急性淋巴细胞白血病DNA甲基化标志物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种急性淋巴性白血病DNA甲基化标志物及其应用，其包括基因：ARHGEF3，ATP7B，C14orf102，CoL2A1，LCP2，MAD1L1，MAPK1，LOC100134868，HTR7，BANP，LDLRAD4，NCAM2，PALM2

【技术实现步骤摘要】
急性淋巴细胞白血病DNA甲基化标志物及其应用


[0001]本专利技术涉及生物医药领域，特别是涉及一种急性淋巴细胞白血病DNA甲基化标志物及 其应用。

技术介绍

[0002]急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia，ALL)是淋巴母细胞异常增生引起 的恶性克隆性肿瘤，是最常见的发生于儿童的癌症，占儿童全部癌症的26％，占儿童急性白 血病的75％
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80％，其中B细胞急性淋巴细胞白血病在儿童所有ALL中占80％，是最为常见 的ALL类型。成人ALL患者的发病率较低，约占成人急性白血病的20％。
[0003]正常情况下，骨髓生成的血液干细胞，也叫免疫细胞，将会分化为成熟血细胞。血液干 细胞可转化为髓质干细胞和淋巴干细胞两种。其中髓质干细胞将分化为三种成熟血细胞，包 括载氧和其他底物到身体不同器官组织的红细胞；起凝血作用的血小板和抗外源感染和疾病 的粒细胞(白细胞)。髓质干细胞异常是急性髓性白血病(AML)的主要发病原因；淋巴干 细胞首先分化为淋巴母细胞，进而分化为机体生产抗体，抵御外援感染的B淋巴细胞和协助 B淋巴细胞产生抗体的T淋巴细胞，以及攻击肿瘤细胞和病毒的自然杀伤细胞。ALL白血病 患者大量干细胞转为淋巴母细胞、B淋巴细胞或T淋巴细胞，又称为白血病细胞，他们不能 有效的防御外源感染，导致血液和骨髓中白细胞，红细胞和血小板细胞数量降低，引发感染、 贫血或出血。对于绝大多数肿瘤，越早发现对于其后续的临床治疗越发简单，患者收益越高。 然而，到目前为止，世界上没有特殊的应用于急性淋巴性白血病的早期检测技术方法，白血 病常规检测为骨髓或血液样本显微镜检，通过白细胞等的大小、形状和其他特征对其进行鉴 定和分类，最主要的指标是血细胞是否成熟。ALL的确诊通常需要骨髓中至少20％的细胞为 幼稚细胞，正常情况下，幼稚细胞不超过骨髓细胞的5％。
[0004]另一方面，对于复发难治性白血病患者，存在治疗监测难和预后难等问题，复发治疗极 易产生药物抗性，治疗效果逐渐降低。患者用药缓解后微小残留病变(minimal residual disease， MRD)的检测已成为不同肿瘤临床治疗检测研究热点。白血病患者在经过治疗达到完全缓解 (CR)后，虽然用常规的形态学方法(放大100倍显微镜观察骨髓)不能检测到的明显的白 血病细胞，但体内可能仍然存留少量白血病残留细胞。即使用流式细胞学方法来检测，灵敏 度可以达到10
‑4‑
10
‑5(也就是1万～10万个细胞中可发现1个白血病细胞)，然而却无法检测 到更早期的出现细胞形态变化前的细胞。应用分子诊断学方法可以发现更早期的具有基因变 异或基因表达差异的白血病细胞，目前临床检测的分子标志物主要集中在细胞遗传学异常， 如融合基因和点突变等。但是携带此类细胞遗传学异常和突变异常的患者仅仅占患病人群的 一部分。鉴于白血病的复杂性，寻找可用于精确诊断和预后分层的分子标志物具有重要意义。
[0005]国内外大量研究表明，DNA甲基化的异常调控贯穿于肿瘤的发生、发展和预后。血浆游 离DNA甲基化不仅与早期肿瘤发生密切相关，而且可分辨组织源性(PMID:29035356、 PMID:26392541)。不同基因DNA甲基化分子标志物组合也陆续应用于肿瘤筛查，特别是 泛
癌症的早期诊断(CN 111742062A、CN 109680060A)。在血液病方面，公开专利技术专利 (CN111647661A)通过一组特异性基因元件CYP26C1
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DMR，DGKG
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DMR，WT1
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DMR和 TRIM40
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DMR的甲基化信息，建立了一种辅助诊断急性髓性白血病的方法，发现AML患者 甲基化水平要明显高于正常人，通过logistic回归模型p值判定患者是否发病。此外，公开专 利申请(CN 111411157A)和(CN109852672A)分别通过全基因组甲基化和全基因组CpG 位点甲基化捕获测序发现DNA甲基化在幼年型粒单核细胞白血病和急性髓系白血病预后方 面呈现一定的特异性。然而在急性淋巴细胞白血病诊断、治疗以及微小残留病变(MRD)监 测方面，DNA甲基化检测分子标志物的鉴定临床意义重大，然而研究相对有限。

