数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法技术

技术编号:36691379 阅读:24 留言:0更新日期:2023-02-27 19:59
本发明专利技术提供了一种数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法,涉及PCR检测技术领域,包括:获取一批微滴图像对应的预设评价指标下的影响分析数据,影响分析数据包括目标体积变异参数和目标理论拷贝数浓度;基于蒙特卡罗法,确定与影响分析数据对应的目标评价指标值。如此实现了微滴体积变异对预设评价指标的定量影响分析,缓解了目前仅从原理上要求尽量控制微滴体积均一性的问题,有利于指导数字PCR微滴产生流程的设计优化,易于理解,容易实现。容易实现。容易实现。

【技术实现步骤摘要】
数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法


[0001]本专利技术涉及PCR检测
,尤其是涉及一种数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法。

技术介绍

[0002]数字PCR(polymerase chain reaction,聚合酶链反应)属于第三代PCR技术,原理是将一个PCR反应体系分配到大量微小的反应单元(即微反应器)中,在每个微反应器中不含、或含有1个或多个拷贝的目标核酸分子模板,进行“单分子模板”PCR扩增,扩增结束后,通过终点荧光信号判断阳性单元,通过统计方法计算原始样本中目标基因的拷贝数。数字PCR无需依赖于对照样品、标准曲线就可进行精确的绝对定量检测,具有比荧光定量PCR更加出色的灵敏度、特异性和精确性,已经受到越来越多的关注。
[0003]微滴式数字PCR系统即将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴,待扩增反应结束后,采用拍照方式,通过微滴的亮暗来判断微滴的阴阳性,然后根据亮暗微滴的数量进行统计分析,获得目标基因的拷贝数目。显然亮暗微滴的数量直接影响到最终的分析结果,但在对照片进行图像处理时,常会发现因大本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法,其特征在于,包括:获取一批微滴图像对应的预设评价指标下的影响分析数据,所述影响分析数据包括目标体积变异参数和目标理论拷贝数浓度;基于蒙特卡罗法,确定与所述影响分析数据对应的目标评价指标值。2.根据权利要求1所述的数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法,其特征在于,所述获取一批微滴图像对应的预设评价指标下的影响分析数据,包括:获取一批微滴图像及其对应的基因拷贝数和理论微滴数;对各个所述微滴图像进行微滴尺寸识别,得到尺寸识别结果;根据所述尺寸识别结果,确定目标体积变异参数;其中,所述目标体积变异参数包括体积变异类型和变异程度,所述体积变异类型包括整体随机变异或局部确定性变异;根据所述基因拷贝数和所述理论微滴数,计算得到目标理论拷贝数浓度。3.根据权利要求2所述的数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法,其特征在于,所述对各个所述微滴图像进行微滴尺寸识别,得到尺寸识别结果,包括:对各个所述微滴图像依次进行滤波、图像增强和分割处理,得到包括每个微滴尺寸的尺寸识别结果。4.根据权利要求2所述的数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法,其特征在于,所述根据所述尺寸识别结果,确定目标体积变异参数,包括:从所述尺寸识别结果对应的初始微滴集合中,去除大于预设尺寸上限的微滴以及小于预设尺寸下限的异常微滴,得到剩余微滴集合;当所述剩余微滴集合的微滴数量满足最少微滴数量要求时,判断所述剩余微滴集合的微滴尺寸是否满足正态分布;当满足时,确定体积变异类型为整体随机变异,变异程度为所述剩余微滴集合的微滴尺寸对应的均值和标准差;当不满足时,通过对所述剩余微滴集合的微滴尺寸进行聚类分析,确定体积变异类型为局部确定性变异及变异程度。5.根据权利要求4所述的数字PCR中微滴体积变异的影响分析方法,其特征在于,所述通过对所述剩余微滴集合的微滴尺寸进行聚类分析,确定体积变异类型为局部确定性变异及变异程度,包括:对所述剩...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨智赵云鹏刘荃高琪李冬贺贤汉
申请(专利权)人:杭州博日科技股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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