表达C-KIT突变的细胞及其用途制造技术

本公开提供用于增强对癌症和病原体的免疫应答的方法和组合物。本公开的主题提供用于增强对癌症和病原体的免疫应答的方法和组合物。它涉及包含c

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】表达C
‑
KIT突变的细胞及其用途
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2019年12月3日提交的美国临时申请第62/943,032号的优先权，将其全部内容并入本文以供参考，并要求其优先权。
[0003]序列表
[0004]本申请包含序列表，该序列表已通过EFS
‑
Web以ASCII格式提交，并且全部并入本文以供参考。所述ASCII副本创建于2020年12月3日，命名为0727341174_ST25，大小为57,790字节。


[0005]本公开的主题提供用于增强对癌症和病原体的免疫应答的方法和组合物。它涉及包含c
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Kit突变体例如包含激活突变的c
‑
Kit突变体的细胞。该细胞还可以包含抗原识别受体(例如，嵌合抗原受体(CAR)或T细胞受体(TCR))。本公开的主题涉及使用细胞进行治疗，例如治疗癌症。

技术介绍

[0006]基于细胞的免疫疗法是一种具有治愈潜力的癌症治疗方法。通过引入编码天然或修饰的T细胞受体(TCR)或对于所选抗原具有特异性的称为嵌合抗原受体(CAR)的抗原的合成受体的遗传物质，可以修饰T细胞和其它免疫细胞以靶向肿瘤抗原。患者工程化的CAR T细胞已显示出对一系列液体和固体恶性肿瘤疗效显著。
[0007]处于临床和临床前开发阶段的CAR主要使用共刺激结构域比如CD28或4
‑
1BB。这些CAR的持久性，尤其是功能持久性已被证明与更好的收益有关。与现有的CAR相比，存在对于具有增强的增殖和持久性而没有共刺激结构域和/或具有改进的效率和活性的改进的CAR的未满足需求。

