溴结构域抑制剂治疗亨廷顿病的用途制造技术

本公开涉及使用BRD9抑制剂治疗亨廷顿病。本公开涉及使用BRD9抑制剂治疗亨廷顿病。本公开涉及使用BRD9抑制剂治疗亨廷顿病。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】溴结构域抑制剂治疗亨廷顿病的用途
[0001]1.相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2020年4月8日提交的美国临时申请号63/007,161的优先权，其全部内容通过引用并入本文。
[0003]2.背景
[0004]亨廷顿病(HD)是进行性、致命的神经退行性疾病，其以显性方式遗传，并由亨廷顿基因(HTT)中的多态性三核苷酸(CAG)通道扩增的突变引起。美国医学遗传学学院/美国人类遗传学会亨廷顿病基因检测工作组(Am J Hum Genet.1998；62：1243
‑
7)表明HTT基因中26个或更少的CAG重复序列被认为是“正常的”；27
‑
35个CAG重复序列被认为是可变的正常等位基因；36个或更多的CAG重复序列被认为是致病等位基因。HTT基因编码HTT蛋白，扩增的CAG束导致蛋白质N末端附近的聚谷氨酰胺重复序列病理性增加。它是一种常染色体显性遗传疾病，虽然个体携带两个HTT基因拷贝，但一个突变等位基因足以导致HD。
[0005]HD与运动、行为和认知症状的三联征有关。运动障碍是该病的主要特征，其中舞蹈病是最明显的运动症状。虽然对诊断有用，但舞蹈病是疾病严重程度的不良标志。相反，残疾和疾病严重程度与负性运动特征最相关，例如精细运动技能、运动迟缓和粗大运动协调技能受损，包括言语困难、步态和姿势功能障碍(Mahant等人.,2003,Neurology 61(8)：1085
‑
92)。
[0006]开出许多药物被用于改善与HD相关的运动和情绪问题；然而，各种药物对HD有用的科学证据不足(Mestre等人,2009,Cochrane Database Syst Rev.(3)：CD006455；Mestre等人,2009,Cochrane Database Syst Rev.(3)：CD006456)。因此，在开发药物以改善HD症状方面存在显著未满足的医疗需求。
3.
技术实现思路

[0007]BRD9是含溴结构域的蛋白质，在其序列一半的氨基末端含有溴结构域，并且在其羧基末端有功能未知的结构域(DUF3512)。BRD9是染色质重塑BAF(也称为SWI/SNF)复合物的一部分(Kadoch等人,2013,Nat.Genet.45,592
‑
601；Middeljans等人,2012,PLoS.One.7,e33834)。已经在卵巢癌和乳腺癌中观察到BRD9基因座的反复扩增(参见例如Kang等人,2008,Cancer Genet.Cytogenet.182：1
‑
11；Scotto等人,2008,Mol.Cancer 7：58)，并且正在开发BRD9抑制剂作为潜在的癌症治疗剂(参见例如Martin等人,2016,J.Med.Chem.59(10)：4462
‑
4475)。本公开基于以下发现：BRD9抑制剂可有效逆转人类类器官HD模型中的疾病表型，因此可用于治疗患有HD的患者。
[0008]因此，本公开提供了通过向有此需要的受试者施用有效量的BRD9抑制剂来治疗HD的方法。方法和其中使用的BRD9抑制剂的实例在下文第6部分和具体实施方案1至47中描述。
[0009]在另一个方面，本公开提供了用于在有此需要的受试者中治疗HD的BRD9抑制剂。用于在有此需要的受试者中治疗HD的BRD9抑制剂的实例在下文第6部分和具体实施方案48至94中提供。
[0010]在又一方面，本公开提供了BRD9抑制剂在制备用于治疗HD的药物中的用途。在制备用于治疗HD的药物中使用BRD9抑制剂的实例在下文第6部分和具体实施方案95和96中提供。
4.附图说明
[0011]图1A
‑
1B显示了盘形微图案上类神经胚(Neuruloids)的免疫荧光分析。(图1A)上图：俯视图。下图：侧视图。用DAPI、PAX6和N
‑
