识别数字切片扫描仪中样本区域的方法和装置制造方法及图纸

本发明专利技术公开了一种识别数字切片扫描仪中样本区域的方法和装置，方法包括以下步骤：采集实体切片的原始图ImagePreview，并进行伽马增强处理获取图像ImageGamma；对图像ImageGamma进行灰度、滤波、均衡、膨胀、腐蚀和抠图预处理，得到预处理后的图像ImageGrabCut；对图像ImageGrabCut进行分割处理，获得图像ImageFinalGray；对图像ImageFinalGray中的样本进行轮廓提取，如果提取的样本轮廓大于样本最小区域面积且样本轮廓的纵横差异值不大于20，则作为最终的样本区域图像。本发明专利技术能够精确地识别样本区域，提高了数字切片扫描仪中样本区域的识别效果。了数字切片扫描仪中样本区域的识别效果。了数字切片扫描仪中样本区域的识别效果。

【技术实现步骤摘要】
识别数字切片扫描仪中样本区域的方法和装置


[0001]本专利技术涉及一种识别数字切片扫描仪中样本区域的方法和装置，属于数字切片图像处理


技术介绍

[0002]数字切片扫描仪是将实体的玻片数字化的设备。数字化的过程是：首先利用预览相机对实体玻片进行拍照，形成相应的样本区域预览图；然后利用预览图与扫描器部分的对应关系，利用扫描相机采集高分辨率图像，将图像进行拼接；最终形成全视野数字病理切片(Whole slide images,WSIs)。
[0003]在数字切片扫描仪中，对实体玻片进行拍照预览是形成数字病理切片的重要一步。识别的过多会增加很多无效区域，增大扫描时间，甚至造成数字切片图片之间的拼接痕迹；如果识别过少，会遗漏关键信息，造成数字切片后期应用的困难。因此实体切片的精准识别变得非常重要。现有的识别方式多是利用图像增强、阈值、边界识别等方式进行识别；但是由于实体切片的颜色方式不同，实体切片的颜色有深有浅；而且受到预览时光源的影响，造成阈值识别更加困难；同时，切片样本识别中还需要去除盖玻片区域、去除小的斑点等，以便更精确地识别样本区域。
[0004]为了满足数字切片扫描仪识别样本区域的要求，需要一种可以精准识别数字切片扫描仪中预览图样本区域的方法。

