【技术实现步骤摘要】
用于检测癌症中的微卫星不稳定性和DNA碱基切除修复途径抑制的合成致死性的新标记
[0001]本申请是申请日为2013年04月10日、专利技术名称为“用于检测癌症中的微卫星不稳定性和测定与DNA碱基切除修复途径抑制的合成致死性的新标记”的中国专利申请201380030379.4(国际申请号PCT/EP2013/057516)的分案申请。
[0002]本申请涉及癌症、尤其是错配修复(MMR
‑
)缺陷肿瘤领域。本文提供对检测肿瘤是否为错配修复缺陷具有高敏感性的新标记。该标记尤其是微卫星区域中的突变。因此,提供用于诊断肿瘤的微卫星不稳定性的方法,其包括测定这些标记的存在。此外,提供试剂盒来检测这些标记(或其亚组)在样品中的存在。
[0003]有趣地,突变优先影响通过同源重组(HR)途径的双链断裂(DSB)修复,DSB修复在MMR缺陷肿瘤中功能上受损。本文中显示,这些肿瘤对通过酶聚ADP核糖聚合酶的药理学抑制(PARP抑制)诱导单链断裂敏感。因此,基于MMR和PARP之间的合成致死相互作用,提供用于MMR缺陷肿瘤的新 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.对包含存在于来自表3中所列基因的外显子中和/或5
’
UTR区或3
’
UTR区中的至少三个微卫星区域的生物标志系列进行基因型分型的寡核苷酸工具的用途,用于制备测定肿瘤样品中MSI状态的试剂盒,包括测定指示MSI状态的插入/缺失在肿瘤DNA样品中的至少三个微卫星区域中的存在,其中所述至少三个微卫星区域的每一个都是具有八(8)个单核苷酸碱基的最小长度和十二(12)个单核苷酸碱基的最大长度的单核苷酸重复,其中肿瘤选自结直肠癌、子宫内膜癌、卵巢癌、胃癌、白血病和Lynch综合症的肿瘤。2.如权利要求1所述的用途,其中所述至少三个微卫星区域的每一个都是具有九(9)个单核苷酸碱基的最小长度,和十一(11)个单核苷酸碱基的最大长度的单核苷酸重复。3.如权利要求1或2所述的用途,其中所述寡核苷酸工具包含寡核苷酸探针或寡核苷酸引物,其对于所述存在于来自表3中所列基因的外显子和/或5
’
UTR或3
’
UTR区中的至少三个微卫星区域是特异性的。4.如权利要求1
‑
3任一项所述的用途,其中所述至少三个单核苷酸重复是选自如表3中所列的基因MYL1、DIDO1、UBE2Z、RYR3、TMEM65、BTBD7、KDM5A、ABAT4、PPM1A、UBA6、ZNF185、ARL10、GRIA2和TMC7。5.如权利要求4所述的用途,其中所述至少三个单核苷酸重复是选自如表3中所列的基因MYL1、DIDO1、UBE2Z、RYR3、TMEM65、BTBD7、KDM5A、ABAT4、PPM1A、UBA6和ZNF185。6.如权利要求1
‑
5任一项所述的用途,其中所述至少三个微卫星区域是存在于来自表3中所列基因的5
’
UTR或3
’
UTR区中的区域。7.如权利要求1
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6任一项所述的用途,其中所述至少三个微卫星区域是至少八个微卫星区域。8.如权利要求7所述的用途,其中所述至少八个微卫星区域是存在于来自表3中所列基因的外显子和/或5
’
UTR或...
【专利技术属性】
技术研发人员:D,
申请(专利权)人:生命科学研究合伙人公司,
类型:发明
国别省市:
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