SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用制造技术

本发明专利技术涉及植物分子育种技术领域，特别是涉及SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用。本发明专利技术通过确定两个SNP位点的基因型组合能够准确地评价杨树树干皮孔特征，在杨树生长的早期高效、准确地筛选树皮光滑美观的毛白杨新品种，缩短园林绿化毛白杨选育周期。缩短园林绿化毛白杨选育周期。缩短园林绿化毛白杨选育周期。

【技术实现步骤摘要】
SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用


[0001]本专利技术涉及植物分子育种
，特别是涉及SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用。

技术介绍

[0002]毛白杨是我国特有的珍贵乡土树种，在我国北方城乡绿化中占有重要地位。洁白光滑的树皮是毛白杨区别于其它杨树树种的显著特征，该特征也使毛白杨在园林绿化中更加美观。皮孔是树木枝干表面肉眼可见的裂缝凸起，在树木茎干与外界进行气体交换过程中起重要作用。皮孔在毛白杨光滑的树皮上更加显著，是选育美观园林绿化毛白杨的重要指标。其中，单个皮孔的面积和单位面积内皮孔的数目作为影响毛白杨树皮表现的关键因子，是衡量城乡园林绿化毛白杨新品种美观与否的重要因素。
[0003]毛白杨树干的皮孔是一个多年生性状，表现出随着树龄增长逐渐变化的特点，在毛白杨生长7～8年后才表现出明显的个体差异。在传统的毛白杨新品种选育过程中，对于皮孔特征的选择只能通过人工肉眼观测的方法进行，而限于皮孔在林木幼龄期不显著的特点，使该方法难以在新品种早期选育中对毛白杨皮孔特征进行选择。特别是随着我国对生态文明建设的推进，对城乡园林绿化树种新品种的选育提出了更加精细化的要求，而粗放的传统选育方法很难满足毛白杨树干皮孔特征的精准选育。因此，针对城乡园林绿化需求，开发特定皮孔性状的定向分子辅助育种技术可显著提高目标性状的选育精度，缩短育种周期，是城乡园林绿化树种大规模工业应用中急需解决的核心育种技术。