技术实现思路

[0008]本公开的主题提供细胞，其包含：(a)与抗原结合的抗原识别受体，和(b)人c
‑
Kit的突变体。在某些实施方式中，c
‑
Kit突变体包含激活突变。
[0009]在某些实施方式中，c
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Kit是人c
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Kit。在某些实施方式中，激活突变在人c
‑
Kit的细胞内区域内。在某些实施方式中，细胞内区域包含人c
‑
Kit的氨基酸544至977。
[0010]在某些实施方式中，激活突变在人c
‑
Kit的氨基酸816至826内。在某些实施方式中，激活突变在氨基酸位置816或氨基酸位置822处。
[0011]在某些实施方式中，激活突变在人c
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Kit的氨基酸550至570内。在某些实施方式中，激活突变在人c
‑
Kit的氨基酸位置560处。
[0012]在某些实施方式中，激活突变选自D816V、D816Y、D816H、D816F、N822K、V560G、或其组合。在某些实施方式中，激活突变包含D816V或由D816V组成。
[0013]在某些实施方式中，人c
‑
Kit包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列或由SEQ ID NO:
1所示的氨基酸序列组成。
[0014]在某些实施方式中，突变体包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列或其部分或由SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列或其部分组成。在某些实施方式中，突变体由SEQ ID NO:2的氨基酸543至976组成。
[0015]在某些实施方式中，c
‑
Kit突变体与诱导型启动子可操作地连接。在某些实施方式中，诱导型启动子选自活化T细胞核因子(NFAT)、转录应答元件(TRE)启动子、CD69启动子、CD25启动子和IL
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2启动子。
[0016]在某些实施方式中，c
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Kit突变体增强细胞的细胞持久性。在某些实施方式中，c
‑
Kit突变体减少细胞的凋亡或无反应性。
[0017]在某些实施方式中，抗原识别受体是外源的或内源的。在某些实施方式中，抗原识别受体是重组表达的。在某些实施方式中，抗原识别受体由载体表达。在某些实施方式中，c
‑
Kit突变体由载体表达。
[0018]在某些实施方式中，细胞是免疫应答细胞。在某些实施方式中，细胞是淋巴谱系的细胞或骨髓谱系的细胞。在某些实施方式中，淋巴谱系的细胞选自T细胞、B细胞、自然杀伤(NK)细胞、树突状细胞。在某些实施方式中，细胞是T细胞。在某些实施方式中，T细胞是细胞毒性T淋巴细胞(CTL)、γδT细胞、肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)、调节性T细胞或自然杀伤T(NKT)细胞。
[0019]在某些实施方式中，抗原是肿瘤抗原或病原体抗原。在某些实施方式中，抗原是肿瘤抗原。在某些实施方式中，肿瘤抗原选自间皮素、CD19、MUC16、MUC1、CAIX、CEA、CD8、CD7、CD10、CD20、CD22、CD30、CLL1、CD33、CD34、CD38、CD41、CD44、CD49f、CD56、CD74、CD133、CD138、EGP
‑
2、EGP
‑
40、EpCAM、Erb
‑
B2、Erb
‑
B3、Erb
‑
B4、FBP、胎儿乙酰胆碱受体、叶酸受体
‑
α、GD2、GD3、HER
‑
2、hTERT、IL
‑
13R
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a2、κ
‑
轻链、KDR、LeY、L1细胞粘附分子、MAGE
‑
A1、ERBB2、MAGEA3、CT83(也称为KK
‑
LC
‑
1)、p53、MART1、GP100、蛋白酶3(PR1)、酪氨酸酶、存活素、hTERT、EphA2、NKG2D配体、NY
‑
ESO
‑
1、癌胎儿抗原(h5T4)、PSCA、PSMA、ROR1、TAG
‑
72、VEGF
‑
R2、WT
‑
1、BCMA、CD123、CD44V6、NKCS1、EGF1R、EGFR
‑
VIII和CD99、CD70、ADGRE2、CCR1、LILRB2、PRAME、HPV E6癌蛋白、HPV E7癌蛋白和ERBB。在某些实施方式中，抗原是间皮素。
[0020]在某些实施方式中，抗原识别受体选自T细胞受体(TCR)、嵌合抗原受体(CAR)和TCR样融合分子。在某些实施方式中，抗原识别受体是CAR。在某些实施方式中，CAR包含细胞外抗原结合结构域、跨膜结构域和细胞内信号传导结构域。在某些实施方式中，CAR的细胞内信号传导结构域还包含至少一个共刺激信号传导区。在某些实施方式中，至少一个共刺激信号传导区包含CD28多肽。在某些实施方式中，CAR不包含共刺激信号传导区。
[0021]此外，本公开提供用于产生抗原特异性细胞的方法。在某些实施方式中，该方法包本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种细胞，其包含：(a)与抗原结合的抗原识别受体，和(b)包含激活突变的c
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Kit突变体。2.根据权利要求1所述的细胞，其中所述c
‑
Kit是人c
‑
Kit。3.根据权利要求2所述的细胞，其中所述激活突变在人c
‑
Kit的细胞内区域内。4.根据权利要求3所述的细胞，其中所述细胞内区域包含人c
‑
Kit的氨基酸544至977。5.根据权利要求2
‑
4中任一项所述的细胞，其中所述激活突变在人c
‑
Kit的氨基酸816至826内。6.根据权利要求2
‑
5中任一项所述的细胞，其中所述激活突变在氨基酸位置816或氨基酸位置822处。7.根据权利要求2
‑
4中任一项所述的细胞，其中所述激活突变在人c
‑
Kit的氨基酸550至570内。8.根据权利要求2
‑
4和7中任一项所述的细胞，其中所述激活突变在人c
‑
Kit的氨基酸位置560处。9.根据权利要求2
‑
4所述的细胞，其中所述激活突变选自D816V、D816Y、D816H、D816F、N822K、V560G、或其组合。10.根据权利要求2
