【技术实现步骤摘要】
基于领域本体的癌症用药知识库构建方法、系统及终端
[0001]本专利技术数据处理领域，特别是涉及一种基于领域本体的癌症用药知识库构建方法、系统及终端。
技术介绍
[0002]肿瘤是一类高度异质化的细胞增生性疾病的总称，其异质性是指同一种恶性肿瘤在不同患者个体间（瘤间异质性）或者同一患者体内不同部位（瘤内异质性）组织细胞间，从基因型到表型上存在的差异，体现了恶性肿瘤在演进过程中的高度复杂性和多样性。因此不同肿瘤细胞表现出免疫特性、生长速度、侵袭能力等表型方面的差异，最终导致对不同抗肿瘤药物的敏感性不同或放疗敏感性的差异。
[0003]因此，恶性肿瘤（癌症）的治疗因以个体化医疗为基础的“精准医学(precision medicine)”模式，对形成癌症的肿瘤细胞在发生部位、组织来源、生物分子标志物的变化等多个层面进行系统分析，找到最适合的药物或治疗手段。
[0004]癌症精准用药的核心内容是通过肿瘤细胞的不同生物标志物变化（包括基因突变、基因扩增、基因融合、肿瘤免疫原性和蛋白表达等），因此有针对性的选择特定的抗肿...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种基于领域本体的癌症用药知识库构建方法，其特征在于，所述方法包括：获取由创建的与癌症精准用药本体的目标领域相关的本体框架；其中，所述本体框架包括：一或多个实体类别以及实体关系；所述实体类别包括：药物实体类别、基因实体类别、突变实体类别以及肿瘤实体类别；所述实体关系包括：对应所述基因实体类别和突变实体类别之间的突变与基因实体关系、对应所述突变实体类别和肿瘤实体类别之间的突变与肿瘤实体关系、对应所述肿瘤实体类别和药物实体类别之间的肿瘤与药物实体关系、对应所述药物实体类别以及基因实体类别之间的药物与基因实体关系、对应基因实体类别之间的基因实体关系、对应肿瘤细胞实体类别之间的肿瘤细胞实体关系、对应突变实体类别之间的突变实体关系以及对应药物实体类别之间的药物实体关系中的一种或多种；将癌症精准用药知识数据按照其所属的实体类别依次填入所述本体框架中对应的实体类别中，以构建癌症精准用药知识库；其中，所述突变实体类别的类别包括：用于表示多个生物标志物的组合的TumorCombinationIndex子类、用于表示融合基因突变的FUSMutation子类、用于表示基因或蛋白的异常表达的AbnormalExpression子类、用于表示基因的拷贝数变化的CNVMutation子类以及用于表示改变基因活性的非同义突变的MutationFunction子类中的一种或多种；并且其中，所述MutationFunction子类包括：用于表示在特定转录本特定位置发生的氨基酸变异的MutationAAGroup子类；并且其中，MutationAAGroup子类包括：用于表示具有特定形式的氨基酸突变的MutationAA子类；其中，所述突变实体关系包括：对应MutationAAGroup子类与MutationAA子类之间的实体关系、对应MutationAAGroup子类与MutationFunction子类之间的实体关系以及对应MutationFunction子类与MutationAA子类的实体关系中的一种或多种。2.根据权利要求1中所述的基于领域本体的癌症用药知识库构建方法，其特征在于，所述肿瘤实体类别包括：表示具有特定生物表示物的肿瘤细胞的TumorCells子类以及表示细胞来源的MeshCancerType子类；并且其中，所述MeshCancerType子类包括：对应肿瘤细胞来源的身体部位的BodySite子类以及对应组织来源的Histological子类；其中，肿瘤细胞实体关系包括：Detected_from关系，其定义域为TumorCells类，值域为BodySite子类；和/或，Originated_from关系：其定义域为TumorCells类，值域为Histological子类。3.根据权利要求1中所述的基于领域本体的癌症用药知识库构建方法，其特征在于，所述突变与基因实体关系包括：Has_a关系，其定义域设定为突变实体类别，值域为基因实体类别；所述突变与肿瘤实体关系包括：Has_a关系，其定义域设定为肿瘤实体类别，值域为突变实体类别；所述肿瘤与药物实体关系包括：Inhibited关系，其定义...
【专利技术属性】
技术研发人员：马超，
申请(专利权)人：慧算基因科技上海有限公司，
类型：发明
国别省市：
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