一种基于KRAS突变结肠癌基因的预后模型的建立方法技术

本发明专利技术公开了一种基于KRAS突变结肠癌基因的预后模型的建立方法，属于预后模型的技术领域，包括以下步骤：S1：数据采集与预处理：获取样本的矩阵数据及相应的临床信息；S2：预后模型构建：基于获取的数据，进行单因素Cox分析，采用LASSO

【技术实现步骤摘要】
一种基于KRAS突变结肠癌基因的预后模型的建立方法


[0001]本专利技术是关于预后模型的
，特别是关于一种基于KRAS突变结肠癌基因的预后模型的建立方法。

技术介绍

[0002]结肠癌是一种常见的恶性肿瘤，根据国际癌症研究机构(InternationalAgency for Research on cancer,IARC)报告的癌症统计数据，2020年全球CRC 新发病例超过190万，死亡病例90万，CRC已成为全球癌症死亡的第二大原因。目前，粪便潜血检查 (FOBT)、粪便免疫化学检查(FIT)、软性乙状结肠镜检查(FS)等方法已被开发用于早期诊断，有助于提高结直肠癌的预后。即便如此，许多结直肠癌患者在晚期才被诊断出来。因此，CRC患者的预后仍然较差。
[0003]Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)突变是多种肿瘤发生的驱动因素。 KRAS基因突变占所有结肠病例的40％，其作为结肠癌分子靶向治疗药物—西妥昔单抗选择的重要治疗预测标志物；然而，KRAS基因突变是否能作为结肠癌的预后标志物？肿瘤学界仍然争论不休；一些回顾性本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于KRAS突变结肠癌基因的预后模型的建立方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：数据采集与预处理：获取样本的矩阵数据及相应的临床信息；S2：预后模型构建：基于获取的数据，进行单因素Cox分析，采用LASSO
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COX回归建立预后模型；S3：KRAS突变状态预测：使用随机森林算法对GEO队列中的KRAS突变状态进行估计；S4：预后模型评估：分别使用内部验证和外部验证对建立的预后模型进行评估。2.如权利要求1所述的基于KRAS突变结肠癌基因的预后模型的建立方法，其特征在于，所述矩阵数据共包括5个COAD数据集，分别为3个微阵列数据集和2个RNA
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seq数据集；3个微阵列数据集分别为GSE41258数据集、GSE39582数据集和GSE17536数据集；2个RNA
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seq数据集包括TCGA
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COAD队列和CPTAC
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COAD队列。3.如权利要求2所述的基于KRAS突变结肠癌基因的预后模型的建立方法，其特征在于，步骤S2包括以下具体的步骤：S201：将GSE39582中的KRAS突变样本随机化到训练集和测试集；S202：采用最小绝对收缩和选择算子建立预后模型，并利用训练集中的“glmnet”R包...

【专利技术属性】
技术研发人员：张鹤，董伟伟，赵慧霞，胡琰琰，杨静文，张丰云，曾志艳，李秋文，肖文华，
申请(专利权)人：中国人民解放军总医院第四医学中心，
类型：发明
国别省市：