一种与稻瘟菌籼粳来源性状连锁的SNP分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与稻瘟菌籼粳来源性状连锁的SNP分子标记及其应用，所述分子标记物的序列为SEQ ID NO.1。本发明专利技术可以通过该SNP分子标记进行分子检测快速鉴定籼型水稻或粳型水稻的稻瘟菌来源，所筛选的特异性引物可对区分稻瘟菌籼、粳稻来源进行良好分型，检测方法简单易行，准确率高达100％。本发明专利技术方法为未知水稻亚种来源的稻瘟菌寄主鉴定提供指导作用，为研究稻瘟菌寄主专化性机制、稻瘟病预测预报和水稻主栽品种布局提供方法依据。和水稻主栽品种布局提供方法依据。和水稻主栽品种布局提供方法依据。

【技术实现步骤摘要】
一种与稻瘟菌籼粳来源性状连锁的SNP分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及一种用于区分稻瘟菌来源的分子标记以应用，特别涉及一种与稻瘟菌籼粳来源性状连锁的SNP分子标记及其应用，属于分子生物学领域。

技术介绍

[0002]稻瘟病是威胁全球水稻生产的重要病害，每年因为稻瘟病造成水稻的损失可以为 6000万人提供粮食。目前主栽的水稻一般分为籼稻和粳稻。在我国，黑龙江、辽宁等北方地区主栽粳稻，湖南、江苏等南方区为籼稻区。由于主栽稻籼、粳亚种的差异，造成了稻瘟菌对籼粳稻的侵染出现了分化。粳稻来源的稻瘟菌一般只能侵染粳稻，不能侵染籼稻；而籼稻来源的稻瘟菌既可以侵染籼稻也可以侵染粳稻。稻瘟菌遗传资源丰富，变异速度快，菌株多样性程度高，通过形态学观察是无法区分菌株的籼、粳寄主来源，只能根据的感病水稻的籼、粳亚型区分。但是，这种区分方式是以寄主发病为前提，已经造成了重要损失。因此，利用分子检测方法，对空气或者田间稻瘟菌侵染类型进行监测，为准确预测稻瘟菌侵染类型提供有效手段。
[0003]虽然稻瘟菌出现籼、粳寄主特异性，但是形成的籼、粳侵染菌株分类地本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与稻瘟菌籼粳来源性状连锁的SNP分子标记，其特征在于：所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。2.根据权利要求1所述的一种与稻瘟菌籼粳来源性状连锁的SNP分子标记，其特征在于：所述的SEQ ID NO.1所示序列自5'端起第1804位碱基为SNP位点，所述的SNP位点位于稻瘟菌基因组第2染色体8019142bp位核苷酸，所述的SNP位点的碱基为A或G。3.根据权利要求1所述的一种与稻瘟菌籼粳来源性状连锁的SNP分子标记，其特征在于，所述的SNP分子标记所对应的特异性引物为：正向引物：5
’‑
TCTAAACACGTGCCTCTGACC
‑3’
反向引物：5<...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴奇，李成云，王一，刘立娜，浦鑫，马婵，
申请(专利权)人：云南农业大学，
类型：发明
国别省市：