一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法技术

本发明专利技术公开了一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法，包括以下步骤：步骤一，采集样品；步骤二，建立DNA文库；步骤三，文库测序；步骤四，鉴定位点；步骤五，基因型分型；所述步骤二中，联合甲基化敏感性限制性内切酶的MBD处理是指，用非待测区的内切酶和甲基化敏感的限制性内切酶同时消化DNA片段，随后通过MBD柱捕捉，保留了含有甲基化区的片段，所述步骤一中，针对一个群体中不同的时段，如白天和黑夜，本发明专利技术相较于现有的基因型分型方法，能够判断不同时段的环境对DNA甲基化状态的影响；本发明专利技术能够判断不同生长状态下的DNA甲基化状态的变化；本发明专利技术采用两种不同的处理DNA的方法，提高了基因型分型的精准性。提高了基因型分型的精准性。提高了基因型分型的精准性。

【技术实现步骤摘要】
一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法


[0001]本专利技术涉及DNA甲基化
，具体为一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法。

技术介绍

[0002]DNA甲基化为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现，表现为在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5
’
碳位共价键结合一个甲基基团，现有的基于全基因组重亚硫酸盐测序方法，在对基因型分类时，无法判断环境效应对DNA甲基化状态的影响；现有的测序方法无法判断不同生长状态下DNA甲基化位点基因型的变化；现有的测序方法仅使用重亚硫酸盐测序，不够准确。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的在于提供一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法，以解决上述
技术介绍
中提出的问题。
[0004]为实现上述目的，本专利技术提供如下技术方案：一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法，包括以下步骤：步骤一，采集样品；步骤二，建立DNA文库；步骤三，文库测序；步骤四，鉴定位点；步骤五，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法，包括以下步骤：步骤一，采集样品；步骤二，建立DNA文库；步骤三，文库测序；步骤四，鉴定位点；步骤五，基因型分型；其特征在于：其中在上述步骤一中，先在相同时间一个群体中相同个体，提取出两份相同组织样品的基因组DNA，并进行保存，再针对一个群体中不同时段的相同个体，提取出两份相同组织样品的基因组DNA，并进行保存，再针对一个群体中不同生长状态的个体，提取出两份相同组织样品的基因组DNA，并进行保存；其中在上述步骤二中，根据步骤一中提取保存的三种基因组DNA，各取一分建立重亚硝酸盐处理的第一DNA文库，再将剩余的一份使用联合甲基化敏感性限制性内切酶的MBD的方式处理建立第二DNA文库；其中在上述步骤三中，分别对步骤二中得到的每个样品，所建立的第一文库和第二文库进行测序，得到每个样品的测序结果；其中在上述步骤四中，根据步骤三中每个样品的测序结果，依次鉴定DNA甲基化位点；其中在上述步骤五中，计算步骤四中得到的DNA甲基化位点的甲基化支持率，根据DNA甲基化位点的甲基化支持率来进行基因型分析，当DNA甲基化支持率大于0.7时，基因型为M：M，当DNA甲基化支持率处于0.3
‑
0.7之间时，基因型为U：M或M：U，当DNA甲基化支持率小于0.3时，基因型为U：U。2.根据权利要求1所述的一种基于DNA甲基化位点基因型的全基因组分型方法，其特征在于：所述步骤一中，针对一个群体中不同的时段，如白天和黑夜。3.根据...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑峻松，刘华敏，李艳，方立超，黄辉，汪莉娜，邓均，朱全敬，朱垂雨，李承红，刘飞雪，吴春梅，
申请(专利权)人：中国人民解放军陆军军医大学，
类型：发明
国别省市：