技术实现思路

[0005]为了解决上述问题，本专利技术提出了一种识别数字切片扫描仪中样本区域的方法和装置，能够精准识别数字切片扫描仪中切片预览图的样本区域，以便去除不必要的扫描部分，保证扫描数字切片的质量和扫描速度。
[0006]本专利技术解决其技术问题采取的技术方案是：
[0007]第一方面，本专利技术实施例提供的一种识别数字切片扫描仪中样本区域的方法，包括以下步骤：
[0008]采集实体切片的原始图ImagePreview，并进行伽马增强处理获取图像ImageGamma；
[0009]对图像ImageGamma进行灰度、滤波、均衡、膨胀、腐蚀和抠图预处理，得到预处理后的图像ImageGrabCut；
[0010]对图像ImageGrabCut进行分割处理，获得图像ImageFinalGray；
[0011]对图像ImageFinalGray中的样本进行轮廓提取，如果提取的样本轮廓大于样本最小区域面积且样本轮廓的纵横差异值不大于20，则作为最终的样本区域图像。
[0012]作为本实施例一种可能的实现方式，所述采集实体切片的原始图ImagePreview，包括：
[0013]设定预览相机的伽马值Gamma，使预览图的显示颜色加深；
[0014]将实体切片放入数字切片扫描仪，利用预览相机得到实体切片的原始图ImagePreview。
[0015]作为本实施例一种可能的实现方式，所述进行伽马增强处理获取图像ImageGamma，包括：
[0016]计算原始图ImagePreview的颜色均值ColorValue；
[0017]如果ColorValue大于240，设置图像Gamma＝5；
[0018]如果ColorValue大于230设置图像Gamma＝3；根据Gamma调整预览图像得到伽马增强后的图像ImageGamma。
[0019]作为本实施例一种可能的实现方式，所述对图像ImageGamma进行灰度、滤波、均衡、膨胀、腐蚀和抠图预处理，得到预处理后的图像ImageGrabCut，包括：
[0020]将图像ImageGamma转换成灰度图ImageGray；
[0021]对灰度图ImageGray进行核大小为KernelSize的高斯滤波，得到滤波以后的图像ImageBlur；
[0022]对图像ImageBlur进行直方图均衡处理，得到图像ImageHistogram；
[0023]对图像ImageHistogram进行膨胀和腐蚀处理，去除小的斑点后，得到图像ImageEnhance；
[0024]将图像ImageEnhance图与原始图ImagePreview进行叠加处理：
[0025]ImageNewPreview＝ImageEnhance+ImagePreview；
[0026]利用抠图函数grabCut对叠加图像ImageNewPreview进行抠图处理，得到处理后的图像ImageGrabCut。
[0027]作为本实施例一种可能的实现方式，所述对图像ImageGrabCut进行分割处理，获得图像ImageFinalGray，包括：
[0028]对ImageGrabCut再次进行伽马增强处理，得到图像ImageNewGamma；
[0029]对图像ImageNewGamma进行灰度处理，得到灰度图ImageNewGray；
[0030]对灰度图ImageNewGray进行二值化分割处理，获得图像ImageFinalGray。
[0031]作为本实施例一种可能的实现方式，所述对灰度图ImageNewGray进行二值化分割处理，获得图像ImageFinalGray，包括：
[0032]利用大律法OTSU计算灰度图ImageNewGray的二值化阈值Threshold；如果阈值Threshold小于80，则Threshold＝Threshold+20；如果Threshold小于100，则Threshold＝Threshold
‑
10；否则Threshold＝Threshold
‑
30；
[0033]根据所求Threshold对灰度图ImageNewGray进行色彩分割，并对分割后是灰度图进行腐蚀处理，获得图像ImageFinalGray。
[0034]作为本实施例一种可能的实现方式，所述对图像ImageFinalGray中的样本进行轮廓提取，如果提取的样本轮廓大于样本最小区域面积且样本轮廓的纵横差异值不大于20，则作为最终的样本区域图像，包括：
[0035]对图像ImageFinalGray中的样本进行轮廓提取，得到轮廓向量列表vectorContours；
[0036]设定样本最小区域面积为MinArea；遍历轮廓向量列表vectorContours，计算每个轮廓的面积ContoursArea，如果ContoursArea小于MinArea，则将当前轮廓从
vectorContours中删除；
[0037]继续遍历轮廓向量列表vectorContours，计算每个轮廓的最小矩形MinRect；设定盖玻片的纵横差异值为20；如果MinRect.Width/MinRect.Height>20或者MinRect.Height/MinRect.Width>20；则将当前轮廓从vectorContours中删除；
[0038]将轮廓向量列表vectorContours中轮廓显示到原始图ImagePreview大小相同的空白图上，得到最终的样本区域图像。本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种识别数字切片扫描仪中样本区域的方法，其特征在于，包括以下步骤：采集实体切片的原始图ImagePreview，并进行伽马增强处理获取图像ImageGamma；对图像ImageGamma进行灰度、滤波、均衡、膨胀、腐蚀和抠图预处理，得到预处理后的图像ImageGrabCut；对图像ImageGrabCut进行分割处理，获得图像ImageFinalGray；对图像ImageFinalGray中的样本进行轮廓提取，如果提取的样本轮廓大于样本最小区域面积且样本轮廓的纵横差异值不大于20，则作为最终的样本区域图像。2.根据权利要求1所述的识别数字切片扫描仪中样本区域的方法，其特征在于，所述采集实体切片的原始图ImagePreview，包括：设定预览相机的伽马值Gamma，使预览图的显示颜色加深；将实体切片放入数字切片扫描仪，利用预览相机得到实体切片的原始图ImagePreview。3.根据权利要求1所述的识别数字切片扫描仪中样本区域的方法，其特征在于，所述进行伽马增强处理获取图像ImageGamma，包括：计算原始图ImagePreview的颜色均值ColorValue；如果ColorValue大于240，设置图像Gamma＝5；如果ColorValue大于230设置图像Gamma＝3；根据Gamma调整预览图像得到伽马增强后的图像ImageGamma。4.根据权利要求1所述的识别数字切片扫描仪中样本区域的方法，其特征在于，所述对图像ImageGamma进行灰度、滤波、均衡、膨胀、腐蚀和抠图预处理，得到预处理后的图像ImageGrabCut，包括：将图像ImageGamma转换成灰度图ImageGray；对灰度图ImageGray进行核大小为KernelSize的高斯滤波，得到滤波以后的图像ImageBlur；对图像ImageBlur进行直方图均衡处理，得到图像ImageHistogram；对图像ImageHistogram进行膨胀和腐蚀处理，去除小的斑点后，得到图像ImageEnhance；将图像ImageEnhance图与原始图ImagePreview进行叠加处理：ImageNewPreview＝ImageEnhance+ImagePreview；利用抠图函数grabCut对叠加图像ImageNewPreview进行抠图处理，得到处理后的图像ImageGrabCut。5.根据权利要求1所述的识别数字切片扫描仪中样本区域的方法，其特征在于，所述对图像ImageGrabCut进行分割处理，获得图像ImageFinalGray，包括：对ImageGrabCut再次进行伽马增强处理，得到图像ImageNewGamma；对图像ImageNewGamma进行灰度处理，得到灰度图ImageNewGray；对灰度图ImageNewGray进行二值化分割处理，获得图像ImageFinalGray。6.根据权利要求5所述的识别数字切片扫描仪中样本区域的方法，其特征在于，所述对灰度图ImageNewGray进行二值化分割处理，获得图像ImageFinalGray，包括：利用大律法OTSU计算灰度图Image...

【专利技术属性】
技术研发人员：耿世超，曲婷，
申请(专利权)人：山东志盈医学科技有限公司，
类型：发明
国别省市：