一种流行病学本体数据库建立方法技术

本发明专利技术公开了一种流行病学本体数据库建立方法，自定义本体数据库模块，用于储存流行病学本体数据；数据库调用模块，用于将自定义本体数据库模块加载至调查表单中，为特定字段设置相应的本体数据库，实现在调查过程中或数据输入过程中，在对应字段内进行自定义本体数据库模块的实时调用与检索；即时标记模块，通过基于JSON格式的数组查找功能实时获取并匹配与输入内容相符的本体数据，用本体数据对输入的原始数据进行即时标记和匹配；数据储存管理模块，将即时标记模块标注好的本体数据存储在自定义本体数据库模块中，实现本体数据的标准化质控。本发明专利技术实现方式简单、高效，便于研究者广泛应用，对提升流行病学研究工作中数据标准化质量具有重要作用。准化质量具有重要作用。准化质量具有重要作用。

【技术实现步骤摘要】
一种流行病学本体数据库建立方法


[0001]本专利技术属于数据库
，具体涉及一种流行病学本体数据库建立方法。

技术介绍

[0002]本体即对某领域中某个对象的规范说明，一系列对象及其本体的映射关系的集合即为本体资源库，本体资源库的构建对于数据标准化和数据流通至关重要。通过构建本体资源库，可以将复杂的专业术语间的关系梳理清楚，采用统一的标准化术语作为本体，对元数据进行描述和标记，元数据之间可通过本体实现高效地索引、整合，进而进行充分的数据挖掘与分析。
[0003]在流行病学领域，国内外研究者们和相关机构先后建设了一系列本体资源库供研究者使用，如Gene Ontology(GO)、CBioPortal、EpidemiologyOntology(EPO)、Genomic Epidemiology Ontology(GenEpiO)、ExposureOntology(ExO)、MedPortal等。然而，这些资源库更加侧重于提供权威的专业术语的精确定义，在功能上仅支持基本的查询和索引，更多地起到“词典”的作用，使用方式较为低效，多在数据收本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种流行病学本体数据库建立方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、采用PHP+JavaScript编程语言制作自定义本体数据库模块和及时标记模块，通过及时标记模块的交互操作界面实现向自定义本体数据库模块中输入指定的本体数据并赋予对应键值；S2、基于MySQL数据库搭建数据储存管理模块，基于REDCap平台编译制作数据库调用模块，数据库调用模块通过建立与数据储存管理模块的安全通讯，实现本机/远程的自定义本体数据库模块实时调用和标准化标注，完成流行病学本体数据库建立。2.根据权利要求1所述的流行病学本体数据库建立方法，其特征在于，步骤S1中，自定义本体数据库模块用于储存流行病学本体数据；即时标记模块通过基于JSON格式的数组查找功能实时获取并匹配与输入内容相符的本体数据，用流行病学本体数据对输入的原始数据进行即时标记和匹配。3.根据权利要求1或2所述的流行病学本体数据库建立方法，其特征在于，步骤S1中，自定义本体数据库模块嵌入设置在电子数据收集系统REDCap中，自定义本体数据库模块根据本体映射规则对自定义本体和元数据进行匹配，生成自定义本体数据库，利用及时标记模块对自定义本体数据库的本体数据进行实时标记和自动匹配，利用数据储存管理模块将标记好的本体数据存储在自定义本体数据库中，实现本体数据的标准化质控。4.根据权利要求3所述的流行病学本体数据库建立方法，其特征在于，本体映射规则如下：采用值列表方式对匹配规则进行罗列，采用条形分隔符隔开将本体与元数据分隔开，使用JSON数组对匹配规则进行描述。5.根据权利要求1所述的流行病学本体数据库建立方法，其特征在于，步骤S1中，即时标记模块包括：本体数据库检索模块，在调用字段数据时，电子数据收集系统R...

【专利技术属性】
技术研发人员：米白冰，闫淼佳，吴立晨，徐坤，刘叶舟，党少农，
申请(专利权)人：西安交通大学，
类型：发明
国别省市：