【技术实现步骤摘要】
一种基于宏基因组测序的游离核酸建库方法
[0001]本专利技术涉及宏基因组检测领域,具体涉及一种基于宏基因组测序的游离核酸建库方法。
技术介绍
[0002]感染性疾病是世界范围内导致人类死亡的主要原因之一。传统的病原体检测方法主要受限于通量低,时间长,灵敏度低。新兴的宏基因组二代测序可一次性检测样本中的未知、罕见、不典型等所有病原体,提示耐药基因和毒力因子,且具有最高的阴性预测值,适用于疑难危重症病例病原体的快速诊断、新发和罕见病原体的发现,以及“排除”感染。
[0003]随着宏基因组测序技术的不断发展,其在临床疑难感染性疾病诊断方面的应用越来越广泛,广泛用于败血症、脑膜炎、脑炎等感染性疾病。其中对于血流感染患者,如果使用全血进行核酸提取及建库,虽然包括了最全面的病原信息,但是大量的人源基因会掩盖了极微量的病原微生物信息,同时游离短片段容易丢失,降低了有效病原体检出。如果用血浆中的游离核酸检测,虽然克服了全血样本中大量红细胞、血红素、白细胞干扰的检测,但是也会有部分血液细胞内病原微生物的丢失,这在一定程度上降低了准确 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种基于宏基因组测序的游离核酸建库方法,其特征在于,所述方法包括样本前处理、样本破壁处理、样本核酸提取和样本核酸文库构建步骤;所述样本为无细胞体液样本;所述样本破壁处理是将样本置于匀浆机中进行3个循环的破壁处理。2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述无细胞体液样本为血浆或脑脊液。3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,样本前处理时,当所述样本为血浆时,在血浆样本中加入全血,且全血与血浆的体积比为1:50至3:50。4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述全血与血浆的体积比为2:50。5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,样本核酸...
【专利技术属性】
技术研发人员:余艳,许寻寻,代冰,唐春燕,葛虎,谭兵健,谢琴,
申请(专利权)人:长沙金域医学检验实验室有限公司,
类型:发明
国别省市:
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