水稻株型的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了水稻株型的分子标记及其应用。本发明专利技术的SNP标记与水稻株型紧密相关，能够有效用于选育水稻、确定水稻基因型、快速育种。快速育种。

【技术实现步骤摘要】
水稻株型的分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及水稻株型的分子标记及其应用。具体涉及水稻株型的SNP分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]水稻株型是决定水稻产量的重要因素之一，植株的高矮、叶子的宽窄、穗的形状、分蘖角度等都决定了水稻的株型，水稻株型也是水稻育种的目标之一。
[0003]水稻叶片是光合作用的主要器官，因而其大小和形状对于产量影响很大。NAL1基因调控水稻叶的大小，其突变后叶片变窄，说明此基因在叶片的横向生长中发挥重要作用；同时其突变体的节间变短，叶脉数目维管束的数目减少，植株矮化，节间细胞数目减少。进一步研究发现，此基因在维管组织中高表达，与野生型相比，突变体中的数目和排列方式发生了改变，维管组织系统发育不良。说明维Nal1调节管束排列模式，在叶片的横向生长中发挥重要作用；nal1突变体的节间细胞数目减少，节间变短，株高矮化，说明Nal1还影响水稻节间细胞分裂(Qi et al,2008Fujita et al,2013)。
[0004]株型的紧凑与松散限制了种植的密度，控制这一性状的主效基因为TAC1基本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种分离的来自水稻的核酸分子，其含有选自第一、第二和第三SNP标记中的一种或多种，其中，第一SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:1和2作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第124位核苷酸，该核苷酸为A或C；第二SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:4和5作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第179位核苷酸，该核苷酸为A或G；第三SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:7和8作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第144位核苷酸，该核苷酸为T或G。2.如权利要求1所述的核酸分子，其特征在于，所述核酸分子长度为10bp
‑
600bp；优选地，所述核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:3、6或9所示的序列。3.用于检测水稻基因组中选自第一、第二和第三SNP标记中的一种或多种的引物，其中，第一SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:1和2作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第124位核苷酸，该核苷酸为A或C；第二SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:4和5作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第179位核苷酸，该核苷酸为A或G；第三SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:7和8作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第144位核苷酸，该核苷酸为T或G，优选地，所述引物的扩增产物包含SEQ ID NO:3或其片段，所述片段包含SEQ ID NO:3自5
’
末端起第124位核苷酸；和/或所述引物的扩增产物包含SEQ ID NO:6或其片段，所述片段包含SEQ ID NO:6自5
’
末端起第179位核苷酸；所述引物的扩增产物包含SEQ ID NO:9或其片段，所述片段包含SEQ ID NO:9自5
’
末端起第144位核苷酸，更优选地，所述引物选自以下一组或多组：(1)SEQ ID NO:1和2所示的序列或在严谨条件下与SEQ ID NO:3杂交的序列，(2)SEQ ID NO:4和5所示的序列或在严谨条件下与SEQ ID NO:6杂交的序列，和(3)SEQ ID NO:7和8所示的序列或在严谨条件下与SEQ ID NO:9杂交的序列。4.用于检测水稻基因组中选自第一、第二和第三SNP标记中的一种或多种的探针，其中，第一SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:1和2作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第124位核苷酸，其为A或C；第二SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:4和5作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第179位核苷酸，该核苷酸为A或G；第三SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:7和8作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第144位核苷酸，该核苷酸为T或G，优选地，所述探针包括：(1.1)识别SEQ ID NO:3或其片段的探针，所述片段包含SEQ ID NO:3自5
’
端起第124位碱基，和/或(1.2)(1.1)的互补序列；和/或(2.1)识别SEQ ID NO:6或其片段的探针，所述片段包含SEQ ID NO:6自5
’
端起第179位碱基，和/或(2.2)(2.1)的互补序列；和/或
(3.1)识别SEQ ID NO:9或其片段的探针，所述片段包含SEQ ID NO:9自5
’
端起第144位碱基，和/或(3.2)(3.1)的互补序列。5.一种试剂盒，其含有用于检测水稻基因组中的选自第一、第二和第三SNP标记中的一种或多种的试剂，其中，第一SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:1和2作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第124位核苷酸，其为A或C；第二SNP标记为：以水稻基因组DNA为模板，采用SEQ ID NO:4和5作为引物进行PCR扩增得到的扩增产物的自5
’
末端起第179位核苷酸，该核苷酸为A或G；第三S...

【专利技术属性】
技术研发人员：韩斌，司丽珍，吕威，赵强，朱静洁，上官颖颖，
申请(专利权)人：中国科学院分子植物科学卓越创新中心，
类型：发明
国别省市：