确定分子之间关系的方法及电子设备技术

本公开实施例涉及一种确定分子之间关系的方法及电子设备。该方法包括：基于第一分子的表面黎曼流形上的拉普拉斯算符的本征函数，确定第一分子的第一化学特征；基于第二分子的表面黎曼流形上的拉普拉斯算符的本征函数，确定第二分子的第二化学特征；通过泛函映射，确定第一化学特征与第二化学特征之间的泛函映射矩阵；以及基于泛函映射矩阵，确定第一分子与第二分子之间的相似性。以此方式，本公开实施例通过基于黎曼流形上的拉普拉斯算符的本征函数来确定分子的化学特征，可以基于化学特征来确定泛函映射矩阵，从而能够在流形空间比较不同分子之间的相似性。这样避免通过对齐等方式来比较分子的三维几何结构，减小了计算量，提升了处理的效率。提升了处理的效率。提升了处理的效率。

【技术实现步骤摘要】
确定分子之间关系的方法及电子设备


[0001]本公开总体上涉及计算机领域和生物信息领域，并且更具体地涉及确定分子之间关系的方法及电子设备。

技术介绍

[0002]不同的化学组成和几何结构决定了生物分子在生命活动中的作用，因此在生物制药领域，分子的结构
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活性关系是其中重要的因素。例如，抗体蛋白会与特定的抗原(病毒等)结合从而抑制疾病。因此，理解分子之间的相互作用在生物制药领域(例如新药研发)至关重要。
[0003]传统方式中，一般通过湿实验的方法获取生物分子之间的相互作用的信息，例如测量药物小分子和受体蛋白质的解离平衡常数，观测分子结合后形成复合物的3维结构，进而筛选出合适的药物分子进行优化设计。然而，这种方法成本较高、且耗时较长，确定方式效率过低，进而影响了生物制药领域中的任务(例如新药研发)的效率。

技术实现思路

[0004]根据本公开的示例实施例，提供了一种确定分子之间关系的方法，基于泛函映射矩阵来确定分子之间的相似性。
[0005]在本公开实施例的第一方面，提供了一种确定分子之间关系的方本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种确定分子之间关系的方法，包括：基于第一分子的表面黎曼流形上的拉普拉斯算符的本征函数，确定所述第一分子的第一化学特征；基于第二分子的表面黎曼流形上的拉普拉斯算符的本征函数，确定所述第二分子的第二化学特征；通过泛函映射，确定所述第一化学特征与所述第二化学特征之间的泛函映射矩阵；以及基于所述泛函映射矩阵，确定所述第一分子与所述第二分子之间的相似性。2.根据权利要求1所述的方法，还包括：确定所述第一分子的第一分子表面，所述第一分子表面为连续的黎曼流形且包括离散的多个第一表面节点；确定所述第二分子的第二分子表面，所述第二分子表面为连续的黎曼流形且包括离散的多个第二表面节点。3.根据权利要求2所述的方法，其中确定所述第一分子的第一分子表面包括：基于所述第一分子的电子密度场的等值面，确定所述第一分子表面；或者基于所述第一分子的溶剂可及表面或不可及表面的采样，确定所述第一分子表面。4.根据权利要求1所述的方法，其中确定第一化学特征包括：针对所述第一分子的表面黎曼流形上的多个第一表面节点中每个节点，通过将与所述节点关联的多个原子的原子信息映射到所述节点，得到所述节点的化学环境特征；基于所述多个第一表面节点中每个节点的化学环境特征，使用全连接神经网络，确定所述第一化学特征。5.根据权利要求4所述的方法，其中与所述节点关联的多个原子包括：与所述节点之间的距离低于距离阈值的范围内的多个原子；或者与所述节点最邻近的固定数量的多个原子。6.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一化学特征被表示为第一分子的表面黎曼流形上的拉普拉斯算符的本征函数的线性组合，所述第二化学特征被表示为第二分子的表面黎曼流形上的拉普拉斯算符的本征函数的线性组合。7.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述第一化学特征与所述第二化学特征之间的泛函映射矩阵包括：确定所述第一化学特征的第一系数矩阵；确定所...

【专利技术属性】
技术研发人员：王逸群，陈实，汪励颢，沈宇宁，
申请(专利权)人：脸萌有限公司，
类型：发明
国别省市：