CAD染色。(图1B)左图：在神经发育阶段人类胚胎内的外胚层室的卡通图片。右图：人类类神经胚的代表。神经细胞102、神经嵴104、颅基板106和表皮108。重组的胚胎部分显示发育中的中枢神经系统在中心组织成一个神经花环(PAX6+细胞，图1A)，连同神经嵴(SOX10+)和基板命运(placode fates)(SIX1+)，被一层表皮细胞覆盖(仅限TFAP2+)。在受精后第21天左右，体外类神经胚与体内对应物的比较(图1B)揭示了高度的相似性，使它们成为研究人类遗传疾病和发现基于表型逆转的药物的理想临床前终点。
[0012]图2显示了HD系的表型特征。(左图)类神经胚测定中不同HD等基因系的PAX6区域的代表性图像。PAX6染色允许Pax6区域的可视化。(右图)由菌落区域归一化的PAX6区域的相关量化。请注意HTT
‑
/
‑
系显示出最显著的表型。这表明HTT蛋白的poly
‑
Q扩增代表主要的负性功能丧失，而不是通常假设的毒性功能的获得。
[0013]图3举例说明了HD类神经胚的表型逆转概念，其将用作高通量筛选活动的基础。
[0014]图4显示了AI介导的药物筛选分析的方案。特定网络用于输入筛选实验中的所有图像。网络经过专门训练，可以输出两个量：药物毒性和药物功效。
[0015]图5显示了筛选活动的结果。将2080种化合物的作用绘制为功效(表型挽救)和毒性的函数。WT对照(RUES2)和HD
‑
56CAG(56CAG)对照分别被绘制为指向右侧和指向左侧的三角形。向上的三角形代表每种化合物的效果。菱形代表苗头化合物(hit compounds)，突出显示具有高效和低毒性的分子。
[0016]图6显示溴孢菌素挽救了HD类神经胚表型。(上图)初筛的结果。从左到右：WT对照和HD对照孔以及用10μM溴孢菌素处理的HD孔的实例。每个孔包含大约27个类神经胚重复。用DAPI(细胞核)、PAX6(神经标记)和鬼笔环肽(丝状肌动蛋白)染色类神经胚。(下图)使用溴孢菌素原料在小规模实验中进行苗头化合物验证(hit validation)。用SOX10(神经嵴标记)、PAX6(神经标记)和N
‑
CAD(细胞
‑
细胞粘附)染色类神经胚。0.5μM溴孢菌素挽救了HD表型。
[0017]图7显示溴孢菌素效力和毒性的量化。测量溴孢菌素在挽救类神经胚HD
‑
56CAG表型方面的功效(空心菱形和曲线)。这显示了120nM的EC
50
。在WT
‑
20CAG背景和HD
‑
56CAG背景中，溴孢菌素毒性作为浓度的函数来测量。
[0018]图8显示了一组BRD抑制剂在10μM单一浓度下在类神经胚测定中的活性。对于每个分子，点表示其已知的分子靶标，并且显示了挽救功效(斑点条)和毒性水平(虚线条)。只有挽救活性高于右侧虚线表示的阈值且毒性低于左侧虚线水平的化合物才被视为苗头本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.治疗患有亨廷顿病(HD)的受试者的方法，所述方法包括向受试者施用治疗有效量的溴结构域9(BRD9)抑制剂。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述BRD9抑制剂不与降解决定子缀合。3.根据权利要求1所述的方法，其中施用所述BRD9抑制剂不诱导体内蛋白酶体介导的BRD9降解。4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为选择性BRD9抑制剂。5.根据权利要求4所述的方法，其中与对BRD2相比，所述BRD9抑制剂对BRD9的抑制作用至少是2倍或至少5倍大。6.根据权利要求4或权利要求5所述的方法，其中与对BRD3相比，所述BRD9抑制剂对BRD9的抑制作用至少是2倍或至少5倍大。7.根据权利要求4至6中任一项所述的方法，其中与对BRD4相比，所述BRD9抑制剂对BRD9的抑制作用至少是2倍或至少5倍大。8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为吡啶酮化合物。9.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为BI
‑
9564或其药学上可接受的盐：10.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为BI
‑
7273或其药学上可接受的盐：11.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为甲基喹啉酮化合物。12.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为LP
