一种基于CRISPR技术检测甘薯潜隐病毒的方法技术

本发明专利技术提供了一种基于CRISPR技术检测甘薯潜隐病毒的方法，具体地提供了一种基于CRISPR技术检测甘薯潜隐病毒或甘薯病害的方法，所述方法包括利用gRNA、Cas蛋白和单链核酸检测器进行检测的步骤；本发明专利技术通过对gRNA的筛选和优化，提高了检测效率，具有广阔的应用前景。景。

【技术实现步骤摘要】
一种基于CRISPR技术检测甘薯潜隐病毒的方法


[0001]本专利技术涉及核酸检测领域，涉及一种基于CRISPR技术检测甘薯潜隐病毒的方法，尤其涉及基于CRISPR技术检测甘薯潜隐病毒的方法、系统和试剂盒。

技术介绍

[0002]甘薯潜隐病毒(Sweet potato latent virus，SPLV)，属于马铃薯Y病毒科马铃薯Y病毒属，是侵染甘薯的主要病害之一。甘薯潜隐病毒单独侵染大多数甘薯品种时不产生明显症状，但是可以与甘薯褪绿矮化病毒、甘薯羽状斑驳病毒、甘薯G病毒等共侵染，产生协生病害，导致甘薯产生严重的病毒病症状。甘薯潜隐病毒的昆虫传毒介质为蚜虫，并且可随薯苗营养繁殖体及薯块进行传播。
[0003]甘薯潜隐病毒的检测方法主要有：血清学法、RT
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PCR法、LAMP快速检测法、核酸斑点杂交检测法。
[0004]本专利技术提供了一种新型的检测甘薯潜隐病毒的方法，该方法是基于CRISPR技术，尤其是基于V型Cas酶的trans活性，提供的一种特异性高、检测灵敏度高的快速检测方法。
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技术实现思路
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测甘薯潜隐病毒的gRNA，所述gRNA包括与V型Cas蛋白结合的区域和与靶核酸杂交的导向序列，所述靶核酸为来源于甘薯潜隐病毒的核酸；其特征在于，所述与靶核酸杂交的导向序列选自下组任意一种或其组合：(1)所述与靶核酸杂交的导向序列含有17
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30个碱基，并且与SEQ ID No.1所示的序列或其反向互补序列杂交，并且所述导向序列包含SEQ ID No.3
‑
7任一所示的序列；(2)所述与靶核酸杂交的导向序列包含SEQ ID No.3
‑
7任一所示的序列，并且在SEQ ID No.3
‑
7任一所示的序列的3
’
端还包括1
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13个碱基，并且，所述与靶核酸杂交的导向序列与SEQ ID No.1所示的序列或其反向互补序列杂交；(3)所述与靶核酸杂交的导向序列与SEQ ID No.3
‑
7任一所示的序列相比，在SEQ ID No.3
‑
7任一所示的序列的3
’
端连续缺失1
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5个碱基；(4)所述与靶核酸杂交的导向序列如SEQ ID No.3
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7任一所示。2.一种检测/诊断甘薯潜隐病毒或甘薯病害的方法，所述方法包括将待测核酸与V型Cas蛋白、权利要求1所述的gRNA和单链核酸检测器接触；检测由Cas蛋白切割单链核酸检测器产生的可检测信号，从而检测/诊断甘薯潜隐病毒或甘薯病害。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述方法还包括从待测...

【专利技术属性】
技术研发人员：王丽梅，赵莹，
申请(专利权)人：山东舜丰生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：