【技术实现步骤摘要】
一种识别驱动肿瘤转移关键异质性分子的预测系统
[0001]本专利技术涉及一种识别驱动肿瘤转移关键异质性分子的预测系统,属于医药生物
技术介绍
[0002]据专利技术人所知,恶性肿瘤是严重危害人类健康的重大公共卫生问题,肿瘤耐药和转移是导致肿瘤患者无药可治和生存率低的根本原因之一。肿瘤治疗面临的最大挑战是如何克服肿瘤异质性导致的肿瘤耐药和转移。尽管包括生物疗法和免疫疗法在内的新方法给肿瘤治疗带来了希望,但肿瘤异质性会导致针对单个靶点的治疗难以最终攻克肿瘤,即使在治疗早期有一定疗效,一段时间后往往出现肿瘤细胞耐药或转移,而使得该治疗失效。由于异质性的肿瘤细胞亚群是相互独立的,即使能对一个癌基因或抑癌基因采取最佳干预措施,但同时其它异质性分子并不会受到影响;这些异质性的肿瘤细胞亚群在条件适宜时会因适应宿主体内环境而起主导作用,进而驱动肿瘤转移的发生。
[0003]因异质性驱动的肿瘤耐药和转移导致肿瘤进展是肿瘤研究领域的共识,然而,大多数研究仍在寻找差异表达的分子并证明其确切的上游和下游调控网络和机制,至今还没有一 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种识别驱动肿瘤转移关键异质性分子的预测系统,其特征是,包括输入模块、分析模块以及输出模块;所述输入模块用于输入干预前蛋白定量分析结果以及干预后蛋白定量分析结果,所述干预前蛋白定量分析结果为目标患者在药物干预前肿瘤转移灶的各个蛋白表达量定量分析结果的集合,所述干预后蛋白定量分析结果为目标患者在药物干预后残留肿瘤转移灶的各个蛋白表达量定量分析结果的集合;所述分析模块包括初级分析子模块、二级分析子模块、计算排序子模块;所述初级分析子模块用于初步筛选分析,所述初步筛选分析包括通过比较干预前蛋白定量分析结果和干预后蛋白定量分析结果,将表达量变化幅度处于预设范围内的蛋白列入候选蛋白集合;所述二级分析子模块用于再次筛选分析,所述再次筛选分析包括利用蛋白互作网络分析工具根据候选蛋白集合构建基于实验验证的蛋白互作网络,并结合信号通路数据库中候选蛋白集合涉及的信号通路对蛋白互作网络补充完善,将各个蛋白互作网络中最重要的蛋白作为独立的异质性分子列入独立分子集合,利用蛋白互作网络预测工具根据候选蛋白集合构建基于蛋白互作规律的蛋白互作预测网络、并将候选蛋白集合中未参与任何蛋白互作预测网络的蛋白作为独立的异质性分子列入独立分子集合;所述计算排序模块用于计算排序,所述计算排序包括计算独立分子集合中各异质性分子的HR值,根据HR值对各异质性分子进行排序,并形成各异质性分子的排序列表;所述输出模块用于输出各异质性分子的排序列表。2.根据权利要求1所述的识别驱动肿瘤转移关键异质性分子的预测系统,其特征是,采用蛋白高通量测序获得干预前、后蛋白定量分析结果;所述蛋白高通量测序包括蛋白质谱分析。3.根据权利要求1所述的识别驱动肿瘤转移关键异质性分子的预测系统,其特征是,在初步筛选分析中,表达量变化幅度处于预设范围内的蛋白为干预后蛋白表达量是干预前蛋白表达量的0.95
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1.05倍的蛋白。4.根据权利要求1所述的识别驱动肿瘤转移关键异质性分子的预测系统,其特征是,在初步筛选分析中,对于表达量变化幅度处于预设范围内的蛋白先进行逐步筛选再列入候选蛋白集合,所述逐步筛选为依次筛选出符合以下条件的蛋白:特异性肽段的数量≥2,不属于预测蛋白,已鉴定肽段氨基酸在当前蛋白的覆盖率≥10%,当前蛋白定量次数≥2,当前蛋白测序质量综合评分≥200,数据库有证据证实与肿...
【专利技术属性】
技术研发人员:周建伟,崔佳华,束传军,陈俊杰,李爱萍,
申请(专利权)人:周建伟,
类型:发明
国别省市:
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