一种荧光图筛选的方法、装置、设备以及存储介质制造方法及图纸

本发明专利技术公开了一种荧光图筛选的方法、装置、设备以及存储介质。该方法包括：根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组；根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列；并融合所述第三时序荧光图的序列中的荧光图，得到序列荧光图模板；根据所述序列荧光图模板，得到所述待筛选时序荧光图的序列中各时序荧光图的碱基序列。采用本发明专利技术的技术方案，可以过滤掉待筛选时序荧光图的序列中时序荧光图的质量出现变化对序列荧光图模板质量的影响，从而提升碱基序列的数据通量和比对率。的数据通量和比对率。的数据通量和比对率。

【技术实现步骤摘要】
一种荧光图筛选的方法、装置、设备以及存储介质


[0001]本专利技术涉及基因测序
，尤其涉及一种荧光图筛选的方法、装置、设备以及存储介质。

技术介绍

[0002]在基因测序领域，待测序核酸片段的识别方式有很多，主流的识别方案是通过CCD成像系统采集携带核酸的荧光信号，并采集一系列带有荧光信号的图像，分析少量不同时序下的荧光图像，通过碱基识别系统得到对应的碱基序列以及碱基序列的质量来评估数据，而少量不同时序下荧光图像对应评估质量数据决定了最终批量获取所有时序荧光图对应的核酸序列的质量，核酸的质量为开展下一步的基因组学的研究提供了研究基础，故不同时序下荧光图的质量评估显得尤为重要。
[0003]目前，分析时序荧光图的方式可以为：从时序荧光图序列中融合部分连续的时序荧光图，得到荧光图模板；将所述荧光图模板匹配时序荧光图序列中的各时序荧光图，得到对应的碱基序列以及碱基序列的质量评估数据。在生成时序荧光图序列的过程中，可能会由于测序仪器精度误差，设备配套实际误差等因素，影响时序荧光图序列中时序荧光图的质量，如果得到荧光图模板的部分连续的时序荧光图质量被影响，将影响荧光图模板的质量，从而影响质量评估数据的准确性。

