【技术实现步骤摘要】
一种基于固相糖蛋白T抗原糖肽富集和酶切分析的方法
[0001]本专利技术属于生物分子分析试剂
,具体涉及固相糖蛋白T抗原糖肽富集和酶切分析(SPTAgE)的方法。
技术介绍
[0002]T抗原是半乳糖通过β(1
‑
3)连接与乙酰半乳糖胺结合形成的二糖结构,属于常见O
‑
聚糖中的核心1结构。人体90%的癌症类型中都能检测到T抗原的表达。在正常细胞中T抗原是隐藏起来的,但在乳腺癌、结肠癌、前列腺癌和膀胱癌中会选择性暴露在癌细胞表面。T抗原是一种截短的O
‑
聚糖,体积小结构简单。它在人体中具有非生理性聚糖结构,因此它可被免疫系统识别为外来物。大多数癌症患者的T抗原测试可以在任何活检发现癌症之前被检测到。由于T抗原是血液和皮肤细胞表面的蛋白质,可以被免疫系统抗体识别,因此可以作为诊断或预后的疾病生物标志物。然而很少有方法可用于详细鉴定癌症中完整蛋白质被T抗原修饰,尤其是在早期阶段;同时与T抗原结构类似的核心8结构会干扰对T抗原修饰位点信息的获取。
[0003]因此, ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种基于固相糖蛋白T抗原糖肽富集和酶切分析的方法,其特征在于,包括步骤:(1)从样本中提取蛋白;(2)蛋白酶解获得多肽;(3)半乳糖和N
‑
乙酰半乳糖氧化;(4)酰肼树脂固定与PNGase F酶切;(5)半乳糖苷酶处理与质谱分析。2.根据权利要求1所述的一种基于固相糖蛋白T抗原糖肽富集和酶切分析的方法,其特征在于,在步骤(1)中,所述样本包括:组织样本或体液样本。3.根据权利要求1所述的一种基于固相糖蛋白T抗原糖肽富集和酶切分析的方法,其特征在于,在步骤(2)中,所述蛋白酶解获得多肽包括:
①
向蛋白溶液中加入二硫苏糖醇,在温度为37℃的条件下反应1
‑
1.5小时;
②
再加入碘乙酰胺,室温暗室反应0.5
‑
1小时,获得样本;
③
将所述样本稀释,加入碳酸氢铵,直至所述碳酸氢铵的终浓度为90
‑
110mM,所述样本的pH值介于7
‑
9之间;
④
加入测序级胰蛋白酶,轻微振荡,在温度为37℃的条件下水解16
‑
18小时,得到多肽溶液;
⑤
在所述多肽溶液中加入甲酸,直至pH值下调至2
‑
3;
⑥
将C18萃取柱预处理,向所述C18萃取柱中加入所述多肽溶液,将过滤液再次加入所述C18萃取柱,用0.1%TFA清洗所述C18萃取柱多次,最后,用含有0.1%TFA的50
‑
60%乙腈洗脱出多肽,并且重复多次;
⑦
将洗脱出的多肽合并,真空冷冻干燥得到纯化的多肽。4.根据权利要求3所述的一种基于固相糖蛋白T抗原糖肽富集和酶切分析的方法,其特征在于:在步骤(3)中,所述半乳糖和N
‑
乙酰半乳糖氧化包括:向所述纯化的多肽中加入二甲基亚砜、磷酸钠缓冲液、辣根过氧化物酶以及半乳糖氧化酶,然后在温度为35℃的条件下反应0.9
‑
1.1小时,获得糖肽。...
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