NO：62所示的InDel31反向引物组成；InDel32引物由SEQ ID NO：63所示的InDel32正向引物和SEQ ID NO：64所示的InDel32反向引物组成。InDel33引物由SEQ ID NO：65所示的InDel33正向引物和SEQ ID NO：66所示的InDel33反向引物组成；InDel34引物由SEQ ID NO：67所示的InDel34正向引物和SEQ ID NO：68所示的InDel34反向引物组成；InDel35引物由SEQ ID NO：69所示的InDel35正向引物和SEQ ID NO：70所示的InDel35反向引物组成；InDel36引物由SEQ ID NO：71所示的InDel36正向引物和SEQ ID NO：72所示的InDel36反向引物组成；InDel37引物由SEQ ID NO：73所示的InDel37正向引物和SEQ ID NO：74所示的InDel37反向引物组成；InDel38引物由SEQ ID NO：75所示的InDel38正向引物和SEQ ID NO：76所示的InDel38
反向引物组成；InDel39引物由SEQ ID NO：77所示的InDel39正向引物和SEQ ID NO：78所示的InDel39反向引物组成；InDel40引物由SEQ ID NO：79所示的InDel40正向引物和SEQ ID NO：80所示的InDel40反向引物组成；InDel41引物由SEQ ID NO：81所示的InDel41正向引物和SEQ ID NO：82所示的InDel41反向引物组成；InDel42引物由SEQ ID NO：83所示的InDel42正向引物和SEQ ID NO：84所示的InDel42反向引物组成；InDel43引物由SEQ ID NO：85所示的InDel43正向引物和SEQ ID NO：86所示的InDel43反向引物组成；InDel44引物由SEQ ID NO：87所示的InDel44正向引物和SEQ ID NO：88所示的InDel44反向引物组成；InDel45引物由SEQ ID NO：89所示的InDel45正向引物和SEQ ID NO：90所示的InDel45反向引物组成；InDel46引物由SEQ ID NO：91所示的InDel46正向引物和SEQ ID NO：92所示的InDel46反向引物组成；InDel47引物由SEQ ID NO：93所示的InDel47正向引物和SEQ ID NO：94所示的InDel47反向引物组成；InDel48引物由SEQ ID NO：95所示的InDel48正向引物和SEQ ID NO：96所示的InDel48反向引物组成；InDel49引物由SEQ ID NO：97所示的InDel49正向引物和SEQ ID NO：98所示的InDel49反向引物组成。InDel50引物由SE...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈玲，程在全，肖素勤，王波，张云，王玲仙，殷富有，钟巧芳，张敦宇，柯学，刘丽，李金璐，卢源达，余腾琼，蒋聪，
申请(专利权)人：云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所，
类型：发明
国别省市：