用于荧光成像的系统和方法技术方案

一种用于分析样品荧光的微流控装置，包括第一衬底；以及第二衬底，其中，所述第二衬底是光学透明的；粘结层，设置于所述第一衬底与所述第二衬底之间；以及限定在所述第一衬底和所述第二衬底之间的微流控室。所述第一衬底和所述第二衬底以及粘结层形成所述微流控室的壁。所述微流控装置包括与所述微流控室的所述壁中的至少一个结合的寡核苷酸，以及设置在所述微流控室的所述壁中的至少一个上并形成对准图案的荧光材料。图案的荧光材料。图案的荧光材料。

System and method for fluorescence imaging

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于荧光成像的系统和方法
[0001]优先权声明
[0002]本申请要求于2020年4月1日提交的序列号为63/003,383的美国专利申请的优先权，其内容通过引用整体并入本文。

技术介绍

[0003]包括图像对准和发光光强度校正的图像处理是用于若干程序的数据处理步骤之一，所述程序诸如基于光的脱氧核糖核酸(DNA)测序、具有多种染料的免疫组织化学和其他基于图像的程序。图像处理可以包括在X和Y方向上的图像移动、旋转、拉伸和强度校正。执行此类图像处理以在不同的测序循环中对准多个测序图像，以确定DNA簇的序列。

