一种改进的基于CRISPR技术检测靶核酸的方法技术

技术编号:34905909 阅读:97 留言:0更新日期:2022-09-15 06:51
本发明专利技术提供了一种改进的基于CRISPR技术检测靶核酸的方法,具体地提供了一种改进的基于CRISPR技术检测样品中靶核酸的方法,所述靶核酸具有5

【技术实现步骤摘要】
一种改进的基于CRISPR技术检测靶核酸的方法


[0001]本专利技术涉及核酸检测领域,具体地,涉及一种改进的基于CRISPR技术检测靶核酸的方法,尤其涉及一种改进的基于CRISPR技术检测靶核酸的方法、系统和试剂盒。

技术介绍

[0002]特异性检测核酸分子(Nucleic acid detection)方法具有重要的应用价值,例如病原体的检测,遗传病检测等。在病原体检测方面,由于每种病原体微生物都有其独一无二的特征核酸分子序列,因此可以开发出针对特定物种的核酸分子检测,也称为核酸诊断(NADs,nucleic acid diagnostics),在食品安全、环境微生物污染检测,人体病原菌感染等领域具有重要义。
[0003]目前建立的特异性核酸分子检测通常需要分为两步,第一步是目的核酸的扩增,第二步是目的核酸检测。现有检测技术包括限制性核酸内切酶方法、Southern、Northern、斑点杂交、荧光PCR检测技术、LAMP环介导等温扩增技术、重组酶聚合酶扩增技术(RPA)等方法。2012年之后,CRISPR基因编辑技术兴起,张锋团队本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种改进的基于CRISPR技术检测样品中靶核酸的方法,所述靶核酸为RNA,所述靶核酸具有5

至3

端依次连接的第一区段和第二区段,所述方法包括将样品与Cas12b、经改造的tracrRNA、DNA和单链核酸检测器接触;所述DNA能够与所述靶核酸的第二区段杂交;所述经改造的tracrRNA根据能够与Cas12b相互作用的野生型tracrRNA和crRNA所形成的复合结构进行改造,以使得所述经改造的tracrRNA的3

端可以和所述靶核酸的第一区段互补配对从而形成类似野生型tracrRNA和crRNA互补配对所形成的复合结构以指导Cas12b靶向所述DNA;检测由所述Cas12b切割单链核酸检测器产生的可检测信号,从而检测所述靶核酸。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述DNA为ssDNA或dsDNA。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述经改造的tracrRNA可以通过转录得到,也可以直接通过合成得到。4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述可检测信号通过以下方式实现:基于视觉的检测,基于传感器的检测,颜色检测,基于试纸条的检测,基于金纳米颗粒的检测,荧光偏振,荧光信号,胶体相变/分散,电化学检测,或者,基于半导体的检测。5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述样品为来源于病毒、细菌、微生物、土壤、水源、人体、非人动物或植物的样品。6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述靶核酸来源于病毒、细菌、微生物、土壤、水源、人体、非人动物或植物等样品。优选的,所述靶核酸为病毒核酸、细菌核酸、与疾病相关的特异核酸。7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述靶核酸选自样品中天然存在的RNA,以及对样品的DNA进行转录得到的RNA。8.一种用于检测样品中靶核酸的系统或组合物或试剂盒,所述靶核酸为RNA,所述靶核酸具有5

至3

端依次连接的第一区段和第二区段,所述系统或组合物或试剂盒包括权利要求1

7任一权利要求中所述的Cas12b、经改造的tracrRNA、DNA和单链核酸检测器。9.权利要求8所述的系统或组合物或试剂盒在检测样品中靶核酸的应用,所述靶核酸为RNA。10.权利要求8所述的系统或组合物在制备检测样品中靶核酸的试剂或试剂盒中的应用,所述靶核酸为RNA。11.一种改进的检测样品中靶核酸的方法,所述靶核酸具有5

【专利技术属性】
技术研发人员:梁亚峰
申请(专利权)人:山东舜丰生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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