肠道菌群移植的群组配型方法、系统、设备及存储介质技术方案

本发明专利技术涉及肠道菌群移植技术领域，公开了一种肠道菌群移植的群组配型方法、系统、设备及存储介质，所述方法包括：获取肠道菌群的数据样本集；所述数据样本集包括待配型的受体和供体数据；对所述数据样本集进行聚类分析，得到若干菌群聚类簇；从每个菌群聚类簇内选择若干受体，并计算距离若干所述受体最近的供体，组成受体和供体的配型对。本发明专利技术无需标注训练数据，大大节约了成本，而且通过聚类方法能够得到形状不规则的聚类簇，不需要事先给定聚类簇数量，方便快捷，而且通过簇内计算，能够大大提高配型效率。提高配型效率。提高配型效率。

【技术实现步骤摘要】
肠道菌群移植的群组配型方法、系统、设备及存储介质


[0001]本专利技术涉及肠道菌群移植
，特别是涉及一种肠道菌群移植的群组配型方法、系统、计算机设备及可读存储介质。

技术介绍

[0002]粪菌移植(Human Microbiota Transplantation，HMT或FMT)，又称为肠道菌群移植，其定义是健康人类粪便中的功能菌群，移植到患者胃肠道内，重新建立新的肠道菌群，实现肠道及肠道外疾病的治疗。
[0003]在进行肠道菌群移植时，需要对供体和受体的数据进行精准配型。目前的精准配型方法大都基于有监督学习(supervised learning)，通过一定训练数据去训练生产AI匹配模型，然后通过AI匹配模型进行精准配型，然而，基于有监督学习的方法，为了生成AI匹配模型，需要大量的训练数据去训练，而训练数据有需要高水平和实践经验丰富的相关科研人员去标注，成本较高。并且目前的精准配型方法是单个受体跟所有供体进行匹配，效率低下。
[0004]因此，现有技术还有待进一步提升和改进。

技术实现思路
<br/>[0005]本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种肠道菌群移植的群组配型方法，其特征在于，所述方法包括：获取肠道菌群的数据样本集；所述数据样本集包括待配型的受体和供体数据；对所述数据样本集进行聚类分析，得到若干菌群聚类簇；从每个菌群聚类簇内选择若干受体，并计算距离若干所述受体最近的供体，组成受体和供体的配型对。2.根据权利要求1所述的肠道菌群移植的群组配型方法，其特征在于，所述通过对所述数据样本集进行聚类分析，得到若干菌群聚类簇的步骤包括：通过DBSCAN算法对所述数据样本集进行聚类分析，得到若干菌群聚类簇。3.根据权利要求2所述的肠道菌群移植的群组配型方法，其特征在于，所述通过DBSCAN算法对所述数据样本集进行聚类分析，得到若干菌群聚类簇的步骤包括：确定所述数据样本集中每个数据点的EPS邻域；统计每个数据点的EPS邻域内数据点数目，并将所述数据点数目超过密度阈值的数据点作为核心点；将所述核心点中多个密度可达的核心点组成菌群聚类簇。4.根据权利要求1所述的肠道菌群移植的群组配型方法，其特征在于，所述从每个菌群聚类簇内选择若干受体，并计算距离至少一个所述受体最近且等数量的供体的步骤包括：在每个菌群聚类簇内，根据闵可夫斯基距离，计算若干所述受体距离最近的供体，组成若干一对一的配型对。5.一种肠道菌群移植的群组配型系统，其特征在于，所述系统包括：数据采集模块，用于获取肠道菌群的数据样本集；所述数据样本集包括待配型的受...

【专利技术属性】
技术研发人员：王科，黄伟斌，
申请(专利权)人：广州保量医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：