技术实现思路

[0004]我们在此描述了在用于微流控装置(例如，微流控室或流动池)的荧光成像的背景下使用的对准系统和方法。对准标记可以由荧光材料、反光材料或在荧光图像中显得较暗的材料形成。这些对准标记可以形成对准图案，可以极大地促进多幅图像的对准，提高计算效率和处理时间。例如，多幅图像的处理(例如对准)与边合成边测序(SBS)过程相关，其中在SBS过程的多个循环中在多个发射波长处捕获多幅图像。结合这些图像，可以生成微流控室的衬底上DNA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于分析样品荧光的微流控装置，所述微流控装置包括：第一衬底；第二衬底，其中，所述第二衬底是光学透明的；粘结层，其设置于所述第一衬底与所述第二衬底之间；微流控室，其限定在所述第一衬底和所述第二衬底之间，使得所述第一衬底和所述第二衬底以及所述粘结层形成所述微流控室的壁；和寡核苷酸，其与所述微流控室的所述壁中的至少一个结合；和荧光材料，其设置在所述微流控室的所述壁中的至少一个上并形成对准图案。2.根据权利要求1所述的微流控装置，其中，所述荧光材料包括设置在所述微流控通道的至少一个壁上的光致抗蚀剂。3.根据权利要求1或2所述的微流控装置，其中，所述荧光材料包括结合或粘附到所述微流控通道的至少一个壁的荧光分子。4.根据前述权利要求中任一项所述的微流控装置，其中，所述荧光材料设置在由所述第一衬底形成的所述微流控通道的第一壁、由所述第二衬底形成的所述微流控通道的第二壁上，或两者上。5.根据前述权利要求中任一项所述的微流控装置，其中，所述荧光材料设置在由所述粘结层形成的所述微流控通道的侧壁上。6.根据前述权利要求中任一项所述的微流控装置，其中，所述荧光材料部分地嵌入所述微流控通道的至少一个壁中。7.根据前述权利要求中任一项所述的微流控装置，其中，所述荧光材料包括由荧光团标记的寡核苷酸标记的参考寡核苷酸。8.根据权利要求7所述的微流控装置，其中，每个参考寡核苷酸由两个或更多个荧光团标记的寡核苷酸标记。9.根据前述权利要求中任一项所述的微流控装置，其中，所述对准图案包括预定图案或随机图案。10.根据前述权利要求中任一项所述的微流控装置，其中，所述样品的所述荧光在多个发射波长处被检测，并且其中，所述荧光材料至少在所述多个发射波长之一处发出荧光。11.一种用于分析样品荧光的系统，所述系统包括：前述权利要求中任一项所述的微流控装置；和荧光显微镜，其配置为捕获所述微流控装置的所述微流控室中的测序反应的荧光图像。12.一种制造用于分析样品荧光的微流控装置的方法，所述方法包括：以对准图案将荧光材料设置在第一衬底的表面上；将寡核苷酸结合到第一衬底的表面或第二衬底的表面上：和用粘结层将所述第一衬底附接到所述第二衬底，使得在所述第一衬底和所述第二衬底之间限定微流控室，并且使得所述第一衬底的所述表面、所述第二衬底的所述表面以及所述粘结层形成所述微流控室的壁，其中，所述第一衬底或所述第二衬底中的至少一个是光学透明的。13.根据权利要求12所述的方法，其中，将所述荧光材料设置在第一衬底的表面上包括
将光致抗蚀剂设置在所述第一衬底上。14.根据权利要求12或13所述的方法，其中，将所述荧光材料设置在第一衬底的表面上包括将荧光分子设置在所述第一衬底上。15.根据权利要求12至14中任一项所述的方法，包括使用光刻法在所述荧光材料的层中限定所述对准图案。16.根据权利要求12至15中任一项所述的方法，包括在所述第一衬底的所述表面上以所述对准图案印刷所述荧光材料。17.根据权利要求12至16中任一项所述的方法，包括：在所述第一衬底中限定所述对准图案；和至少部分地用所述荧光材料填充限定的图案。18.根据权利要求17所述的方法，包括在所述第一衬底中蚀刻所述对准图案。19.根据权利要求12至18中任一项所述的方法，其中，将寡核苷酸设置在第一衬底的表面上或第二衬底的表面上包括：将所述寡核苷酸结合到所述第一衬底的所述表面或所述第二衬底的所述表面。20.一种用于分析样品的微流控装置，所述微流控装置包括：第一衬底；第二衬底，其中，所述第二衬底是光学透明的；粘结层，其设置于所述第一衬底与所述第二衬底之间；微流控室，其限定在所述第一衬底和所述第二衬底之间，使得所述第一衬底和所述第二衬底以及所述粘结层形成所述微流控室的壁；一组寡核苷酸，其与所述微流控室的所述壁中的至少一个结合，其中，该组寡核苷酸的每条链包括用于簇生成的引物；一组参考寡核苷酸，其与所述微流控室的所述壁中的至少一个结合，其中，该组参考寡核苷酸配置为产生对准标记。21.根据权利要求20所述的微流控装置，其中，该组参考寡核苷酸的每条链包含两个或更多个用于边合成边测序的阅读引物。22.根据权利要求20所述的微流控装置，其中，该组参考寡核苷酸的每条链包括用于边合成边测序的阅读引物，其中，所述阅读引物不同于所述第一组寡核苷酸的阅读引物。23.根据权利要求21或22所述的微流控装置，其中，该组参考寡核苷酸配置为具有比DNA簇的平均信号强度更高的信号强度。24.根据权利要求20至23中任一项所述的微流控装置，其中，该组参考寡核苷酸被荧光染料标记。25.根据权利要求20至23中任一项所述的微流控装置，其中，该组参考寡核苷酸被荧光猝灭剂标记。26.一种制造用于分析样品荧光的微流控装置的方法，所述方法包括：将第一组寡核苷酸结合到第一衬底的表面，其中，所述第一组寡核苷酸包括用于簇生成的引物；将第二组寡核苷酸结合到第一衬底的表面或第二衬底的表面，其中，所述第二组寡核苷酸配置为产生对准图案；和
用粘结层将所述第一衬底附接到所述第二衬底，使得在所述第一衬底和所述第二衬底之间限定微流控室，并且使得所述第一衬底的所述表面、所述第二衬底的所述表面以及所述粘结层形成所述微流控室的壁，其中，所述第一衬底或所述第二衬底中的至少一个在所述多个发射波长的每个处是光学透明的。27.一种微流控装置，包括：第一衬底；第二衬底；第一粘结层，其设置于所述第一衬底与所述第二衬底之间；第一微流控通道，其限定在所述第一衬...

【专利技术属性】
技术研发人员：羌梁梁，
申请(专利权)人：艾斯生物实验室有限责任公司，
类型：发明
国别省市：