【技术实现步骤摘要】
核酸斑点杂交法检测PSTVd的探针及其制备方法、试剂盒与检测方法
[0001]本专利技术属于马铃薯病毒检测
,尤其涉及核酸斑点杂交法检测PSTVd的探针及其制备方法、试剂盒与检测方法。
技术介绍
[0002]马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato Spimdle Tuber Viroid,简称PSTVd),是引起马铃薯纺锤块茎病的原因,属于世界性检疫病害,易感染,易传播。据报道,PSTVd强系可使马铃薯减产达60%,弱系减产约20~35%,常造成较大的经济损失。PSTVd不能通过茎尖剥离、组织培养脱毒,必须通过严格的马铃薯种薯检疫预防和控制其传播。
[0003]目前,PSTVd的检测方法主要为RT
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PCR技术及核酸斑点杂交技术,RT
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PCR对实验条件及技术要求高,普及程度不高。而核酸斑点杂交法具有操作简单易掌握、检测灵敏度高的优点,更易于推广。但现阶段应用的核酸斑点杂交法所使用的探针产量低、成本高,约20μL探针的试剂成本即1600元。受探针成本高昂的影响,每次检测探针用量极 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种核酸斑点杂交法检测PSTVd的探针,其特征在于,所述探针的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。2.一种权利要求1所述核酸斑点杂交法检测PSTVd的探针的制备方法,其特征在于,以PSTVd反转录得到的cDNA为模板,以正向引物PSTVd
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F和反向引物PSTVd
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R为引物组进行非对称PCR扩增,所得209bp扩增产物即为检测PSTVd的探针;所述正向引物PSTVd
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F的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;所述反向引物PSTVd
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R的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,所述反向引物PSTVd
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R的5
’
端标记地高辛或生物素。3.根据权利要求2所述一种核酸斑点杂交法检测PSTVd的探针的制备方法,其特征在于,所述非对称PCR扩增的反应体系为:PSTVd阳性样品DNA 1.0μl,浓度为10uM的正向引物PSTVd
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F 0.1μl、浓度为10uM的反向引物PSTVd
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R 0.5μl,10
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PCR Buffer 2.5μl,浓度为2.5mM的dNTP Mixture 2.0μl,浓度为5U/μl的Taq酶0.3μl和ddH2O 17.2μl;所述非对称PCR扩增的反应程序为:94℃预变性5min,94℃变性30s,54.5℃退火30s,72℃延伸30s,30次循环,72℃终延伸7min,4℃保温。4.一种核酸斑点杂交法检测PSTVd的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的核酸斑点杂交法检测PSTVd的探针。5.根据权利要求4所述一种核酸斑点杂交法检测PSTVd的试剂盒,其特征在于,还包括核酸提取缓冲液、氯仿、杂交液、洗液I、洗液II、洗涤缓冲液、阻断液、抗体液、检测缓冲液、显色反应缓冲液、NBT、BCIP和正电荷尼龙膜方格。6.根据权利要求5所述一种核酸斑点杂交法检测PSTVd的试剂盒,其特征在于,所述抗体液含有抗地高辛碱性磷酸酶复合物或链霉亲和素
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碱性磷酸酶复合物。7.一种核酸斑点杂交法检测PSTVd的方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一、提取、固定核酸:取马铃薯样品按质量体积比与提取缓冲液混合、研磨,将研磨所得混合体系置于37℃条件下完成孵育,加入氯仿旋涡震荡使其充分混合,离心所得上清液即为核酸溶液,取所得核酸溶液点样于正电荷尼龙膜的方格中,室温干燥后进行紫外交联固定核酸;步骤二、杂交:杂交液预热熔化后加入权利要求1所述检测PSTVd的探针,混匀后将步骤一完成核酸固定的正电荷尼龙膜置于杂交液中,杂交过夜;取出完成杂交的正电荷尼龙膜,依次用洗液I、洗液II和洗涤缓冲液进行洗涤;步骤三、阻断显色:配制1
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阻断液和抗体液,将步骤...
【专利技术属性】
技术研发人员:白艳菊,王腾,张威,刘尚武,黄元炬,马爽,
申请(专利权)人:黑龙江省农业科学院经济作物研究所,
类型:发明
国别省市:
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