‑
99或其药学上可接受的盐：
13.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为噻吩并吡啶酮化合物。14.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为I
‑
BRD9或其药学上可接受的盐：15.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为d
‑
BRD9或其药学上可接受的盐：16.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为TP
‑
472或其药学上可接受的盐：
17.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为GNE
‑
375或其药学上可接受的盐：18.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为式(I)化合物或其对映异构体、非对映异构体、立体异构体或药学上可接受的盐：其中：A为苯基或含有1或2个选自N和S的杂原子的5
‑
或6
‑
元杂芳基，其中所述苯基或杂芳基未被取代或被1至3个R3基团取代；R1为H、(C1‑
C4)烷基或(C1‑
C4)卤代烷基；每个R2独立地为(C1‑
C4)烷基、(C1‑
C4)卤代烷基、(C1‑
C4)烷氧基、(C1‑
C4)卤代烷氧基、卤素、OH或NH2；每个R3独立地为(C1‑
C4)烷基、(C1‑
C4)卤代烷基、(C1‑
C4)烷氧基、(C1‑
C4)卤代烷氧基、卤
素、OH、NH2或X1为NR5或O；Y1为S(O)
a
或NR5；每个R4独立地为(C1‑
C4)烷基、(C1‑
C4)卤代烷基、卤素或
‑
C(O)(C1‑
C3)烷基；每个R5独立地为H或(C1‑
C4)烷基；每个R6独立地为H或(C1‑
C4)烷基；a为0、1或2；和n和r各自独立地为0、1、2或3。19.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为式(II)化合物或其对映异构体、非对映异构体、立体异构体或药学上可接受的盐：其中：R1为(C1‑
C3)烷基或环丙基；R2为卤素、(C1‑
C3)烷基、(C1‑
C3)卤代烷基、NH2、NH(C1‑
C3)烷基或OH；X1为N或CR3，并且X2为N或CR4；条件是X1和X2不能同时为N；R3为H或(C1‑
C3)烷基；R4为H或(C1‑
C3)烷基；条件是R3和R4不能同时为(C1‑
C3)烷基；或者，R2和R3一起形成苯环或5
‑
6元杂芳环，其中每个环可以独立地未被取代或被一个或多个独立地为卤素、OH、NH2、NH(C1‑
C3)烷基或(C1‑
C3)烷基的基团取代，其中所述(C1‑
C3)烷基可以未被取代或被5
‑
6元杂芳基或苯基取代；R5和R9相同或不同，且独立地为H、O(C1‑
C3)烷基或(C1‑
C3)烷基；R6和R8相同或不同，且独立地为H、OH、卤素、NH2、(C1‑
C3)烷基、O(C1‑
C3)烷基、O(C1‑
C3)卤代烷基、(C1‑
C3)烷基
‑
O
‑
(C1‑
C3)烷基、4
‑
7元杂环烷基、(C1‑
C3)烷基
‑
SO2‑
(C1‑
C3)烷基、(C1‑
C3)烷基
‑
NH2、(C1‑
C3)烷基
‑
N((C1‑
C3)烷基)2、N((C1‑
C3)烷基)2或NHR
13
；R
13
每次存在时独立地为SO2‑
(C1‑
C3)烷基或(C1‑
C3)烷基，其中所述(C1‑
C3)烷基未被取代或被5至6元杂芳基取代；或者，R5和R6一起形成苯环；或者，R7和R6或R7和R8一起形成5
‑
7元杂环烷基，其未被取代或被(C1‑
C3)烷基取代；
R7为H、NH2、Y
‑
R
12
、(C1‑
C3)烷基或4
‑
7元杂环烷基；Y为CR
10
R
11
、SO2或CO；R
10
和R
11
相同或不同，且独立地为H或(C1‑
C3)烷基；或者R
10
和R
11
一起形成C3‑4环烷基；R
12
为NH2、OH、(C1‑
C3)烷基、N(R
15
,R
16
)、OR
17
、芳基或5
‑
6元杂芳基，其中所述芳基或杂芳基独立地未被取代或被一个或多个卤素或4
‑
7元杂环烷基取代，其中每个杂环烷基独立地未被取代或被一个或多个选自以下的基团取代：卤素、OH、NH2、(C1‑
