【技术实现步骤摘要】
一种多基因风险评估方法
[0001]本专利技术有关一种基因检测风险判定系统,以现场可程序化逻辑门阵列(FPGA)及加速卡将基因检测数据及体质诊断数据通过一算法计算单核苷酸多态性的结果。
技术介绍
[0002]在遗传流行病学中,基因及环境是主要影响人体罹患疾病的两大构面,该构面如何评估使用者的生理反应也颇具不确定性。在中国台湾技术专利M606684(以下简称'684技术专利)的「个人化特定代谢基因营养补充品配对装置」中,提到利用个人化特定代谢基因营养补充品配对的专利技术,可协助临床医师精准使用血糖代谢路径与细胞讯息传递的路径当中各种基因序列之后,提供结合药物敏感基因与提升营养功效的处方;通过检出特定16个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,从中分类关键13个基因位点,四大细胞层次,通过演算来针对不同的代谢路径当中的一个评估分析。该'684技术专利所揭露的方法依序包含了一基因测序模块;一单一基因华人风险产生模块;一多基因代谢综合风险评估模块,该多基因代谢综合风险评估模块包括 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种多基因风险评估方法,其特征在于,包含:(1)读取使用者的一基因测序输出讯号,并将该基因测序输出讯号通过第一接口传输至一现场可程序化逻辑门阵列(FPGA);(2)通过一读取装置将用户填写的一问卷结果通过第二接口传输至该现场可程序化逻辑门阵列;(3)通过一加速卡的内建基因组数据,以加速运算;(4)基于读取的该问卷结果及一疾病盛行率以计算平均值及标准偏差;(5)由服务器通过一监督式机器学习算法及数个分类器模块以进行风险预测;(6)在步骤(4)及步骤(5)结果一致后输出结果至显示设备;及(7)采用分级及临界值标示方式归类健康风险等级。2.依据权利要求1所述的多基因风险评估方法,其特征在于,该步骤(3)为该现场可程序化逻辑门阵列电连接该加速卡,采用二元搜寻法及递归步骤减少数组值搜寻及该现场可程序化逻辑门阵列计算所需的复杂度。3.依据权利要求1所述的多基因风险评估方法,其特征在于,该步骤(1)及该步骤(2)可通过RJ45、D
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Sub、USB、GPIO、SPI、CCI方式电接該服务器进行数据整合。4.依据权利要求1所述的多基因风险评估方法,其特征在于,该步骤(1)读取自Affymetrix、Agilent、Illumina的检测仪的讯号。5.依据权...
【专利技术属性】
技术研发人员:李友铮,黄建豪,
申请(专利权)人:长佳智能股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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