一种用于评估蛋白质组还原烷基化效率的质控方法技术

本发明专利技术公开了一种用于评估蛋白质组还原烷基化效率的质控方法，包括以下步骤：（1）还原烷基化之前的任一步骤，在样品中加入含有至少两个半胱氨酸的多肽或蛋白标品，然后进行后续的操作至上机检测；（2）原始数据经软件分析后得到可鉴定肽段，分别找出该标品含有半胱氨酸的肽段以及不含半胱氨酸的肽段，标品还原烷基化率=（含半胱氨酸的肽段峰面积/不含半胱氨酸的肽段峰面积）*100%；（3）根据不同样品中标品还原烷基化率的差异，评估样品的还原烷基化效率。本发明专利技术方法可有效的对还原烷基化效率进行计算并标准化此步骤的质控方式，用于评估同批次不同样本间以及不同批次间还原烷基化的效率，进而辅助评判蛋白质组学的鉴定结果及数据分析。分析。

【技术实现步骤摘要】
一种用于评估蛋白质组还原烷基化效率的质控方法


[0001]本专利技术属于生物
，具体地，涉及一种用于评估蛋白质组还原烷基化效率的质控方法。

技术介绍

[0002]蛋白质组学研究的意义重大，包括对疾病进行早筛分类、对预后进行预判、筛选药物靶点等。然而蛋白质组提取作为蛋白质组学研究中的关键一步，其提取的质量直接影响整个研究过程。
[0003]蛋白质组提取步骤包括样本裂解、提取蛋白、还原烷基化、酶解、除盐等，每个步骤对最终获得的肽段质量都至关重要，尤其还原烷基化如果不够充分，直接影响酶解效率，影响最终肽段的鉴定及定量。目前对于还原烷基化效率的判断依赖于对整体还原烷基化效率进行计算，计算方式为鉴定到的含有半胱氨酸的肽段种类数除以总肽段种类数，最终的结果不能反应含有半胱氨酸的肽段被还原烷基化的比例，因此不能区分整体烷基化效率的差异是样本本身属性还是实验操作所致。目前还没有成熟的系统和标准对还原烷基化实验操作进行质控。

技术实现思路

[0004]专利技术目的：为解决上述技术问题，本专利技术提供了一种用于评估蛋白质组还原烷基化效本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于评估蛋白质组还原烷基化效率的质控方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）还原烷基化之前的任一步骤，在样品中加入含有至少两个半胱氨酸的多肽或蛋白标品，然后进行后续的操作至上机检测；（2）质谱原始数据经软件分析后得到可鉴定肽段，分别找出该标品含有半胱氨酸的肽段以及不含半胱氨酸的肽段，标品还原烷基化率=（含半胱氨酸的肽段峰面积/不含半胱氨酸的肽段峰面积）*100%；（3）根据样品中标品还原烷基化率，评估样品的还原烷基化效率。2.根据权利要求1所述的用于评估蛋白质组还原烷基化效率的质控方法，其特征在于，步骤（1）中，所述多肽或蛋白标品为合成的标准品，酶切后的肽段与样本内源性肽段没有重复。3.根据权利要求1所述的用于评估蛋白质组还原烷基化效率的质控方法，其特征在于，步骤（1...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈亮宇，闫豪杰，宋雷，李捷，
申请(专利权)人：谱天天津生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：