数字切片重扫描方法、装置、设备及介质制造方法及图纸

技术编号:36427766 阅读:12 留言:0更新日期:2023-01-20 22:38
本发明专利技术公开了数字切片重扫描方法、装置、设备及介质,其方法包括S1、获取数字切片的扫描图像,判断图像质量,若符合预设要求,则执行S6,否则,执行S2;S2、判定扫描图像质量的缺陷类型,若为整体模糊,则执行S3;若为局部模糊,则执行S4;S3、按第一预设策略重新建模扫描,判断重新建模后的扫描图像的图像质量,若符合预设要求,则执行S6;否则,判定扫描图像质量的缺陷类型,若仍为整体模糊,执行S5,若为局部模糊,执行S4;S4、按第二预设策略重新建模扫描,判断重新建模后的扫描图像的图像质量,若符合预设要求,则执行S6;否则,执行S5;S5、输出质量异常提示;S6、图像归档。本发明专利技术可自动判断图像缺陷类型,采取不同的策略自动重扫。采取不同的策略自动重扫。采取不同的策略自动重扫。

【技术实现步骤摘要】
数字切片重扫描方法、装置、设备及介质


[0001]本专利技术涉及数字切片扫描
,具体涉及数字切片重扫描方法、装置、设备及介质。

技术介绍

[0002]数字切片扫描设备将传统切片扫描拼接变成一张高分辨率的数字图片后,用户可以脱离显微镜随时随地在计算机或移动设备上浏览切片,同时具有永不褪色,易于保存、管理、分享、全视场查看可随意放大缩小等优点。已经广泛应用于病理诊断、教学培训、药物研究和科学研究等领域。
[0003]随着应用的推广,对扫描仪的性能越来越高,特别是扫描质量与速度,要获得比较好的图像质量,要求每个视野对焦准确,而通常数字化一张切片需要拍摄成千上万个视野的图像,所以对焦方式会影响扫描速度。传统的每个视野都对焦,虽然可以获得较好的图像质量,但速度成为瓶颈。因此,目前更多的是采用焦面建模的方法,如专利201110283732.2,即先选取切片的若干视场计算出焦面位置作为模型点,根据这几个模型点通过算法估算出切片中每个视场的焦面位置,这样在扫描时,不需要再移动Z轴采集多张图像计算离焦量,只需根据建模的焦面位置驱动Z轴即可,显著提高速度。
[0004]但此时,经常会碰到图像模糊的问题,常规方法是人工阅片后发现有图像质量问题,再进行重扫,这时需要人工干预,比如人工选取模型点,手动对焦后再进行自动建模扫描,降低了效率。
[0005]此外,专利《CN113256573A

判定数字切片质量的方法和装置》和《CN114820510A

细胞病理图像质量评价方法》对不同的显微标本的数字切片图像质量进行评估,供用户判断是否需要重新扫描,减轻了部分工作量,但仍需要人工干预进行重扫。如果是高通量的扫描仪,由于扫描的切片比较多,如果存在多张有模糊问题的切片,还要费精力去找出相应的切片,效率也进一步降低了。
[0006]因此,有必要提出一种数字切片重扫描方法,在图像质量不符合预设要求时,能自动调整扫描策略,减少人工识别与干预,以提高扫描成功率并尽可能降低重扫率。

技术实现思路

[0007]本专利技术旨在一定程度上解决上述技术中的技术问题之一。为此,本专利技术提出一种数字切片重扫描方法,通过对图像质量进行整体模糊与局部模糊的评价,并设定针对性的重新扫描策略,减少人工复核切片的工作量,以提高扫描成功率及效率。
[0008]具体地,数字切片重扫描方法包括如下步骤:
[0009]S1、获取数字切片的扫描图像,判断图像质量,若符合预设要求,则执行S6,否则,执行S2;
[0010]S2、判定扫描图像质量的缺陷类型,若为整体模糊,则执行S3;若为局部模糊,则执行S4;
[0011]S3、按第一预设策略重新建模扫描,判断重新建模后的扫描图像的图像质量,若符合预设要求,则执行S6;否则,判定扫描图像质量的缺陷类型,若仍为整体模糊,执行S5,若为局部模糊,执行S4;
[0012]S4、按第二预设策略重新建模扫描,判断重新建模后的扫描图像的图像质量,若符合预设要求,则执行S6;否则,执行S5。
[0013]S5、输出质量异常提示;
[0014]S6、图像归档。
[0015]进一步地,S2中,获取模糊视野的数量,若模糊视野的数量小于模糊评价阈值,则判定为局部模糊;否则,判定为整体模糊。
[0016]进一步地,S3中,第一预设策略包括判断模型点的焦面位置是否比参考位置高出第一位置阈值,若是,将模型点的对焦范围的上限设置为原模型点的焦面位置与第一位置阈值的差值;若否,将模型点的对接范围的上下限设置为参考位置加减第二位置阈值;
[0017]进一步地,S4中,第二预设策略包括:
[0018]S41、判断局部模糊的严重程度,若为严重模糊,则执行S42,否则,执行S43;
[0019]S42、识别组织区域与盖玻片区域,判断是否存在处于盖玻片区域外的组织区域,若是,执行步骤S43;若否,执行步骤S45;
[0020]S43、将扫描区域限定为在盖玻片区域内的组织区域,重新建模扫描,判断图像质量,若符合预设要求,则执行S6,否则,执行S44;
[0021]S44、判断局部模糊的严重程度,若为严重模糊则执行S5,若为轻微模糊则执行S45;
[0022]S45、在原模型点的基础上,在模糊区域增设模型点,重新建模扫描判断重新建模后的扫描图像的图像质量,若符合预设要求,则执行S6;否则,执行S5。
[0023]优选地,S45中,在执行S5之前,还包括S46:查询模糊视野的数量,若模糊视野的数量不小于数量阈值,则采用走停模式,对每个视野自动对焦;或者,采用扩展景深模式进行扫描。
[0024]进一步地,获取聚焦因子,若聚焦因子的值小于第一聚焦阈值,则判定为严重模糊;若聚焦因子的值大于等于第一聚焦阈值,但小于第二聚焦阈值,则判定为轻微模糊。
[0025]进一步地,在扫描数字切片过程中,同步执行S1