技术实现思路

[0004]本专利技术提供了一种荧光图筛选的方法、装置、设备以及存储介质，稳定碱基序列的数据通量和比对率。
[0005]根据本专利技术的第一方面，提供了一种荧光图筛选的方法，该方法包括：
[0006]根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组，单个第一时序荧光图组包括待筛选时序荧光图的序列中的M个第一时序荧光图，M大于等于2；
[0007]根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列；并融合所述第三时序荧光图的序列中的荧光图，得到序列荧光图模板；
[0008]根据所述序列荧光图模板，得到所述待筛选时序荧光图的序列中各时序荧光图的碱基序列。
[0009]可选的，所述根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组，包括：
[0010]从N个待筛选时序荧光图的序列中获取P个第一时序荧光图组，单个第一时序荧光图组中包括M个第一时序荧光图，N≥M；
[0011]根据第一时序荧光图的评估质量，得到各第一时序荧光图组的评估质量；并根据第一时序荧光图组的评估质量，从所述P个第一时序荧光图组中获取S个第二时序荧光图组，单个第二时序荧光图组中包括M个第二时序荧光图，P≥S。
[0012]进一步的，所述根据第一时序荧光图组的评估质量，从所述P个第一时序荧光图组中获取S个第二时序荧光图组，包括：
[0013]将所述第一时序荧光图组的评估质量降序排列，从所述P个第一时序荧光图组中获取前S个第二时序荧光图组。
[0014]可选的，所述N大于等于4，小于等于25；所述M大于等于4，小于等于9。
[0015]可选的，所述根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列，包括：
[0016]根据所述第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次，计算第二时序荧光图的频次以及评估质量的综合值；
[0017]将第二时序荧光图的综合值降序排序，得到前M个第三时序荧光图。
[0018]进一步的，所述根据所述第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次，计算第二时序荧光图的频次以及评估质量的综合值，包括：
[0019]将第二时序荧光图的频次乘以评估质量，得到综合值；或者，
[0020]将第二时序荧光图的频次除以评估质量，得到综合值；或者，
[0021]将所述第二时序荧光图按照频次降序排序得到第一排序值，将所述第二时序荧光图按照评估质量降序排序得到第二排序值，如果所述第一排序值等于所述第二排序值，则根据所述第一排序值或者所述第二排序值确定对应的综合值；如果所述第一排序值不等于所述第二排序值，则根据所述第一排序值确定对应的综合值。
[0022]可选的，在所述根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组之前，还包括：
[0023]分别融合各第一时序荧光图组的荧光图，得到各第一时序荧光图组的组荧光图模板；
[0024]根据所述组荧光图模板，得到各第一时序荧光图组中第一时序荧光图的子评估质量；
[0025]计算所述第一时序荧光图组中相同第一时序荧光图的子评估质量的平均值，作为所述第一时序荧光图的评估质量。
[0026]根据本专利技术的第二方面，提供了一种荧光图筛选的装置，该装置包括：
[0027]确定模块，用于根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组，单个第一时序荧光图组包括待筛选时序荧光图的序列中的M个第一时序荧光图，M大于等于2；
[0028]融合模块，用于根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列；并融合所述第三时序荧光图的序列中的荧光图，得到序列荧光图模板；
[0029]分析模块，用于根据所述序列荧光图模板，得到所述待筛选时序荧光图的序列中各时序荧光图的碱基序列。
[0030]根据本专利技术的第三方面，提供了一种电子设备，包括：至少一个处理器；以及与所述至少一个处理器通信连接的存储器；其中，所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的指令，所述指令被所述至少一个处理器执行，以使所述至少一个处理器实现如本专利技术任一实施例所述的荧光图筛选的方法。
[0031]根据本专利技术的第四方面，提供了一种计算机可读存储介质，所述计算机指令用于使所述计算机执行如本专利技术任一实施例所述荧光图筛选的方法。
[0032]本专利技术公开了一种荧光图筛选的方法、装置、设备以及存储介质。该方法包括：根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组；根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列；并融合所述第三时序荧光图的序列中的荧光图，得到序列荧光图模板；根据所述序列荧光图模板，得到所述待筛选时序荧光图的序列中各时序荧光图的碱基序列。
[0033]采用本专利技术的技术方案，通过随机选择第一时序荧光图，从而避免待筛选时序荧光图的序列中时序荧光图的质量出现变化而影响序列荧光图模板的质量的情况；以及，根据各第一时序荧光图的评估质量确定的第二时序荧光图组，以及根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列，可以进一步屏蔽待筛选时序荧光图的序列中时序荧光图的质量出现变化而影响序列荧光图模板的质量的情况；通过以上方式得到的序列荧光图模板，可以过滤掉待筛选时序荧光图的序列中时序荧光图的质量出现变化对序列荧光图模板质量的影响，从而提升碱基序列的数据通量和比对率。
[0034]应当理解，本部分所描述的内容并非旨在标识本专利技术的实施例的关键或重要特征，也不用于限制本专利技术的范围。本专利技术的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种荧光图筛选的方法，其特征在于，所述方法包括：根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组，单个第一时序荧光图组包括待筛选时序荧光图的序列中的M个第一时序荧光图，M大于等于2；根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列；并融合所述第三时序荧光图的序列中的荧光图，得到序列荧光图模板；根据所述序列荧光图模板，得到所述待筛选时序荧光图的序列中各时序荧光图的碱基序列。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据第一时序荧光图组中各第一时序荧光图的评估质量，确定第二时序荧光图组，包括：从N个待筛选时序荧光图的序列中获取P个第一时序荧光图组，单个第一时序荧光图组中包括M个第一时序荧光图，N≥M；根据第一时序荧光图的评估质量，得到各第一时序荧光图组的评估质量；并根据第一时序荧光图组的评估质量，从所述P个第一时序荧光图组中获取S个第二时序荧光图组，单个第二时序荧光图组中包括M个第二时序荧光图，P≥S。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述根据第一时序荧光图组的评估质量，从所述P个第一时序荧光图组中获取S个第二时序荧光图组，包括：将所述第一时序荧光图组的评估质量降序排列，从所述P个第一时序荧光图组中获取前S个第二时序荧光图组。4.根据权利要求2或3所述的方法，其特征在于，所述N大于等于4，小于等于25；所述M大于等于4，小于等于9。5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次以及评估质量确定第三时序荧光图的序列，包括：根据所述第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次，计算第二时序荧光图的频次以及评估质量的综合值；将第二时序荧光图的综合值降序排序，得到前M个第三时序荧光图。6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述根据所述第二时序荧光图在所述第二时序荧光图组中的频次，计算第二时序荧光图的频次以及评估质量的综合值，包括：...

【专利技术属性】
技术研发人员：张继锋，袁静贤，
申请(专利权)人：郑州思昆生物工程有限公司，
类型：发明
国别省市：