一组预测肝癌预后联合标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一组预测肝癌预后联合标志物及其应用，属于生物医药技术领域。肝癌是世界范围内最常见的癌症相关死亡原因之一，预后极差，识别其有效的预后生物标志物具有重要的临床意义。本发明专利技术提出了一种基于联合生物标志物对肝癌患者预后进行测定及其风险评估的模型，涉及的联合生物标记物包括：CDCA3，CDCA8，SSRP1，HN1以及KIF4A。本发明专利技术依据病例样本中联合生物标志物的表达情况，定量地计算其预后风险评分，根据患者的风险评分的中位值分为高、低风险组，结果低风险组患者的预后明显优于高风险组患者，并通过K

【技术实现步骤摘要】
一组预测肝癌预后联合标志物及其应用
专利

[0001]本专利技术属于生物医药领域，具体涉及一组预测肝癌预后的联合标志物及其应用，具体涉及一组新的转录因子家族E2F相关的基因集，该基因集可以作为肝癌的预后标志物。

技术介绍

[0002]肝癌是临床上最常见的恶性肿瘤之一，死亡人数在所有癌症中位居第三。早期难以发现，70％以上的肝癌患者在晚期确诊，因此，肝癌患者的预后极差。此外，传统的可识别的临床和病理症状在预测肝癌预后方面存在很大缺陷，为了延长肝癌患者的总体存活率，需要寻找更好发预测预后的新方法。
[0003]肝癌作为一种异质性疾病，并非由单个基因或其产物所决定，越来越多的文献报道，来自患者肿瘤组织的多基因预后特征比单基因更能准确地预测癌症患者的预后，特别是mRNA的多基因预后特征比非编码预后基因具有更好的预后准确性，可以提供更有效的个体化治疗。然而，目前在肝癌中尚缺乏mRNA联合生物标志物对肝癌预后的研究。因此，寻找有效的联合生物标志物对于评估肝癌的预后具有重要的意义。
[0004]E2F是编码一系列转录因子、具有多功能的转录因子家本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组用于预测肝癌预后的联合生物标记物，其特征在于，所述联合生物标记物包括CDCA3、CDCA8、HN1、KIF4A以及SSRP1；其中，所述联合标志物由基因表达量与对应系数的乘积之和构成的Risk score来表征：Risk score＝0.3915*expression of gene HN1
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0.3864*expression of gene KIF4A
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0.2886*expression of gene CDCA3+0.4415*expression of gene CDCA8+0.8842*expression of gene SSRP1。2.如权利要求1所述的预测肝癌患者预后及肝癌靶向治疗的基因集，其特征在于，所述的CDCA3、CDCA8、HN1、KIF4A以及SSRP1分别表示各基因在肝癌患者中的表达量。3.如权利要求1所述的一组用于预测肝癌预后的联合生物标记物，其特征在于，包括如下步骤：(1)从TCGA检索肝癌的和癌旁组织RNA
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Seq的数据；(2)筛选存在差异的基因集：采用GSEA功能富集分析，以|NES|>1并且NOM p
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val<0.05为标准，选取具有显著统计学差异的基因集，用于确定肝癌治疗中有价值的标志性联合生物标志物；NES代表归一化后的富集分析评分,NOM p
‑
val代表校正后的p value，表征富集结果的可信度；(3)单因素COX筛选差异基因集中影响预后的基因：利用单因素Cox回归分析，筛选出差异基因集中影响肝癌患者预后的基因；(4)多因素COX构建肝癌预后的风险模型：从单因素Cox分析结果中筛选P<0.001的预后基因，采用多因素Cox回归分析建立预后模型，最终筛选出CDCA3...

【专利技术属性】
技术研发人员：朱文静，步向阳，韩欢，石杰，
申请(专利权)人：青岛市市立医院，
类型：发明
国别省市：