‑
4和9中任一项所述的细胞，其中所述激活突变包含D816V或由D816V组成。11.根据权利要求2
‑
10中任一项所述的细胞，其中所述人c
‑
Kit包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列或由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列组成。12.根据权利要求1
‑
11中任一项所述的细胞，其中所述突变体包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列或其部分或由SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列或其部分组成。13.根据权利要求1
‑
12中任一项所述的细胞，其中所述突变体由SEQ ID NO:2的氨基酸543至976组成。14.根据权利要求1
‑
13中任一项所述的细胞，其中所述c
‑
Kit突变体与诱导型启动子可操作地连接。15.根据权利要求14所述的细胞，其中所述诱导型启动子选自活化T细胞核因子(NFAT)、转录应答元件(TRE)启动子、CD69启动子、CD25启动子和IL
‑
2启动子。16.根据权利要求1
‑
15中任一项所述的细胞，其中所述c
‑
Kit突变体增强所述细胞的细胞持久性。17.根据权利要求1
‑
16中任一项所述的细胞，其中所述c
‑
Kit突变体减少所述细胞的细胞凋亡或无反应性。18.根据权利要求1
‑
17中任一项所述的细胞，其中所述抗原识别受体是外源性的或内源性的。19.根据权利要求1
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18中任一项所述的细胞，其中所述抗原识别受体是重组表达的。20.根据权利要求1
‑
19中任一项所述的细胞，其中所述抗原识别受体由载体表达。21.根据权利要求1
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20中任一项所述的细胞，其中所述c
‑
Kit突变体由载体表达。22.根据权利要求1
‑
21中任一项所述的细胞，其中所述细胞是免疫应答细胞。23.根据权利要求1
‑
22中任一项所述的细胞，其中所述细胞是淋巴谱系的细胞或骨髓
谱系的细胞。24.根据权利要求23所述的细胞，其中所述淋巴谱系的细胞选自T细胞、B细胞、自然杀伤(NK)细胞、树突状细胞。25.根据权利要求1
‑
24中任一项所述的细胞，其中所述细胞是T细胞。26.根据权利要求24或25所述的细胞，其中所述T细胞是细胞毒性T淋巴细胞(CTL)、γδT细胞、肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)、调节性T细胞或自然杀伤T(NKT)细胞。27.根据权利要求1
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26中任一项所述的细胞，其中所述抗原是肿瘤抗原或病原体抗原。28.根据权利要求1
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27中任一项所述的细胞，其中所述抗原是肿瘤抗原。29.根据权利要求28所述的细胞，其中所述肿瘤抗原选自间皮素、CD19、MUC16、MUC1、CAIX、CEA、CD8、CD7、CD10、CD20、CD22、CD30、CLL1、CD33、CD34、CD38、CD41、CD44、CD49f、CD56、CD74、CD133、CD138、EGP
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2、EGP
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40、EpCAM、Erb
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B2、erb
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B3、Erb
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B4、FBP、胎儿乙酰胆碱受体、叶酸受体
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a、GD2、GD3、HER
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2、hTERT、IL
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13R
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a2、K
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轻链、KDR、LeY、L1细胞粘附分子、MAGE
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A1、ERBB2、MAGEA3、CT83(也称为KK
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LC
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1)、p53、MART1、GP100、蛋白酶3(PR1)、酪氨酸酶、存活素、hTERT、EphA2、NKG2D配体、NY
‑
ESO
‑
1、癌胎儿抗原(h5T4)、PSCA、PSMA、ROR1、TAG
‑
72、VEGF
‑
R2、WT
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1、BCMA、CD123、CD44V6、NKCS1、EGF1R、EGFR
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VIII、CD99、CD70、ADGRE2、CCR1、LILRB2、PRAME、HPV E6癌蛋白、HPV E7癌蛋白和ERBB。30.根据权利要求29所述的细胞，其中所述抗原是间皮素。31.根据权利要求1
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30中...

【专利技术属性】
技术研发人员：P，
申请(专利权)人：斯隆凯特琳癌症研究协会癌症与相关疾病纪念医院，
类型：发明
国别省市：