暗场微滴图像识别的方法、装置、计算机设备和存储介质制造方法及图纸

本申请涉及一种核酸分子的暗场微滴图像识别方法、装置、计算机设备、存储介质和计算机程序产品。该方法包括：获取所述暗场微滴图像，从所述暗场微滴图像中提取前景标记、背景标记以及图像的梯度幅值；将所述前景标记、背景标记以及图像的梯度幅值进行叠加，获得梯度幅值图像；根据所述梯度幅值图像进行分割，获得所述暗场微滴图像中各微滴的图像。采用本方法能够提高识别暗场微滴的准确率。够提高识别暗场微滴的准确率。够提高识别暗场微滴的准确率。

【技术实现步骤摘要】
暗场微滴图像识别的方法、装置、计算机设备和存储介质


[0001]本申请涉及微滴式数字PCR
，特别是涉及一种暗场微滴图像识别的方法、装置、计算机设备和存储介质。

技术介绍

[0002]微滴式数字聚合酶链式反应是第三代数字PCR技术，是一种对核酸分子进行绝对定量的方法，通过它可以直接测得样品中的目标基因的拷贝数。该技术通过数字PCR芯片，将核酸样本稀释后随机分散到数万个油包水结构的液滴中，然后将微滴中的DNA样本与特异性荧光标记物结合进行PCR反应。PCR反应结束后，借助显微镜使用CCD相机分别在明场和暗场的环境下，对微滴进行拍照，从而得到明场微滴图像和暗场微滴图像，最后分别对这两种图像进行图像识别与检测。
[0003]暗场荧光微滴图像的获得需要在完全黑暗的环境下，首先，用激发光源照射微滴使得阳性微滴发光，由于激发光源的强度有限且照射存在不均匀性，暗场荧光微滴图像的亮度和对比度都较低。由于微滴的排列较为密集，微滴与微滴之间存在粘连现象，导致目前的微滴识别算法存在计算准确率不高的问题。

技术实现思路

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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种核酸分子的暗场微滴图像识别方法，其特征在于，所述方法包括：获取所述暗场微滴图像，从所述暗场微滴图像中提取前景标记、背景标记以及图像的梯度幅值；将所述前景标记、背景标记以及图像的梯度幅值进行叠加，获得梯度幅值图像；根据所述梯度幅值图像进行分割，获得所述暗场微滴图像中各微滴的图像。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述从所述暗场微滴图像中提取前景标记、背景标记以及图像的梯度幅值，包括：根据所述暗场微滴图像计算所述暗场微滴图像中前景标记和背景标记的分割阈值；根据所述分割阈值将所述暗场微滴图像进行分割，获得所述暗场微滴图像中前景的二值图像；对前景的二值图像进行腐蚀，然后对腐蚀的结果进行膨胀，获得处理后的前景二值图像；确定处理后的前景二值图像中极大值区域，并对所述极大值区域的面积进行计算；将处理后的前景二值图像中区域面积与所述极大值区域的面积的差值大于预设差值的区域剔除，获得所述前景标记。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述对前景的二值图像进行腐蚀，然后对腐蚀的结果进行膨胀，获得处理后的前景二值图像之后，包括：对所述前景二值图像中每个第一像素分别与和所述第一像素距离最近的第二像素的距离，获得以距离表示的像素图像；利用分水岭算法确定所述像素图像中的分界线；根据所述分界线，从所述暗场微滴图像获得所述背景标记。4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述从所述暗场微滴图像中提取前景标记、背景标记以及图像的梯度幅值，还包括：通过自适应H
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【专利技术属性】
技术研发人员：廖丽敏，李珍珍，王素娟，曾杰生，
申请(专利权)人：佛山丁智生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：