与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络制造技术

技术编号:34852685 阅读:12 留言:0更新日期:2022-09-08 07:53
本发明专利技术公开了一种与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络,通过对正常组、慢性不可预测温和应激组和CUMS+豆腐果苷组大鼠海马组织进行全转录组RNA测序,对测序结果进行差异lncRNAs和mRNAs表达分析,筛选差异表达的关键基因;通过对lncRNA靶基因和差异表达基因进行GO和KEGG的富集化分析得到关键基因及其相关的lncRNAs,使用TargetScan和miRanda数据库预测与lncRNAs及其mRNAs有结合可能性及结合位点的miRNAs;通过分子生物学技术验证与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络:lncRNA

【技术实现步骤摘要】
与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络


[0001]本专利技术属于医药
,尤其涉及一种与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)调控网络及其构建方法与应用。

技术介绍

[0002]抑郁症是社会

心理

生物因素相互作用诱发的一种严重危害人类身心健康的常见神经、精神类疾病,具有患病率高、易复发和高自杀率等特点。伴随着现代社会高节奏、高压力的生活趋势,抑郁症发病率呈逐年上升趋势,并有明显的复发倾向或趋于慢性化。
[0003]抑郁症的具体发病机制目前尚不明确,迄今有很多假说,如单胺类神经递质及其受体假说、神经内分泌假说、神经营养再生假说、炎症假说、表观遗传学机制等,各种生物学因素以总体模式相互作用,导致抑郁症的发生。
[0004]豆腐果苷(helicid)即4

甲酰苯基

β

D

吡喃阿洛糖苷(4

formylphenyl

β

D

allopyranoside)是从我国云南景颇族药山龙眼科植物萝卜树(Helicia nilagirica Beed,异名Helicia erratica Hook)的果实中提取出的有效成分,其分子式为:Cl3H
16
O7;分子量为:284.26;熔点:199~200℃,毒性极低,安全性好,可恢复大脑皮层兴奋与抑制过程间的平衡失调,具有较好的镇静、安眠和镇痛作用,目前临床广泛用于缓解神经官能症的头疼、头昏及睡眠障碍,辅助治疗原发性头疼。
[0005]神经毒理学与畸形学研究结果表明,1350mg/kg的豆腐果苷灌胃给药后,不影响大鼠后代早期神经系统发育、神经行为功能或脑组织学。豆腐果苷因其镇静、镇痛、催眠、抗抑郁、低毒等作用而备受关注。豆腐果苷的神经保护作用涉及细胞兴奋毒性、一氧化氮系统、神经胶质细胞、生物膜、氧化性神经毒性和细胞凋亡等。研究发现豆腐果苷可以抑制胆碱酯酶活性。在整个大脑和突触结构中,豆腐果苷可以减少谷氨酰胺的增加,升高全脑γ

氨基丁酸(γ

aminobutyric acid,GABA)/谷氨酸(glutamic acid,Glu)比值,抑制全脑谷氨酰胺合成酶的活性,维持中枢神经系统兴奋与抑制平衡。豆腐果苷衍生物4

羟基苯甲醛是一种有效的抗氧化剂和GABA转氨酶抑制剂。在采用部分坐骨神经结扎(partial sciatic nerve ligation,PSNL)产生神经痛样模型小鼠中,豆腐果苷可降低PSNL小鼠下丘脑腹外侧视前区c

Fos表达,有效恢复降低的机械阈值,增加深睡期的睡眠,且剂量依赖性强,提示豆腐果苷是治疗神经性疼痛和睡眠障碍的有效药物。豆腐果苷可明显逆转小鼠自主活动减少及蔗糖偏嗜度降低,改善慢性应激小鼠的抑郁样行为。
[0006]人类基因组测序结果分析表明,全基因组中能够编码蛋白质的DNA仅占有很少一部分,绝大部分为不编码蛋白质的DNA,这些DNA转录形成的产物即为非编码RNA。非编码RNA(包含microRNA和long no

coding RNA(lncRNA))在细胞分化和代谢等生命活动中扮演着举足轻重的作用。lncRNA与miRNA之间可通过相互调控来影响抑郁症的发生发展。由于多数lncRNA的结构与mRNA具有一定的相似性,提示lncRNA通过与miRNA竞争结合靶基因mRNA的3'

