一种Clarity数字PCR仪用反应产物回收装置制造方法及图纸

技术编号:34284732 阅读:62 留言:0更新日期:2022-07-27 08:10
本申请属于生物实验仪器设备技术领域,具体涉及一种Clarity数字PCR仪用反应产物回收装置。该装置具体包括:可分开或者组合联体的由8个小型离心管组合而成的8联体离心管,和用于容纳放置单个小型离心管的大型离心管;小型离心管底部可开合设计;大型离心管上部内径可以架空盛放小型离心管。本申请基于现有Clarity数字PCR仪的使用缺陷,对现有配套的回收装置进行了针对性改进。初步应用效果表明,回收装置改进后,可以较好确保PCR扩增产物的有效和稳定回收,对于改善相关实验操作设计奠定了较好的设备基础,具有较好的实用价值和推广应用价值。广应用价值。广应用价值。

A reaction product recovery device for clarity digital PCR instrument

【技术实现步骤摘要】
一种Clarity数字PCR仪用反应产物回收装置


[0001]本申请属于生物实验仪器设备
,具体涉及一种Clarity数字PCR仪用反应产物回收装置。

技术介绍

[0002]数字PCR(dPCR)技术,是一种相较于荧光定量PCR(qPCR)技术的升级技术。其与荧光定量PCR的主要区别在于:dPCR是对PCR反应结束终点的荧光信号检测,并进行数字化定量,而qPCR则是PCR过程中实时检测荧光信号。之所以说数字PCR是荧光定量PCR的升级技术,其主要原因在于,dPCR利用单分子扩增来实现核酸的绝对定量,定量过程中不需依赖事先的标准曲线。
[0003]数字PCR的主要技术原理为:将单个DNA分子置于独立的反应室中,并对其进行PCR扩增;利用TaqMan探针法或染料法检测特定的靶序列。数字PCR技术主要包括三步:第一,通过特定技术将PCR反应混合液分散到几万个反应单元(反应室);第二,单分子在反应室中扩增;第三,PCR结束后检测荧光信号,最后通过泊松分布统计数数,计算出样本的拷贝数,实现核酸分子的绝对定量。
[0004]与qPCR相比,dPCR的绝对定量不需利用标准曲线来实现具体定量,而是直接通过单分子扩增结合泊松分布统计,来实现绝对定量。因此,数字PCR与荧光定量PCR的主要区别之一在于:数字PCR需要进行分区后扩增,而这种分区既可实现核酸分子的单分子扩增,从而提高扩增效率,同时也可以提高荧光检测的灵敏性和数据的可重复性,所以数字PCR具有检测精度高、重复性好和绝对定量的相对优势。
[0005]实际应用中,dPCR需要将由若干(一般上万)毛细管组成的芯片置于离心管内进行PCR反应,但由于这种反应属于微量反应,因此对于相关实验操作要求较高,而由此导致部分反应操作后无法有效回收扩增产物,进而导致dPCR的技术优势无法充分和有效发挥,为此,极有必要就相关设备进行进一步改进。

