宏病毒组新病毒鉴定方法技术

技术编号:32971025 阅读:34 留言:0更新日期:2022-04-09 11:37
本发明专利技术公开了一种宏病毒组新病毒鉴定方法,本发明专利技术涉及基因检测域。该宏病毒组新病毒鉴定方法,通过DNA提取:准备检测提取的不同的环境样品,以及环境样品的数量,并将取得的同质量的样品制备成菌液样本,将制备的若干份菌液样本进行DNA提取,使其满足宏基因组测序要求;连接接头序列:对待测基因组的DNA进行纯化处理,并对纯化后的DNA连接接头序列获得连接产物;文库制备、用引物对连接的DNA片段进行扩增,获得DNA测序文库、上机测序;能够无需通过微生物的分离纯化培养,就能够更加深入地对群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等方面进行研究,同时通过多组对比参数数据,提升了鉴定、研究效果。研究效果。研究效果。

【技术实现步骤摘要】
宏病毒组新病毒鉴定方法


[0001]本专利技术涉及基因检测域,具体为一种宏病毒组新病毒鉴定方法。

技术介绍

[0002]宏基因组、也称微生物环境基因组MicrobialEnvironmentalGenome、或元基因组,是由Handelsman等在1998年提出的新名词,其定义为“thegenomesof the total microbiota found in nature”,即环境中全部微小生物遗传物质的总和,它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和,宏病毒组是在宏基因组理论的基础上,结合病毒的概念和技术兴起的新的学科分支。宏病毒组以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,用于鉴定环境中的病毒组成、发现新病毒、病毒溯源等。
[0003]而获得宏病毒组DNA,是对准确鉴定、分析环境中病毒群落组成等研究的必要条件,而在进行DNA提取的过程中,由于其内部的杂质以及提取方法会影响生物细胞的有效裂解,易导致测序结果出现偏差,且需要得到多种实验数据、对比参数需要进行的提取较为繁琐,使得对比参数较为单一本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种宏病毒组新病毒鉴定方法,具体包含以下步骤:S1、DNA提取:准备检测提取的不同的环境样品,以及环境样品的数量,并将取得的同质量的样品制备成菌液样本,将制备的若干份菌液样本进行DNA提取,使其满足宏基因组测序要求;S2、连接接头序列:对待测基因组的DNA进行纯化处理,并对纯化后的DNA连接接头序列获得连接产物;S3、文库制备:用引物对连接的DNA片段进行扩增,获得DNA测序文库;S4、上机测序:将DNA文库先经过qubit测定DNA浓度、qPCR测定DNA文库摩尔浓度、Bioanalyzer分析DNA分子片段大小等检测后,确定DNA库准确的分子摩尔量,按照DNA分子摩尔比例分配每个样本的上机测序数据。2.根据权利要求1所述的一种宏病毒组新病毒鉴定方法,其特征在于:所述S2中连接接头序列,对纯化后的待测基因组的DNA内加入适量助沉剂,得到待片段化的样本,而后通过对其片段化得到DNA片段。3.根据权利要求2所述的一种宏病毒组新病毒鉴定方法,其特征在于:将得到的所述DNA片段置于超声清洗设备中,通过超声清洗设备对其进行DNA破碎至片段大小500bp。4.根据权利要求3所述的一种宏病毒组新病毒鉴定...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨作坤
申请(专利权)人:武汉百奥维凡生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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