技术实现思路

[0006]基于此，本专利技术的目的之一在于提供一种用于急性淋巴细胞白血病检测的DNA甲基化 标志物或其组合。
[0007]实现上述目的的技术方案如下：
[0008]一种用于急性淋巴细胞白血病检测的DNA甲基化标志物或其组合，其特征在于，所述 DNA甲基化标志物选自基因ARHGEF3，ATP7B，C14orf102，CoL2A1，LCP2，MAD1L1， MAPK1，LOC100134868，HTR7，BANP，LDLRAD4，NCAM2，PALM2
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AKAP2，RRBP1 和SPPL2B，PFKP，PRDM8，和PRDM16中的至少一种；所述ARHGEF3的序列如SEQ IDNO.1或其互补序列所示，所述ATP7B的序列如SEQ ID NO.2或其互补序列所示，所述 C14orf102的序列如SEQ ID NO.4或其互补序列所示，所述LDLRAD4的序列如SEQ IDNO.5
‑
SEQ ID NO.6或SEQ ID NO.5
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SEQ ID NO.6互补序列中任一一种所示，所述CoL2A1的 序列如SEQ ID NO.7所示，所述HTR7的序列如SEQ ID NO.8所示，所述LCP2的序列如SEQID NO.9或其互补序列所示，所述NCAM2的序列如SEQ ID NO.15或其互补序列所示，所述 BANP的序列如SEQ ID NO.3或其互补序列所示，所述LOC100134868的序列如SEQ IDNO.10或其互补序列所示，所述MAD1L1的序列如SEQ ID NO.11或其互补序列所示，所述 MAPK1的序列如SEQ ID NO.12
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SEQ ID NO.14或SEQ ID NO.12
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SEQ ID NO.14互补序列中 任一一种所示，所述PALM2
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AKAP2的序列如SEQ ID NO.16
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SEQ ID NO.17或SEQ IDNO.16
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SEQ ID NO.17互补序列中任一一种所示，所述RRBP1的序列如SEQ ID NO.22或其互 补序列所示，所述SPPL2B的序列如SEQ ID NO.23
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SEQ ID NO.24或SEQ ID NO.23
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SEQ IDNO.24互补序列中任一一种所示；所述PFKP的序列如SEQ ID NO.18或其互补序列所示；所 述PRDM16的序列如SEQ ID NO.19
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SEQ ID NO.20或SEQ ID NO.19
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SEQ ID NO.20本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于急性淋巴细胞白血病检测的DNA甲基化标志物或其组合，其特征在于，所述DNA甲基化标志物选自基因ARHGEF3，ATP7B，C14orf102，CoL2A1，LCP2，MAD1L1，MAPK1，LOC100134868，HTR7，BANP，LDLRAD4，NCAM2，PALM2
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AKAP2，RRBP1和SPPL2B，PFKP，PRDM8，和PRDM16中的至少一种；所述ARHGEF3的序列如SEQ ID NO.1或其互补序列所示，所述ATP7B的序列如SEQ ID NO.2或其互补序列所示，所述C14orf102的序列如SEQ ID NO.4或其互补序列所示，所述LDLRAD4的序列如SEQ ID NO.5
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SEQ ID NO.6或SEQ ID NO.5
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SEQ ID NO.6互补序列中任一一种所示，所述CoL2A1的序列如SEQ ID NO.7所示，所述HTR7的序列如SEQ ID NO.8所示，所述LCP2的序列如SEQ ID NO.9或其互补序列所示，所述NCAM2的序列如SEQ ID NO.15或其互补序列所示，所述BANP的序列如SEQ ID NO.3或其互补序列所示，所述LOC100134868的序列如SEQ ID NO.10或其互补序列所示，所述MAD1L1的序列如SEQ ID NO.11或其互补序列所示，所述MAPK1的序列如SEQ ID NO.12
