快速筛选小鼠mmu-miR-25-3p与启动子结合靶点的方法技术

本发明专利技术公开一种快速筛选小鼠mmu

【技术实现步骤摘要】
快速筛选小鼠mmu
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miR
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25
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3p与启动子结合靶点的方法


[0001]本专利技术属于生物医学
，具体设涉及一种快速筛选小鼠mmu
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miR
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25
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3p与启动子结合靶点的方法。

技术介绍

[0002]microRNAs(miRNAs)是一种小的，类似于siRNA的分子，由高等真核生物基因组编码，miRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。miRNAs在物种进化中相当保守，在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达，miRNA组织特异性和时序性，决定组织和细胞的功能特异性，表明miRNA在细胞生长和发育过程的调节过程中起多种作用。目前对于microRNAs的研究越来越被重视，其对于很多疾病的诊断有着重大价值。
[0003]启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种快速筛选小鼠mmu
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miR
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3p与启动子结合靶点的方法，其特征在于，包括如下步骤：S1、下载小鼠最新基因组序列和对应的注释文件，以及小鼠mmu
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3p序列文件；S2、在计算机中，将小鼠最新基因组序列对应的注释文件由gff格式转换为bed格式；从下载的小鼠最新基因组序列中提取小鼠最新基因组序列的染色体长度，并由此从小鼠最新基因组序列和对应的注释文件中提取启动子的序列；S3、通过seedVicious软件筛选小鼠mmu
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3p序列与S2提取的启动子序列，保留与miRNA种子序列完全匹配靶标的种类，获得mmu
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3p与启动子靶标的预测结果。2.根据权利要求1所述的快速筛选小鼠mmu
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miR
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【专利技术属性】
技术研发人员：蒋澜，王祖贞，吕坤，童九翠，杨建课，冯翔，邓汉诺，罗天乐，汪乐瑶，杜金锐，
申请(专利权)人：皖南医学院第一附属医院皖南医学院弋矶山医院，
类型：发明
国别省市：