技术实现思路

[0004]为了解决上述问题，本专利技术提供了SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用。本专利技术提供的SNP位点的基因型组合可以在毛白杨生长的早期高效、准确筛选特定皮孔性状的城乡园林绿化毛白杨，有效缩短育种周期。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术提供如下技术方案：
[0006]本专利技术提供了SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用，所述SNP位点包括SNP1和SNP2；
[0007]所述SNP1在SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列的第1262位存在T/C多态性；
[0008]所述SNP2在SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列的第3477位存在G/A多态性；
[0009]所述SNP1的基因型包括CC、TT和TC；
[0010]所述SNP2的基因型包括AA、GG和GA；
[0011]以毛白杨样品树干面积75cm2计：
[0012]当所述基因型组合为CC
‑
AA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2，皮孔数目≤8个；
[0013]当所述基因型组合为CC
‑
GG时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤
0.43cm2，皮孔数目≤8个；
[0014]当所述基因型组合为CC
‑
GA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2，皮孔数目≤8个；
[0015]当所述基因型组合为TT
‑
AA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2，皮孔数目≥12个；
[0016]当所述基因型组合为TT
‑
GG时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2，皮孔数目≥12个；
[0017]当所述基因型组合为TT
‑
GA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2，皮孔数目≥12个；
[0018]当所述基因型组合为TC
‑
AA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2，皮孔数目大于8个且小于12个；
[0019]当所述基因型组合为TC
‑
GG时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2，皮孔数目大于8个且小于12个；
[0020]当所述基因型组合为TC
‑
GA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2，皮孔数目大于8个且小于12个。
[0021]本专利技术还提供了一种评价毛白杨树干皮孔表型的引物组，所述引物组包括：鉴定上述应用中SNP1基因型的引物组一和鉴定上述应用中SNP2基因型的引物组二；
[0022]所述引物组一包括引物对一和引物对二；所述引物对一包括Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
TF和Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
R；所述引物对二包括Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
CF和Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
R；
[0023]所述引物组二包括引物对三和引物对四；所述引物对三包括Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
GF和Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
R；所述引物对四包括Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
AF和Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
R；
[0024]所述Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
TF的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；
[0025]所述Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
CF的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；
[0026]所述Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；
[0027]所述Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
GF的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；
[0028]所述Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
AF的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；
[0029]所述Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。
[0030]本专利技术还提供了一种评价毛白杨树干皮孔表型的试剂盒，所述试剂盒包括上述的引物组。
[0031]本专利技术还提供了上述引物组或上述试剂盒在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用。
[0032]本专利技术还提供了一种评价毛白杨树干皮孔表型的方法，包括以下步骤：
[0033]1)测定毛本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用，其特征在于，所述SNP位点包括SNP1和SNP2；所述SNP1在SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列的第1262位存在T/C多态性；所述SNP2在SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列的第3477位存在G/A多态性；所述SNP1的基因型包括CC、TT和TC；所述SNP2的基因型包括AA、GG和GA；以毛白杨样品树干面积75cm2计：当所述基因型组合为CC
‑
AA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2，皮孔数目≤8个；当所述基因型组合为CC
‑
GG时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2，皮孔数目≤8个；当所述基因型组合为CC
‑
GA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2，皮孔数目≤8个；当所述基因型组合为TT
‑
AA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2，皮孔数目≥12个；当所述基因型组合为TT
‑
GG时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2，皮孔数目≥12个；当所述基因型组合为TT
‑
GA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2，皮孔数目≥12个；当所述基因型组合为TC
‑
AA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2，皮孔数目大于8个且小于12个；当所述基因型组合为TC
‑
GG时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2，皮孔数目大于8个且小于12个；当所述基因型组合为TC
‑
GA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2，皮孔数目大于8个且小于12个。2.一种评价毛白杨树干皮孔表型的引物组，其特征在于，所述引物组包括：鉴定权利要求1所述应用中SNP1基因型的引物组一和鉴定权利要求1所述应用中SNP2基因型的引物组二；所述引物组一包括引物对一和引物对二；所述引物对一包括Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
TF和Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
R；所述引物对二包括Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
CF和Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
R；所述引物组二包括引物对三和引物对四；所述引物对三包括Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
GF和Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
R；所述引物对四包括Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
AF和Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
R；所述Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
TF的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
CF的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述Pto
‑
NAC83
‑
1885
‑
R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
GF的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；所述Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
AF的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；所述Pto
‑
MYB46
‑
610
‑
R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。3.一种评价毛白杨树干皮孔表型的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求2所
述的引物组。4.权利要求2所述引物组或权利要求3所述试剂盒在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用。5.一种评价毛白杨树干皮孔表型的方法，其特征在于，包括以下步骤：1)测定毛白杨样品基因组DNA中两个SNP位点的基因型；所述两个SNP位点包括SNP1和SNP2；所述SNP1在SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列的第1262位存在T/C多态性；所述SNP2在SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列的第3477位存在G/A多态性；所述SNP1的基因型包括CC、TT和TC；所述SNP2的基因型包括AA、GG和GA；2)根据步骤1)中确定的基因型组合判断毛白杨树干的皮孔特征；以毛白杨样品树干面积75cm2计：当所述基因型组合为CC
‑
AA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2，皮孔数目≤8个；当所述基因型组合为CC
‑
GG时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2，皮孔数目≤8个；当所述基因型组合为CC
‑
GA时，则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2，皮孔数目≤8个；当所述基因型组合为TT
...

【专利技术属性】
技术研发人员：张德强，李鹏，
申请(专利权)人：北京林业大学，
类型：发明
国别省市：