母体血浆的无创性产前分子染色体核型分析制造技术

本文公开了用于检测胎儿的基因组中的微扩增或微缺失的方法、系统和设备，以及母体血浆的无创性产前分子染色体核型分析。在一些实施方案中，所述方法包括接收生物样品中的多个DNA片段中的每一个的序列标签；确定所述序列标签的基因组位置；确定多个基因组区域中的每一个中的DNA密度是否异常高或者异常低；将具有异常高的密度的一组连续的基因组区域鉴定为微扩增；以及将具有异常低的密度的一组连续的基因组区域鉴定为微缺失。所述生物样品可以是以无创方式从怀有所述胎儿的女性受试者获得的血液样品。得的血液样品。得的血液样品。

【技术实现步骤摘要】
母体血浆的无创性产前分子染色体核型分析
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2013年1月10日提交的名称为“母体血浆的无创性产前分子染色体核型分析(Noninvasive Prenatal Molecular Karyotyping from Maternal Plasma)”的美国临时专利申请号61/751,213以及2013年3月15日提交的名称为“母体血浆的无创性产前分子染色体核型分析(Noninvasive Prenatal Molecular Karyotyping from Maternal Plasma)”的美国专利申请号13/837,776的优先权。每一件优先权申请均以引用的方式整体并入本文中用于所有目的。
[0003]本申请与Lo等人在2008年7月23日提交的名称为“利用大规模并行基因组测序对胎儿染色体非整倍体进行诊断(Diagnosing Fetal Chromosomal Aneuploidy Using Massively Parallel Genomic Sequencing)”的共同拥有的美国专利申请号12/17本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.评估从怀有胎儿的女性受试者所获得的生物样品中胎儿DNA百分比的方法，所述生物样品包括来自所述胎儿和来自所述女性受试者的无细胞DNA，所述方法包括：接收所述生物样品中的多个DNA片段中的每一个的一个或多个序列标签；确定所述序列标签的基因组位置；对于一个或多个基因组区域中的每一个：使用计算机系统，由所述基因组区域内具有基因组位置的序列标签确定所述基因组区域内DNA片段的对应量；将所述对应量归一化以获得对应密度；以及将所述对应密度与参考密度进行比较以鉴定所述对应密度是否与所述参考密度存在统计学上的差异；由被鉴定为具有与所述参考密度存在统计学上的差异的对应密度的一个或多个基因组区域的参考密度和对应密度来评估所述胎儿DNA百分比，其中每一个基因组区域的大小为小于或等于10Mb。2.根据权利要求1所述的方法，其中评估所述胎儿DNA百分比包括计算下式：其中所述GR
x
‑
y测测
是所述一个或多个基因组区域的基因组区域的对应密度，以及平均GR
x
‑
y参考
是所述基因组区域的参考密度。3.根据权利要求1或2所述的方法，其还包括：将所述胎儿DNA百分比与临界值进行比较，以及基于所述胎儿DNA百分比与临界值的比较，确定是否所述女性受试者和所述胎儿都具有微扩增或微缺失。4.根据权利要求3所述的方法，其还包括：当所述胎儿DNA百分比大于所述临界值时确定所述女性受试者和所述胎儿两者都具有微扩增或微缺失。5.根据权利要求3所述的方法，其还包括：当所述胎儿DNA百分比小于所述临界值时确定只有所述胎儿具有微扩增或微缺失。6.根据权利要求1所述的方法，其中所述生物样品是母体血液、血浆、血清、尿液、或唾液。7.根据权利要求1所述的方法，其中所述序列标签是通过大规模并行测序获得的。8.根据权利要求1所述的方法，其中所述基因组区域是非重叠的。9.根据权利要求1所述的方法，其中所述基因组区域是相邻的。10.根据权利要求1所述的方法，其中所述基因组区域具有相同的尺寸。11.根据权利要求1所述的方法，其中每一个基因组区域的所述尺寸为约1Mb。12.根据权利要求1所述的方法，其中基因组区域的所述对应密度是通过将所述基因组区域的DNA片段的所述对应量除以多个基因组区域的DNA片段的总量而获得的。13.根据权利要求1所述的方法，其中基因组区域的所述对应密度等于所述基因组区域的DNA片段的所述对应量。
14.根据权利要求1所述的方法，其中基因组区域的所述参考密度是由在所述基因组区域中未表现出微扩增或微缺失的一个或多个其它生物样品所确定的多个对应密度的平均值或中值。15.根据权利要求1所述的方法，其中基因组区域的所述参考密度是对于...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵慧君，卢煜明，陈君赐，江培勇，余烁妍，
申请(专利权)人：香港中文大学，
类型：发明
国别省市：