一种黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法及应用技术

本发明专利技术公开了一种黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法，包括以下步骤：(1)黄鳍鲷全同胞家系建立；(2)黄鳍鲷亲本和子代基因组DNA提取；(3)多态性微卫星引物筛选；(4)荧光标记8重PCR体系开发和扩增；(5)微卫星位点基因分型及家系鉴定：(5.1)确定亲本和家系个体在各微卫星位点上对应的基因型；(5.2)家系鉴定。该方法首次在黄鳍鲷上利用荧光修饰的多态微卫星标记建立了亲子鉴定平台，鉴定准确率高，快速，成本低。还公开了上述方法在黄鳍鲷的群体遗传学评价、系谱认证、亲子鉴定、分子标记辅助家系管理和分子标记辅助亲本选择方面的应用。分子标记辅助亲本选择方面的应用。

【技术实现步骤摘要】
一种黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法及应用


[0001]本专利技术属于鱼类遗传育种
，具体涉及一种黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法及应用。

技术介绍

[0002]黄鳍鲷(Acanthopagrus latus)，又称为黄脚立、赤翅、鲛腊鱼、黄鳍棘鲷。属于鲈形目鲷科鲷属鱼类。体长椭圆形，扁而窄，体高，头部尖，尾双叉形。背鳍、臀鳍、臀鳍、尾鳍的下叶为黄色，背鳍有11根鳍棘。黄鳍鲷适应能力强，海水、咸淡水均生长良好，所以在养殖业中占有重要地位。黄鳍鲷的分布贯穿印度西太平洋，从波斯湾沿着印度海岸到菲律宾，从澳大利亚到日本，我国主要分布广东、福建、广西等沿海城市。黄鳍鲷繁殖亲本主要是野生捕捞或培养数代的种群，没有经过人工选育，其生长速度、抗病能力和其它养殖性能等还未达到良种化的程度，适应集约化养殖能力较弱。因此，尽快开展黄鳍鲷良种选育工作对于黄鳍鲷种群保护和满足当前健康养殖业的迫切需要具有极其重要的意义。
[0003]在鱼类遗传育种研究中，清晰的系谱信息对于家系的选育和亲本的管理至关重要。传统的水产动物选择育种中，养殖单位需要对不同的家系进行分养来维持本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法，其特征是包括以下步骤：(1)黄鳍鲷全同胞家系建立利用养殖的黄鳍鲷作为亲本，进行人工繁殖，建立全同胞家系分养，从每个家系中选取仔鱼，作为家系鉴定的样本；(2)黄鳍鲷亲本和子代基因组DNA提取选取步骤(1)中黄鳍鲷亲本和仔鱼的鳍条组织，提取亲本和子代的基因组DNA，保存待用；(3)多态性微卫星引物筛选从黄鳍鲷转录组测序中筛选获得8个微卫星位点Y1、Y2、Y3、Y4、Y6、Y8、Y9、Y10，根据8个微卫星位点，设计8对微卫星引物，分别为引物对Y1、引物对Y2、引物对Y3、引物对Y4、引物对Y6、引物对Y8、引物对Y9和引物对Y10；(4)荧光标记8重PCR体系开发和扩增将步骤(3)中筛选出来的8对引物，设计成一个8重PCR体系，在8对引物的正向引物的5
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端分别用FAM、HEX、TAMRA三种不同的荧光基团进行修饰，采用荧光PCR反应对步骤(2)中亲本及子代的DNA样品进行PCR扩增；(5)微卫星位点基因分型及家系鉴定(5.1)确定亲本和家系个体在各微卫星位点上对应的基因型将步骤(4)中8重PCR扩增产物在测序仪上进行分型；(5.2)家系鉴定对亲本基因型和子代基因型进行分析，判定子代个体的父母本。2.根据权利要求1所述的黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法，其特征是：步骤(2)中采用醋酸铵法提取亲本和子代的基因组DNA。3.根据权利要求1所述的黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法，其特征是：步骤(3)中所述引物Y1、引物对Y2、引物对Y3、引物对Y4、引物对Y6、引物对Y8、引物对Y9、引物对Y10的碱基序列分别如SEQ ID NO：1～16所示。4.根据权利要求1所述的黄鳍鲷微卫星家系鉴定的方法，其特征是：步骤(4)中8重PCR体系包括：浓度为10μmol/L的引物对Y1 0.5μL、浓度为10μmol/L的引物对Y2 0.3μL、浓度为10μmol/L的引物对Y3 0.4μL、浓度为10μmol/L的引物对Y4 0.5μL、浓度为5μmol/L的引物对Y6 0.5μL、浓度为5μmol/L的引物对Y8 0.6μL、浓度为5μmol/L的引物...

【专利技术属性】
技术研发人员：李勇，李水生，郭建谊，张晋，盘润洪，张勇，古群红，李桂峰，罗志平，
申请(专利权)人：中山大学，
类型：发明
国别省市：