C3)烷基、NH(C1‑
C3)烷基、N((C1‑
C3)烷基)2、O(C1‑
C3)烷基和CH2R
14
；R
14
为5
‑
10元单环或双环芳基或杂芳基，其未被取代或被NH2、OH、卤素、CN、(C1‑
C3)烷基或O(C1‑
C3)烷基取代；R
15
为H或(C1‑
C3)烷基；R
16
为(C1‑
C3)烷基、C2‑3烷基
‑
N((C1‑
C3)烷基)2、C2‑3烷基
‑
NH(C1‑
C3)烷基或4
‑
7元杂环烷基，其中杂环烷基未被取代或被(C1‑
C3)烷基取代；R
17
为(C1‑
C3)烷基或4
‑
7元杂环烷基，其中杂环烷基未被取代或被(C1‑
C3)烷基取代；其中当R7为YR
12
时，R6和R8可以相同或不同并且独立地为H、OH、卤素、NH2、CN、(C1‑
C3)烷基、(C1‑
C3)卤代烷基、O(C1‑
C3)烷基、O(C1‑
C3)卤代烷基或(C1‑
C3)烷基
‑
O
‑
(C1‑
C3)烷基；和其中取代基R5至R9中的至少一个不是氢。20.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为非选择性BRD9抑制剂。21.根据权利要求20所述的方法，其中所述BRD9抑制剂为溴孢菌素或其药学上可接受的盐：22.根据权利要求1至21中任一项所述的方法，其中所述BRD9抑制剂以氨基酸缀合物的形式施用。23.根据权利要求22所述的方法，其中所述氨基酸缀合物为赖氨酸缀合物。24.根据权利要求22所述的方法，其中所述氨基酸缀合物为苯丙氨酸缀合物。25.根据权利要求1至24中任一项所述的方法，其中将所述BRD9抑制剂与载体一起施用于受试者。26.根据权利要求25所述的方法，其中所述载体包括纳米颗粒、外泌体或碳纳米管。27.根据权利要求26所述的方法，其中所述载体包括纳米颗粒。28.根据权利要求27所述的方法，其中所述纳米颗粒包括基于脂质的纳米颗粒。29.根据权利要求27所述的方法，其中所述纳米颗粒包括基于人血清白蛋白的纳米颗粒。30.根据权利要求27所述的方法，其中所述纳米颗粒包括基于载脂蛋白的纳米颗粒。
31.根据权利要求27所述的方法，其中所述纳米颗粒包括基于聚合物的纳米颗粒。32.根据权利要求27所述的方法，其中所述纳米颗粒包括基于树枝状聚合物的纳米颗粒。33.根据权利要求27所述的方法，其中所述纳米颗粒包括基于无机物的纳米颗粒。34.根据权利要求26所述的方法，其中所述载体包括外泌体。35.根据权利要求26所述的方法，其中所述载体包括碳纳米管。36.根据权利要求1至35中任一项所述的方法，进一步包括将脑通透性增强剂辅助施用于受试者。37.根据权利要求36所述的方法，其中将所述BRD9抑制剂和脑通透性增强剂在单一药物组合物中共同施用。38.根据权利要求36或权利要求37所述的方法，其中所述脑通透性增强剂包括cereport、瑞加诺生或冰片。39.根据权利要求38所述的方法，其中所述脑通透性增强剂包括cereport。40.根据权利要求38所述的方法，其中所述脑通透性增强剂包括瑞加诺生。41.根据权利要求38所述的方法，其中所述脑通透性增强剂包括冰片。42.根据权利要求1至41中任一项所述的方法，其进一步包括对所述受试者进行微泡增强超声。43.根据权利要求1至42中任一项所述的方法，其中将所述BRD9抑制剂经鼻内施用于受试者。44.根据权利要求1至42中任一项所述的方法，其中将所述BRD9抑制剂静脉内施用于受试者。45.根据权利要求1至42中任一项所述的方法，其中将所述BRD9抑制剂通过动脉内注射施用于受试者。46.根据权利要求1至42中任一项所述的方法，其中将所述BRD9抑制剂施用于受试者的CSF。47.根据权利要求46所述的方法，其中将所述BRD9抑制剂通过鞘内、脑室内或脑实质内给药。48.BRD9抑制剂，其用于在有此需要的受试者中治疗亨廷顿病(HD)。49.根据权利要求48所述的BRD9抑制剂，其中所述BRD9抑制剂不与降解决定子缀合。50.根据权利要求48所述的BRD9抑制剂，其中所述BRD9抑制剂的施用不诱导体内蛋白酶体介导的BRD9降解。51.根据权利要求48至50中任一项所述的BRD9抑制剂，其中所述BRD9抑制剂为选择性BRD9抑制剂。5...

【专利技术属性】
技术研发人员：C佩雷达塞拉斯，F埃托克，
申请(专利权)人：鲁米科学控股股份有限公司，
类型：发明
国别省市：