技术实现思路

[0006]针对现有技术中相关dPCR设备无法有效回收PCR扩增产物的缺陷,本申请目的在于提供一种Clarity数字PCR仪用反应产物回收装置,从而为相关实验的稳定开展奠定一定技术基础。
[0007]本申请所采取的技术方案详述如下。
[0008]一种Clarity数字PCR仪用反应产物回收装置,具体包括:可分开或者组合联体的由8个小型离心管组合而成的8联体离心管(组合时,具体例如采用按扣方式、或者螺栓等连接方式进行连接固定),和用于容纳放置单个小型离心管的大型离心管;
[0009]所述小型离心管,为带有密封用盖体的锥形管,每个小型离心管规格为0.25ml,每个小型离心管对应放置一枚Clarity数字芯片;同时,每个小型离心管底部可开合设计;
[0010]所述大型离心管,同样为带有密封用盖体的锥形管,但管体上部内径与小型离心
管外径相适应,具体而言,在将小型离心管置于大型离心管内腔时,大型离心管上部内径可以架空盛放小型离心管;所述大型离心管,具体规格为1.5ml。
[0011]所述小型离心管,用于盛放Clarity数字PCR 8联管芯片;
[0012]具体实验操作时:首先,将各小型离心管组合成为一个8联体离心管,然后按照现有方式进行PCR扩增,PCR扩增结束后,将8联体离心管拆分为单个的小型离心管。随后打开小型离心管底部开口,并将小型离心管架空置于大型离心管内。最后,采用常规离心机对大型离心管进行离心操作,从而回收小型离心管内的PCR扩增产物。
[0013]总体上,本申请基于现有Clarity数字PCR仪的使用缺陷,对现有配套的回收装置进行了针对性改进。初步应用效果表明,回收装置改进后,可以较好确保PCR扩增产物的有效和稳定回收,对于改善相关实验操作设计奠定了较好的设备基础,具有较好的实用价值和推广应用价值。
附图说明
[0014]图1为现有Clarity 8联管芯片结构示意图;
[0015]图2为现有实验操作结果;
[0016]图3为本申请所提供回收装置使用状态结构示意图;
[0017]图4为采用本申请回收装置所回收的扩增产物的电泳检测结果。
具体实施方式
[0018]下面结合实施例对本申请技术方案做进一步解释说明。在介绍具体实施例前,为便于本领域技术人员详细了解本申请的相关研发情况,就下述实施例中所涉及的部分实验材料、检测方法等背景性实验情况简介如下。
[0019]主要设备及物料:
[0020]Clarity数字PCR 8联管芯片、Clarity数字PCR系统,Clarity数字PCR染料法扩增试剂,均为新加坡的JN Medsys公司产品;
[0021]琼脂糖水平电泳仪,北京六一。
实施例
[0022]以新加坡的JN Medsys的Clarity数字PCR仪具体为例,现有技术进行PCR实验时,需要采用一种Clarity数字芯片并将其配套置于0.25ml规格的8联体离心管内(将这一套简称为8联管芯片)进行实验操作。具体而言:如图1所示,每个芯片(离心管内灰色块体所示)为由15000个毛细管组成的实验装置,其厚度为1mm左右,芯片表面呈下边缘窄、上边缘宽的梯形结构。实际实验时,在8联体离心管的每个离心管内分别固定芯片,以此作为Clarity数字PCR平台的分区装置。随后,利用配套仪器完成每个离心管内的PCR反应液的分区,进而进行PCR单分子扩增。反应完成后,回收芯片中扩增后的产物,并进行进一步检测分析。
[0023]但由于相关反应属于微量反应,按照现有相关报道进行操作时,无法有效回收反应产物。例如,参考《Application of digital PCR with chip

in

a

tube format to analyze Adenomatous polyposis coli ( APC ) somatic mosaicism》(T Kahyo et.al,Clinica Chimica Acta,2017)中操作流程,专利技术人实际操作后,无法有效回收到PCR扩增产
物。具体回收操作而言:
[0024]首先,吸出8联管芯片中封闭用的油;
[0025]随后,加100ul TE buffer(10mM Tris

HCl,PH=8.0;0.1mM EDTA)进行溶解,Vortex震荡30s;
[0026]最后,将混合液转移到新的离心管中,用乙醇沉淀回收的DNA。
[0027]但具体结果如图2所示,从电泳条带结果可以看出,无法回收扩增产物。
[0028]需要说明的是,上述回收过程中,为排除溶解用水或者振荡操作等因素影响,专利技术人分别严格按照文献报道方法采用100ul的无核酸酶水(无核酸酶水和TE buffer对DNA溶解性是一样的,但是TE buffer更适合DNA的长期保存)、延长震荡时间(延长到1min)进行了多次实验,但均无法有效回收获得扩本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种Clarity数字PCR仪用反应产物回收装置,其特征在于,该装置具体包括:可分开或者组合联体的由8个小型离心管组合而成的8联体离心管,和用于容纳放置单个小型离心管的大型离心管;所述小型离心管,为带有密封用盖体的锥形管,每个小型离心管对应放置一枚Clarity数字芯片;同时,每个小型离心管底部可开合设计;所述大型离心管,同样为带有密封用盖体的锥形管,但管体上部内径与小型离心管外径相适应,具体而言...

【专利技术属性】
技术研发人员:令吉明张宝珑郑琳琳刘昆
申请(专利权)人:杭州晶佰生物技术有限公司
类型:新型
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1