本发明专利技术公开了一组噪声性耳聋标志物组合及其检测试剂盒与应用，所述标志物组合包括rs2394795、rs2862833、rs3751385和rs1053023。当所述rs2394795为TT或TC基因型、rs2862833为TT或CC基因型、rs3751385为TT基因型和rs1053023为AG基因型时，噪声性耳聋易感；若否，则为噪声性耳聋耐受。本发明专利技术首次发现了与ONID相关的SNPs位点并发现了上述标志物组合具有噪声聋发病的关联性，可以用于职业性噪声聋发生风险的有效评估，从而可以实现对噪声聋易感人群的有效识别和筛选，从而对职业性噪声聋具有一级预防作用。聋具有一级预防作用。
【技术实现步骤摘要】
一组噪声性耳聋标志物组合及其检测试剂盒与应用
[0001]本专利技术属于基因检测领域，具体涉及一组噪声性耳聋标志物组合及其检测试剂盒与应用。
技术介绍
[0002]职业性噪声聋(Occupational noise
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induced deafness，ONID)，也称噪声性耳聋，是世界范围内最为普遍且重要的职业病之一。噪声性耳聋的发生是环境因素和遗传因素共同作用的结果，噪声性听力损失(noise induced hearing loss，NIHL)是噪声聋的早期表现。相关技术中，通过职业人群和动物实验研究发现有三十多个基因的60多个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)与噪声性听力损失的易感性相关，这些易感相关基因的发现主要是基于NIHL发生机制过程中的候选基因(candidate genes)通过基因敲除的动物实验和部分噪声暴露人群的验证实验实现的，这些研究均是针对某个候选基因进行检测，研究的方法(研究对象的选择、基因检测方法、统计方法等)各不相同，具有很大的偶然性和盲目性，缺乏系统性，研究结论缺乏统一标准，准确性有待深入研究。目前仍缺乏一种准确灵敏的检测手段和标志物用于噪声性耳聋的预测与诊断。
[0003]因此，开发一种具有高度特异性和较好灵敏度的噪声性耳聋的预测与诊断产品对于临床上噪声性耳聋易发人群的筛选与预警具有极为重要的意义。
技术实现思路
[0004]本专利技术旨在至少解决上述现有技术中存在的技术问题之一。为此，本专利技术提出一组噪声性耳聋标志物组合及其检测试剂盒与应用，通过该标志物组合能够准确的判断出受试对象的噪声性耳聋易感性，从而有效的为受试对象提供预警，提早进行相关的预防工作，对于减少临床上噪声性耳聋的发生具有极为重要的意义。
[0005]本专利技术的第一个方面，提供一组噪声性耳聋易感性相关的SNP标记组合，该SNP标记组合包括rs2394795、rs2862833、rs3751385和rs1053023。
[0006]其中，所述rs2394795、rs2862833、rs3751385和rs1053023的位点信息如下所示。
[0007]SNP位点基因SNP位点位置等位基因rs2394795CDH23chr10:71431579T>Crs2862833FASchr10:89015872T>Crs3751385GJB2chr13:20188817C>Trs1053023STAT3chr17:42313598A>G
[0008]噪声聋的易感性基因的SNP不是简单的由某一个独立的基因变异导致，其遗传特征是由多个易感基因变异的交互作用来实现的，它可能是一个SNPs集合(群)，但在现有技术中均没有公开过相关的报道。在本专利技术实施例中，专利技术人通过研究调查以及实际验证，发现CDH23
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rs2394795、FAS
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rs1468063、FAS
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rs2862833、GJB2
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rs3751385、PTPRN2
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rs10081191、SIK3
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rs6589574、STST3
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rs1053023、STST3
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rs1053005这8个SNPs位点可能与
ONID易感性有关，其中，CDH23
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rs2394795、FAS
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rs2862833、GJB2
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rs3751385、STST3
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rs1053023四个SNPs位点的组合对于ONID易感性的实质发生具有实际关联性，且具有统计学意义。
[0009]在本专利技术实施例中，专利技术人发现，对于上述SNP的组合，通过ROC曲线进行验证，发现与FAS
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rs2862833(AA/BB)单独作诊断相比，FAS
