一组用于东亚群体生物地理来源鉴识研究的SNP位点及方法技术

本发明专利技术公开了一组用于东亚群体生物地理来源鉴识研究的SNP位点及方法，属于基因鉴别技术领域。本发明专利技术以SNP分子遗传标记为对象，系统甄选在北京汉族、南方汉族、傣族、日本和越南京族的东亚群体中具有较高遗传分化的位点，通过XGBoot机器学习算法构建一个高效、简便、快捷的人工智能模型，用于解析5个东亚群体的生物地理来源。本发明专利技术为始祖信息标记用于解析不同群体的生物地理来源提供新的方法，并且可为法医学以及群体遗传学研究提供更有价值的信息。息。息。

【技术实现步骤摘要】
一组用于东亚群体生物地理来源鉴识研究的SNP位点及方法


[0001]本专利技术涉及基因鉴别
，特别是涉及一组用于东亚群体生物地理来源鉴识研究的SNP位点及方法。

技术介绍

[0002]始祖信息标记是指在群体中表现出较高等位基因频率差异的遗传标记，它可以解析未知个体的生物地理来源，也可用于识别群体中潜在的亚结构。前者在法医学研究中可为司法侦查工作提供指向性线索；后者在全基因组关联分析中可控制群体分层因素，进而可避免假阳性或者假阴性的结果。目前，法医学家通常关注的是主要洲际群体的鉴别研究。迄今为止，已有多组用于不同洲际群体法医学始祖分析的始祖信息标记被报道。然而，对于处于同一个洲际的群体或者那些位于主要洲际群体间的群体，对其法医学始祖解析的研究相对较少。
[0003]对于未知个体的生物地理来源的解析，法医学家通常采用主成分分析或者群体遗传结构分析的方法。前者是根据所有位点信息对所有样本进行降维分析，将变量信息转变为若干个重要的主成分，每个样本在不同主成分上都有一个特定的位置，然后根据样本在不同主成分上的分布情况，推测个体可能的生物地理本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组用于东亚群体生物地理来源鉴识研究的全基因组的SNP位点的检测试剂在制备鉴别东亚群体生物地理来源的试剂盒中的应用，其特征在于，所述SNP位点包括下表所示的位点：
2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述东亚群体生物地理来源包括北京汉族、南方汉族、傣族、日本人和越南京族。3.一种解析东亚群体生物地理来源的方法，其特征在于，包括筛选权利要求1中所述的一组用于东亚群体生物地理来源鉴识研究的全基因组的SNP位点的步骤。4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，具体包括以下步骤：(1)基于国际千人基因组中的东亚群体的全基因组数据，采用PLINK软件系统初筛在东亚群体中具有相对高分化的SNP位点；(2)采用XGBoot机器学习算法对步骤(1)中初筛得到的SNP位点，基于最优子集的方法进行再次筛选，最终确定能用于解析东亚群体生物地理来源的SNP位点。5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，步骤(1)中，所述初筛在东亚群体中具...

【专利技术属性】
技术研发人员：靳小业，黄江，周桂银，任峥，张红玲，王启燕，刘玉波，季晶焱，夏冰，
申请(专利权)人：贵州医科大学，
类型：发明
国别省市：