UTR,间接抑制miRNA对靶基因的负向调控。而lncRNA

miRNA

mRNA三者调控机制即为ceRNA网络。

技术实现思路

[0007]本专利技术的首要目的在于提供一种与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)调控网络。
[0008]本专利技术的再一目的在于提供上述调控网络的构建方法。
[0009]本专利技术的另一目的在于提供上述调控网络在制备用于对抑郁症进行筛查、诊断或预后的工具以及筛选防治抑郁症靶向药物中的应用。
[0010]本专利技术是这样实现的,与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络,该调控网络为lncRNA

Gnl3l/miR

128

3p/Prim1;其中,lncRNA

Gnl3l来源于NONCODE数据库,miR

128

3p来源于miRbase数据库,Prim1来源于NCBI数据库。
[0011]本专利技术进一步公开了上述内源竞争RNA调控网络的构建方法,该方法包括以下步骤:
[0012](1)通过对正常组、慢性不可预测温和应激组(chronic unpredictable mild stress,CUMS)和CUMS+豆腐果苷组大鼠海马组织进行全转录组RNA测序,对测序结果进行差异lncRNAs和mRNAs表达分析,筛选差异表达的关键基因;
[0013](2)通过对lncRNA靶基因和差异表达基因进行GO和KEGG的富集化分析得到关键基因及其相关的lncRNAs,使用TargetScan和miRanda数据库预测与lncRNAs及其mRNAs有结合可能性及结合位点的miRNAs;
[0014](3)通过分子生物学技术验证与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)调控网络。
[0015]本专利技术进一步公开了上述内源竞争RNA调控网络在制备用于对抑郁症进行筛查、诊断或预后的工具中的应用。
[0016]优选地,所述工具包括试剂盒、试纸、芯片或高通量测序平台。
[0017]优选地,所述试剂盒、试纸、芯片或高通量测序平台包括用于检测内源竞争RNA调控网络的引物或探针。
[0018]本专利技术进一步公开了上述内源竞争RNA调控网络在筛选防治抑郁症靶向药物中的应用。
[0019]本专利技术克服现有技术的不足,提供一种与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)调控网络及其构建方法与应用,本专利技术具体涉及一种天然植物药豆腐果苷在防治抑郁症中ceRNA网络的构建方法,实施例展示了通过此方法找出豆腐果苷干预下显著相关的ceRNA调控网络:lncRNA

Gnl3l/miR

128

3p/Prim1。并采用分子生物学手段验证了豆腐果苷对该ceRNA网络的调控以及三者的靶向互作关系。
[0020]相比于现有技术的缺点和不足,本专利技术具有以下有益效果:lncR本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络,其特征在于,该调控网络为lncRNA

Gnl3l/miR

128

3p/Prim1。2.权利要求1所述的内源竞争RNA调控网络的构建方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:(1)通过对正常组、慢性不可预测温和应激组和CUMS+豆腐果苷组大鼠海马组织进行全转录组RNA测序,对测序结果进行差异lncRNAs和mRNAs表达分析,筛选差异表达的关键基因;(2)通过对lncRNA靶基因和差异表达基因进行GO和KEGG的富集化分析得到关键基因及其相关的lncRNAs...

【专利技术属性】
技术研发人员:童九翠张远张袁祥张晓彤蒋臻熠蒋澜钟正灵杨斌
申请(专利权)人:皖南医学院第一附属医院皖南医学院弋矶山医院
类型:发明
国别省市:

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