【技术实现步骤摘要】
一种多层级的阴道微生态评估体系构建方法和装置
[0001]本专利技术涉及微生态数据分析与处理技术,特别是涉及到一种多层级的阴道微生态评估体系构建方法和装置。
技术介绍
[0002]阴道微生态是一个复杂的生态系统,由微生物、内分泌调节系统等组成,具有多样性、稳定性和动态性。阴道菌群是阴道微生态的核心组分和影响微生态平衡的主要因素,具有种类多,数量大,互作强的特点。阴道炎多由阴道微生态失衡造成,阴道微生态评估是衡量阴道健康水平和修复微生态失衡的必要环节,也是阴道微生态数据分析的主要内容,对维护女性生殖健康具有重要意义。
[0003]目前的阴道微生态评估主要通过显微镜观察、细菌培养和代谢物检测手段,从细菌数量、细菌种类、优势菌、病原菌及细菌功能等方面进行评估。常用的阴道微生态评估形态学指标包括菌群密集度、多样性、优势菌和病原微生物,功能学指标包括阴道pH值、H2O2浓度、白细胞酯酶等。此外还有一些专项疾病评分系统,如细菌性阴道病的Nugent评分。这些阴道微生态评估方法在阴道微生态数据分析中发挥了重要作用,也推动了阴道微生态的研究进展,但实际工作中还存在细菌培养结果和阴道微生态评价不一致的情况,以及阴道炎容易复发和耐药的现象。这说明现有的阴道微生态评价内容还不够全面,对阴道微生态的发展变化,特别是菌群变化及细菌互作变化尚缺乏系统深入地分析,这不利于优化微生态分析策略和准确评估微生态状况,因此需要补充和完善阴道微生态评估,开发多层级的阴道微生态评估体系构建方法和装置。
技术实现思路
[0004]为了解 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种多层级的阴道微生态评估体系构建方法,其特征在于,所述方法包括步骤:A、根据多个阴道微生态中多个样本的核糖体核糖核酸测序结果,获取各个样本的操作分类单元数据,确定不同阴道微生态中的标志菌,以及确定不同阴道微生态转换时的预警菌,作为多个阴道微生态中的细菌分布评估标准;B、对于多个阴道微生态中多个样本,确定各个样本的细菌表达指数,作为多个阴道微生态中的细菌表达指数评估标准;C、对于多个阴道微生态中多个样本中的多种细菌,确定每种细菌操作分类单元数据与细菌表达指数之间的关系,作为多个阴道微生态中的细菌生长趋势评估标准;D、对于多个阴道微生态中多个样本中的多种细菌,确定多个阴道微生态中不同细菌的独立丰度和互作丰度,作为多个阴道微生态中的细菌互作差异评估标准;E、对于多个阴道微生态中多个样本中的多种细菌,构建整体细菌网络,检验不同阴道微生态中的整体细菌网络差异,作为多个阴道微生态中的整体细菌网络评估标准;F、整合多个阴道微生态中的细菌分布评估标准、多个阴道微生态中的细菌表达指数评估标准、多个阴道微生态中的细菌生长趋势评估标准、多个阴道微生态中的细菌互作差异评估标准和多个阴道微生态中的整体细菌网络评估标准,构建多层级的阴道微生态评估体系。2.根据权利要求1中所述的多层级的阴道微生态评估体系构建方法,其特征在于,根据多个阴道微生态中多个样本的核糖体核糖核酸测序结果,获取各个样本的操作分类单元数据,确定不同阴道微生态中的标志菌,以及确定不同阴道微生态转换时的预警菌包括:根据样本所处的阴道微生态,计算各个阴道微生态所含样本的细菌种类、丰度和占比,确定不同阴道微生态中的标志菌;比较不同阴道微生态中各种细菌的丰度和占比变化,将阴道微生态中丰度和占比变化最显著的一种或多种细菌,确定为不同阴道微生态转换时的预警菌。3.根据权利要求1中所述的多层级的阴道微生态评估体系构建方法,其特征在于,对于多个阴道微生态中多个样本,确定各个样本的细菌表达指数,作为多个阴道微生态中的细菌表达指数评估标准包括:将每个样本所含细菌的操作分类单元数据加和取对数,作为该样本的细菌表达指数,将多个样本的细菌表达指数加和求平均,获得不同阴道微生态的细菌表达指数;利用威尔科克森检验不同阴道微生态的细菌表达指数的统计学差异,作为多个阴道微生态中的细菌表达指数评估标准。4.根据权利要求3中所述的多层级的阴道微生态评估体系构建方法,其特征在于,对于多个阴道微生态中多个样本中的多种细菌,确定每种细菌操作分类单元数据与细菌表达指数之间的关系,作为多个阴道微生态中的细菌生长趋势评估标准包括:对于每个样本中每种细菌的操作分类单元数据以及该样本的细菌表达指数,利用二者间的异速率关系进行拟合,得到细菌生长曲线;比较不同阴道微生态中细菌生长曲线的差异,作为多个阴道微生态中的细菌生长趋势评估标准。5.根据权利要求4中所述的多层级的阴道微生态评估体系构建方法,其特征在于,对于多个阴道微生态中多个样本中的多种细菌,分别根据门水平和属水平的细菌操作分类单元
数据与细菌表达指数间的关系,得到门水平的细菌生长曲线和属水平的细菌生长曲线;比较不同阴道微生态中门水平和属水平的细菌生长曲线的统计学差异,作为多个阴道微生态中的门水平和属...
【专利技术属性】
技术研发人员:王茜,薛凤霞,吕永焕,韩姹,王辰,
申请(专利权)人:天津医科大学总医院,
类型:发明
国别省市:
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