用于核酸检测的高重指导池化制造技术

在某些实施方案中，本文提供了使用可编程核酸酶检测样品中多种靶核酸或样品中靶核酸的多种区段的各种方法、试剂和装置。在某些实施方案中，本公开提供了指导核酸、可编程核酸酶和检测核酸的池的组合物以及使用所述组合物检测样品中一种靶核酸的不同区段或不同靶核酸的方法。核酸的方法。核酸的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】NO:28具有至少60％的序列同一性。
[0010]在一些方面，可编程核酸酶是Cas14酶。在进一步的方面，Cas14酶是Cas14a、Cas14b、Cas14c、Cas14d、Cas14e、Cas14f、Cas14g或Cas14h。
[0011]在其他方面，可编程核酸酶包含至少两个HEPN结构域。在进一步的方面，可编程核酸酶是VI型Cas酶。在更进一步的方面，可编程核酸酶是Cas13酶。在更进一步的方面，Cas13酶是Cas13a、Cas13b、Cas13c、Cas13d或Cas13e。
[0012]在一些方面，靶核酸是DNA。在其他方面，靶核酸是RNA。在一些方面，组合物还包含靶核酸。在一些方面，靶核酸包含不同的靶核酸。
[0013]在多个方面，本公开提供了一种测定样品中的靶核酸的区段的方法，该方法包括：使样品与如权利要求1
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30中任一项的组合物接触；以及测定由检测核酸的切割产生的信号。
[0014]在一些方面，该方法还包括逆转录靶核酸，扩增靶核酸，体外转录靶核酸或它们的任何组合。在一些方面，扩增是等温扩增。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种组合物，所述组合物包含可编程核酸酶和包含大于20种不同指导核酸序列的指导核酸池，其中所述池中的至少一种指导核酸与靶核酸的区段杂交。2.如权利要求1所述的组合物，其中所述指导核酸池包含至少50种不同指导核酸序列、至少100种不同指导核酸序列、至少500种不同指导核酸序列或至少1000种不同指导核酸序列。3.如权利要求1
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2中任一项所述的组合物，其中所述指导核酸池包含与所述靶核酸的不同区段杂交的至少两种指导核酸。4.如权利要求1
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3中任一项所述的组合物，其中所述指导核酸池中的指导核酸具有选自一组对应于所述靶核酸的核酸的平铺指导核酸的序列。5.如权利要求4所述的组合物，其中：a)所述平铺指导核酸在与所述靶核酸杂交时沿着所述靶核酸是连续的；b)所述平铺指导核酸在与所述靶核酸杂交时沿着所述靶核酸是不连续的；c)所述平铺指导核酸在与所述靶核酸杂交时沿着所述靶核酸重叠；或者d)它们的任何组合。6.如权利要求1
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5中任一项所述的组合物，其中所述靶核酸来自病原体。7.如权利要求1
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2中任一项所述的组合物，其中所述指导核酸池中的至少两种指导核酸与不同靶核酸的区段杂交。8.如权利要求7所述的组合物，其中所述不同靶核酸中的至少两种靶核酸来自不同病原体。9.如权利要求6或权利要求8所述的组合物，其中所述病原体是病毒、细菌、真菌、原生动物或蠕虫。10.如权利要求1
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9中任一项所述的组合物，其中所述指导核酸池中的指导核酸与来自金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、白色念珠菌、铜绿假单胞菌、鲍氏不动杆菌、嗜麦芽寡养单胞菌、艰难梭菌、大肠杆菌、结核分枝杆菌或军团菌属的区段杂交。11.如权利要求1
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10中任一项所述的组合物，其中所述指导核酸池中的至少两种指导核酸彼此相差至少一个碱基。12.如权利要求1
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11中任一项所述的组合物，其中所述指导核酸池的总浓度为约400nM、约1000nM(1μM)或约2000nM(2μM)。13.如权利要求1
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12中任一项所述的组合物，其中所述指导核酸池中的每种指导核酸包含20至50个碱基。14.如权利要求13所述的组合物，其中每种指导核酸包含30至50个碱基。15.如权利要求1
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14中任一项所述的组合物，其中所述可编程核酸酶是V型CRISPR
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Cas酶。16.如权利要求1
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15中...

【专利技术属性】
技术研发人员：马修，
申请(专利权)人：猛犸生物科学公司，
类型：发明
国别省市：