【技术实现步骤摘要】
基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法及应用
[0001]本专利技术涉及微生物种群鉴定的
,尤其涉及一种基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法。
技术介绍
[0002]微生物种群鉴定测序是基于第二代高通量技术,通过有选择的对微生物的16SrRNA/18SrRNA/ITS等基因序列进行测序,与基因文库比较,鉴定微生物种群的技术。随着微生物种群鉴定测序技术的不断开发与精进,其在疾病预防和治疗等领域的应用也日益广泛。尤其是在临床中,快速、准确的鉴定病原微生物的种类,可加快诊断速度,方便医生对病患进行针对性用药治疗。同时,这一方向的应用也对微生物种群鉴定测序技术提出了更高的使用要求。
[0003]微生物种群鉴定测序的具体方法为:提取样品中微生物总DNA,运用PCR技术扩增细菌基因组中的16SrDNA、真菌基因组中的18SrDNA或ITS区域,获得绝大部分微生物16SrDNA、18SrDNA或ITS高可变区的扩增产物,并构建扩增产物的文库;然后,提取待测微生物的DNA,运用PCR技术进行扩增,利用测序平台对扩增产 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,通过对微生物的目标片段进行三核苷酸和单核苷酸循环的测序反应,得到测序图谱,根据测序图谱绘制比色带,通过分析比色带或/和测序图谱确定微生物种类;所述三核苷酸为dATPαS、dCTP、dTTP、dGTP中的任意三种核苷酸;所述单核苷酸为不包括在三核苷酸中的另一核苷酸。2.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,具体包括以下步骤:(1)提取微生物的DNA模板,并在聚合酶的作用下PCR扩增部分可变区;(2)将扩增产物与测序引物结合;(3)交替循环加入三核苷酸和单核苷酸进行焦磷酸测序,得到测序图谱;(4)根据测序图谱绘制比色带;(5)由比色带或/和测序图谱分析微生物种群。3.根据权利要求1所述的基于核苷酸合成测序图谱的微生物种群鉴定方法,其特征在于,所述测序图谱包括由核苷酸数...
【专利技术属性】
技术研发人员:吴友菊,韦红,万逸,
申请(专利权)人:海南微氪生物科技股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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