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rs2862833(AA/BB)+STAT3
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rs1053023(AB)联合诊断的AUC＝0.593(P＝0.008)，FAS
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rs2862833(AA/BB)+STAT3
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rs1053023(AB)+CDH23
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rs2394795(AA/AB)联合诊断的AUC＝0.601(P＝0.004)，FAS
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rs2862833(AA/BB)+STAT3
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rs1053023(AB)+CDH23
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rs2394795(AA/AB)+GJB2
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rs3751385(BB)联合诊断的AUC＝0.602(P＝0.004)，说明这4个SNPs位点作为联合诊断指标可提高ONID易感者的诊断准确性。这个集合的组成和结构将有助于噪声聋易感人群的判断，对噪声聋易感者具有诊断价值。
[0010]在本专利技术的一些实施方式中，当所述rs2394795为TT或TC基因型、rs2862833为TT或CC基因型、rs3751385为TT基因型和rs1053023为AG基因型时，噪声性耳聋易感；若否，则为噪声性耳聋耐受。
[0011]在本专利技术实施例中，专利技术人通过各种统计学分析和268例临床验证发现CDH23
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rs2394795、FAS
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rs2862833、GJB2
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rs3751385、STST3
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rs1053023四个SNPs位点的组合对于ONID易感性的实质发生具有实际关联性，且当所述rs2394795为TT或TC基因型、rs2862833为TT或CC基因型、rs3751385为TT基因型和rs1053023为AG基因型时，能够认为其有发生ONID的风险，且符合统计学意义。
[0012]本专利技术的第二个方面，提供检测本专利技术第一个方面所述SNP标记组合的Taqman引物，所述引物的核苷酸序列为：
[0013]rs2394795：SEQ ID NO:187和SEQ ID NO:189；
[0014]rs2862833：SEQ ID NO:191和SEQ ID NO:193；
[0015]rs3751385：SEQ ID NO:195和SEQ ID NO:197；
[0016]rs1053023：SEQ ID NO:199和SEQ ID NO:201。
[0017]当然，本领域技术人员也可以根据实际使用需求，合理设计其他具有高特异性的Taqman引物用以扩增上述SNP标记组合，包括但不限于上述所列举的Taqman引物。
[0018]本专利技术的第三个方面，提供检测本专利技术第一个方面所述SNP标记组合的探针，所述探针的核苷酸序列为：
[0019]rs2394795：
[0020]C型探针：SEQ ID NO:18本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一组噪声性耳聋易感性相关的SNP标记组合，其特征在于，所述SNP标记组合包括rs2394795、rs2862833、rs3751385和rs1053023。2.根据权利要求1所述的SNP标记组合，其特征在于，当所述rs2394795为TT或TC基因型、rs2862833为TT或CC基因型、rs3751385为TT基因型和rs1053023为AG基因型时，噪声性耳聋易感；若否，则为噪声性耳聋耐受。3.检测权利要求1中所述SNP标记组合的Taqman引物，其特征在于，所述引物的核苷酸序列为：rs2394795：上游引物SEQ ID NO:187和下游引物SEQ ID NO:189；rs2862833：上游引物SEQ ID NO:191和下游引物SEQ ID NO:193；rs3751385：上游引物SEQ ID NO:195和下游引物SEQ ID NO:197；rs1053023：上游引物SEQ ID NO:199和下游引物SEQ ID NO:201。4.检测权利要求1中所述SNP标记组合的探针，其特征在于，所述探针的核苷酸序列为：rs2394795：C型探针：SEQ ID NO:188、T型探针：SEQ ID NO:190；rs2862833：C型探针：SEQ ID NO:192、T型探针：SEQ ID NO:194；rs3751385：...
【专利技术属性】
技术研发人员：王军义，吴珊，郎丽，陈满连，夏源，吴芷丹，
申请(专利权)人：广东药科大学，
类型：发明
国别省市：
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