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SEQ ID NO.14或SEQ ID NO.12
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SEQ ID NO.14互补序列中任一一种所示，所述PALM2
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AKAP2的序列如SEQ ID NO.16
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SEQ ID NO.17或SEQ ID NO.16
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SEQ ID NO.17互补序列中任一一种所示，所述RRBP1的序列如SEQ ID NO.22或其互补序列所示，所述SPPL2B的序列如SEQ ID NO.23
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SEQ ID NO.24或SEQ ID NO.23
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SEQ ID NO.24互补序列中任一一种所示；所述PFKP的序列如SEQ ID NO.18或其互补序列所示；所述PRDM16的序列如SEQ ID NO.19
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SEQ ID NO.20或SEQ ID NO.19
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SEQ ID NO.20互补序列中任一一种所示；所述PRDM8的序列如SEQ ID NO.21或其互补序列所示。2.根据权利要求1所述DNA甲基化标志物或其组合，其特征在于，所述DNA甲基化标志物组合包括选自SEQ ID NO.2或其互补序列，SEQ ID NO.18或其互补序列的任意至少一种。3.根据权利要求1
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2任一项所述DNA甲基化标志物或其组合，其特征在于，所述DNA甲基化标志物组合包括选自SEQ ID NO.3或其互补序列，SEQ ID NO.21或其互补序列的任意至少一种。4.根据权利要求3所述DNA甲基化标志物或其组合，其特征在于，所述DNA甲基化标志物组合包括选自SEQ ID NO.1
‑
SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.1
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SEQ ID NO.2的完全互补序列，SEQ ID NO.4
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SEQ ID NO.9或SEQ ID NO.4
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SEQ ID NO.9的完全互补序列，SEQ ID NO.15或其互补序列和SEQ ID NO.18或其互补序列；和/或，所述DNA甲基化标志物组合包括选自SEQ ID NO.3或其互补序列，SEQ ID NO.10
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SEQ ID NO.14或SEQ ID NO.10
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SEQ ID NO.14的完全互补序列，SEQ ID NO.16
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SEQ ID NO.17或SEQ ID NO.16
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SEQ ID NO.17的完全互补序列，和SEQ ID NO.19
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SEQ ID NO.24或SEQ ID NO.19
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SEQ ID NO.24的完全互补序列。5.根据权利要求4所述DNA甲基化标志物组合，其特征在于，所述DNA甲基化标志物组合包括SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.24所示序列或SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.24的完全互补序列。6.权利要求1
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5任一项所述DNA甲基化标志物或其组合在制备检测、分类或预测、治疗监测、预后或其它评价急性淋巴细胞白血病的试剂盒中的应用。7.一种急性淋巴细胞白血病检测试剂盒，其特征在于，包括检测权利要求1
‑
5任一项所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：权利要求书三页说明书一四页序列表一七页附图三页，
申请(专利权)人：奚永志，
类型：发明
国别省市：