【技术实现步骤摘要】
一种核酸扩增结果判定方法
[0001]本专利技术涉及核酸检测
，具体涉及一种核酸扩增结果判定方法。
技术介绍
[0002]核酸扩增和检测技术是当今生物学研究的重要手段之一，包括生物技术、基础科学、医学研究等在内的各领域的科学家们用这种方法进行广泛的应用研究。核酸扩增技术包括常规PCR、实时荧光PCR、数字PCR以及目前临床伴随诊断(POCT)技术流行的恒温扩增技术，如LAMP、CPA技术等。这类方法会产生大量的原始数据值，数据处理方法的不同可能会显著的影响最终的结果。
[0003]核酸扩增技术常用于用于基因表达的定量分析，或者是常见传染病的定性检测，核酸检测目前是新型冠状病毒检测的“金标准”，具有早期诊断、灵敏度和特异性高等特点。在实时荧光PCR中，模板的定量有两种方法：相对定量和绝对定量。
[0004]绝对定量指用已知的标准曲线来推算未知的样本量。分析的结果是给定数量的样品中(给定数量的细胞，每微克总RNA)中核酸的量(拷贝数、微克)。相对定量的分析结果是在相当量的试验组(样品A)和对照组(样品B)中...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种核酸扩增结果判定方法，其特征在于，包括以下步骤：获取不同循环数的荧光强度数据，并对荧光强度数据进行曲线拟合，得到拟合函数；根据粒子群优算法计算拟合函数的最优参数，将最优参数代入拟合函数，并对拟合函数进行一阶导数求解；根据所述一阶导数，通过求导计算荧光信号上升或下降的连续次数，并根据荧光信号上升或下降的连续次数确定扩增区间；对所述一阶导数计算二阶导数，并得出二阶导数的最大值的解和最大解对应的时间T；判断时间T是否在扩增区间内，若是，则判定时间T即为C
t
值，并根据样本定义阈值，判断扩增结果；若否，则判断时间T与扩增区间的位置关系；若时间T位于扩增区间的起始位置之前，则直接定义C
t
值为一分钟位置，且扩增结果为阳性；若时间T位于扩增区间的结束位置之后，则直接定义C
t
值为四十分钟位置，且扩增结果为阴性。2.根据权利要求1所述的一种核酸扩增结果判定方法，其特征在于，根据粒子群优算法计算拟合函数的最优参数，包括以下步骤：初始化荧光信号所形成的粒子群，将粒子群分为若干个局部子集，并对局部子集进行迭代计算，得到结果子集，并将所述结果子集存储于最优参数集内。3.根据权利要求2所述的一种核酸扩增结果判定方法，其特征在于，对局部子集进行迭代计算，包括以下步骤：设定学习率α和参数θ的初始值，并通过模型计算粒子当前位置所对应的目标位置，同时计算损失函数；根据适应度函数计算粒子个体的适应值；将所述损失函数沿参数θ的负梯度方向更新，并得到损失函数最小值；计算粒子个体的局部最优位置向量和粒子群的全局最优向量，并根据损失函数分别更新粒子个体的速度向量和位置向量；根据所述粒子个体的速度向量和位置向量，更新粒子个体的局部位置向量和全局位置向量，并存入结果子集中；判断更新后的局部子集的损失函数的大小，得到更优解，并将最优解存入最优参数集；判断粒子群是否满足参数优化后的终止条件，若满足，则停止迭代计算；若不满足，则重新设定学习率并重新计算粒子个体的适应值。4.根据权利要求3所述的一种核酸扩增结果判定方法，其特征在于，所述损失函数的公式为：其中，J(θ)为损失函数；m代表样本个数；i代表m个样本中的第i个；h
θ
(t...
【专利技术属性】
技术研发人员：周艳琼，罗凯，尤其敏，帅金晓，林艺志，
申请(专利权)人：杭州优思达生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
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