用于H7N9病毒全基因组扩增的通用型引物组及应用制造技术

本发明专利技术涉及基因工程技术领域，尤其是涉及用于H7N9病毒全基因组扩增的通用型引物组及应用。本发明专利技术提供的引物组的扩增区域包含包括PB1、PB2、PA、HA、NP、NA、MP和NS在内的至少8个H7N9病毒全基因组中的不同区域，将扩增得到的8节段基因组进行拼接即可得到H7N9病毒的全基因组，由于不同亚型的H7N9病毒之间往往在每一节段基因组序列上的差异并不明显，因此，经过分区域扩增再拼接的方法，能够对多种不同亚型的H7N9病毒实现扩增。的H7N9病毒实现扩增。的H7N9病毒实现扩增。

【技术实现步骤摘要】
用于H7N9病毒全基因组扩增的通用型引物组及应用


[0001]本专利技术涉及基因工程
，尤其是涉及用于H7N9病毒全基因组扩增的通用型引物组及应 用。

技术介绍

[0002]流感病毒正粘病毒科，目前已有三种型别，分别是A型流感病毒，B型流感病毒和C型流感病 毒，其中以A型流感病毒最为常见。A型流感病毒可根据表面蛋白血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA) 进一步划分为17个HA亚型和10个NA亚型。水禽是A型流感病毒的天然宿主，H1至H16，N1 至N9亚型的流感病毒均可以在水禽中发现。流感病毒通过表面蛋白HA和NA的点突变以及不同 亚型病毒之间的基因重配而发生抗原漂变，产生新型流感病毒，其中一些跨越宿主屏障感染缺乏免 疫保护的人类，并且获得在人际间传播的能力，引起流感大流行。
[0003]据统计，H7N9病毒存在多种亚型。一些实验研究结果显示一些H7N9亚型禽流感病毒获得了与 人上呼吸道受体结合特性，这有可能增加病毒在人际中的传播能力，并且在人类和家禽宿主中均呈 现出高致病性趋势。
[0004]通过测序获得病毒的基因组信息有利本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于H7N9病毒全基因组扩增的通用型引物组，其特征在于，所述引物组包括至少8个分别扩增H7N9病毒全基因组不同区域的引物对，所述不同区域包括PB1、PB2、PA、HA、NP、NA、MP和NS。2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，扩增PB1区域的引物对选自引物对1、引物对2或引物对3中的至少一种；扩增PB2区域的引物对选自引物对4、引物对5或引物对6中的至少一种；扩增PA区域的引物对选自引物对7、引物对8或引物对9中的至少一种；扩增HA区域的引物对选自引物对10、引物对11或引物对12中的至少一种；扩增NP区域的引物对选自引物对13和/或引物对14；扩增NA区域的引物对选自引物对15和/或引物对16；扩增MP区域的引物对选自引物对17、引物对18或引物对19中的至少一种；扩增NS区域的引物对选自引物对20和/或引物对21。3.根据权利要求2所述的引物组，其特征在于，所述PB1区域引物对1上游引物的特征序列包括：ATGGATGTCAATCCGACT；所述PB1区域引物对1下游引物的特征序列包括：CCAGATTGCTCAAGTTTC和/或CCAGACTGCTCAAGTTTC；所述PB1区域引物对2上游引物的特征序列包括：TCGTGTATTTTGTAGAAGC和/或TCGTGTATTTCGTAGAAGC；所述PB1区域引物对2下游引物的特征序列包括：ACTCCAAAACTGGGCAACT；所述PB1区域引物对3上游引物的特征序列包括：GCTTTTTCTACCGCTATGG；所述PB1区域引物对3下游引物的特征序列包括：CACTATTTTTGCCGTCTGA；所述PB2区域引物对4上游引物的特征序列包括：ATGGAAAGAATAAAAGAACT；所述PB2区域引物对4下游引物的特征序列包括：TGATACAGTTGCTCTTCTAA、TGACACAGTTGCTCTTCTAA、TGATACTGTTGCTCTTCTAA、TGACACTGTTGCTCTTCTAA、TGATACAGTTGCCCTTCTAA、TGACACAGTTGCCCTTCTAA、TGATACTGTTGCCCTTCTAA或TGACACTGTTGCCCTTCTAA中至少一种；所述PB2区域引物对5上游引物的特征序列包括：AGAGTTTAATTATTGCTGCT；所述PB2区域引物对5下游引物的特征序列包括：TGTTTCACTAACCTCTTCAG、TGTTTCACTAACCTCCTCAG、TGTTTCACTAACCTCTTCGG或TGTTTCACTAACCTCCTCGG中至少一种；所述PB2区域引物对6上游引物的特征序列包括：CGTTTCTTAAGGGTTCGAG、CGTTTCTTGAGGGTTCGAG、CGTTTCTTAAGGGTCCGAG或CGTTTCTTGAGGGTCCGAG中至少一种；所述PB2区域引物对6下游引物的特征序列包括：TTAATTGATGGCCATCCGA；所述PA区域引物对7上游引物的特征序列包括：ATGGAAGACTTTGTGCGA；所述PA区域引物对7下游引物的特征序列包括：CAATGCAGCCGTTCGGTT；所述PA区域引物对8上游引物的特征序列包括：ACCGAACTTCTCCAGCCT；所述PA区域引物对8下游引物的特征序列包括：AGTTGAAAGTCATCCATG；所述PA区域引物对9上游引物的特征序列包括：AGAGCTACTGAATATATAA、AGAGCTACTGAGTATATAA、AGAGCTACTGAATACATAA、AGAGCTACTGAGTACATAA、AGGGCTACTGAATATATAA、AGGGCTACTGAGTATATAA、AGGGCTACTGAATACATAA或AGGGCTACTGAGTACATAA中至少一种；所述PA区域引物对9下游引物的特征序列包括：TGCCACAACTATCTTAGTG；所述HA区域引物对10上游引物的特征序列包括：ATGAACACTCAAATCCTG；所述HA区域引物对10下游引物的特征序列包括：ATTGGGATTTAGTAGTAG、ATTGGGATTTAGTATTAG、ATTGGGATTTAGCAGTAG或ATTGGGATTTAGCATTAG中至少一种；所述HA区域引物对11上游引物的特征序列包括：GAGCGAGACCACAAGTTAA；所述HA区域引物对11下游引物的特征序列包括：
ATTGCTATCAAGAGTTCAG、ATTGCTATCAAGAGTTCTG、ATTGCTACCAAGAGTTCAG或ATTGCTACCAAGAGTTCTG中至少一种；所述HA区域引物对12上游引物的特征序列包括：TGTGATAAAGTGGACCAGAGAT和/或TGTGATAAATTGGACCAGAGAT；所述HA区域引物对12下游引物的特征序列包括：TTATATACAAATAGTGCACCGC；所述NP区域引物对13上游引物的特征序列包括：ATGGCGTCTCAAGGCACCAAACGA；所述NP区域引物对13下游引物的特征序列包括：GCATTCCCAG...

【专利技术属性】
技术研发人员：沈林，朱兆奎，张春雷，柴燕群，
申请(专利权)人：上海伯杰医疗科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：