S6。
[0026]本专利技术还公开了一种切片扫描装置,包括:
[0027]获取模块,用于获取数字切片的扫描图像;
[0028]评估模块,用于评估扫描图像的质量,若扫描图像存在缺陷,则判定其缺陷类型为整体模糊还是局部模糊;
[0029]纠正模块,用于根据评估模块的评估结果,按第一预设策略和/或第二预设策略执行重新扫描动作,并将重新扫描的结果反馈给评估模块,供评估模块判定继续纠正或归档;
[0030]归档模块,用于在获得合格的扫描图像时结束当前时刻的扫描流程并存储扫描图像。
[0031]本专利技术还公开了一种切片扫描设备,包括处理器和存储器,所述存储器存储有能够被所述处理器执行的计算机可执行指令,所述处理器执行所述计算机可执行指令以实现如前所述的方法。
[0032]本专利技术还公开了一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机可执行指令,所述计算机可执行指令在被处理器调用和执行时,计算机可执行指令促使处理器实现如前所述的方法。
[0033]基于本专利技术提出的数字切片重扫描方法,本专利技术可以自动对数字切片的扫描图像进行评价,判断图像缺陷类型,非异常情况无需人工干预,自动执行重扫动作,降低人力投入。
[0034]基于本专利技术提出的数字切片重扫描方法的执行逻辑,本专利技术可以减少不必要的重扫动作,显著降低重扫率。
[0035]基于本专利技术提出的数字切片重扫描方法的执行逻辑,本专利技术可以在数字切片的扫描过程中边扫描边评估边纠正,不必等整张切片扫描完成才能评估及重扫,进一步提高了效率。
附图说明
[0036]图1为本专利技术数字切片重扫描方法步骤示意图;
[0037]图2为本专利技术数字切片重扫描方法流程示意图;
[0038]图3为本专利技术切片扫描装置示意图;
[0039]图4为本专利技术切片扫描设备示意图。
具体实施方式
[0040]下面详细描述本专利技术的实施例,所述实施例的示例在附图中示出,其本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.数字切片重扫描方法,其特征在于,包括:S1、获取数字切片的扫描图像,判断图像质量,若符合预设要求,则执行S6,否则,执行S2;S2、判定扫描图像质量的缺陷类型,若为整体模糊,则执行S3;若为局部模糊,则执行S4;S3、按第一预设策略重新建模扫描,判断重新建模后的扫描图像的图像质量,若符合预设要求,则执行S6;否则,判定扫描图像质量的缺陷类型,若仍为整体模糊,执行S5,若为局部模糊,执行S4;S4、按第二预设策略重新建模扫描,判断重新建模后的扫描图像的图像质量,若符合预设要求,则执行S6;否则,执行S5;S5、输出质量异常提示;S6、图像归档。2.如权利要求1所述的数字切片重扫描方法,其特征在于:S2中,获取模糊视野的数量,若模糊视野的数量小于模糊评价阈值,则判定为局部模糊;否则,判定为整体模糊。3.如权利要求1所述的数字切片重扫描方法,其特征在于:S3中,第一预设策略包括判断模型点的焦面位置是否比参考位置高出第一位置阈值,若是,将模型点的对焦范围的上限设置为原模型点的焦面位置与第一位置阈值的差值;若否,将模型点的对接范围的上下限设置为参考位置加减第二位置阈值,第二位置阈值小于第一位置阈值。4.如权利要求1所述的数字切片重扫描方法,其特征在于,S4中,第二预设策略包括:S41、判断局部模糊的严重程度,若为严重模糊,则执行S42,否则,执行S43;S42、识别组织区域与盖玻片区域,判断是否存在处于盖玻片区域外的组织区域,若是,执行步骤S43;若否,执行步骤S45;S43、将扫描区域限定为在盖玻片区域内的组织区域,重新建模扫描,判断图像质量,若符合预设要求,则执行S6,否则,执行S44;S44、判断局部模糊的严重程度,若为严重模糊则执行S5,若为轻微模糊...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈木旺贾守礼
申请(专利权)人:麦克奥迪实业集团有限公司
类型:发明
国别省市:

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