用于调节单核细胞和巨噬细胞发炎表型的组合物和方法以及其免疫疗法用途技术

本发明专利技术部分地基于鉴定用于调节单核细胞和巨噬细胞发炎表型的组合物和方法以及其免疫疗法用途。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于调节单核细胞和巨噬细胞发炎表型的组合物和方法以及其免疫疗法用途相关申请的交叉引用本申请要求2018年6月29日提交的美国临时申请第62/692,463号、2019年2月26日提交的美国临时申请第62/810,683号、2019年6月4日提交的美国临时申请第62/857,199号和2019年6月27日提交的美国临时申请第62/867,532号的权益；所述申请各自的全部内容通过引用整体并入本文。专利技术背景单核细胞和巨噬细胞是吞噬细胞的类型，它们是通过摄取有害外来颗粒、细菌和死亡细胞或濒死细胞来保护身体的细胞。除单核细胞和巨噬细胞外，吞噬细胞还包括嗜中性粒细胞、树突状细胞和肥大细胞。巨噬细胞通常被称为大型白细胞，其巡查身体并且经由称为吞噬作用的过程来吞食并消化细胞碎片和外来物质(例如病原体、微生物和癌细胞)。另外，巨噬细胞(包括组织巨噬细胞和循环单核细胞源巨噬细胞)是先天性免疫系统和适应性免疫系统的重要介体。巨噬细胞表型取决于经由经典或替代途径的激活(参见例如Classen等人(2009)MethodsMol.Biol.531：29-43)。经典激活的巨噬细胞是由干扰素γ(IFNγ)或脂多糖(LPS)激活并显示M1表型。这种促炎表型与增加的发炎和免疫系统刺激相关。替代激活的巨噬细胞是由细胞因子如IL-4、IL-10和IL-13激活，并显示M2表型。这种抗炎表型与降低的免疫反应、增加的伤口愈合、增加的组织修复和胚胎发育相关。在非病理学条件下，在免疫系统中存在免疫刺激性巨噬细胞和免疫调控性巨噬细胞的平衡群体。平衡的扰动可引起各种疾病状况。在一些癌症中，例如，肿瘤分泌免疫因子(例如细胞因子和白介素)，其使巨噬细胞群体极化，有利于抗炎、促肿瘤生成M2表型，这会激活伤口愈合途径，促进新血管生长(即血管生成)，并且向肿瘤提供营养物和生长信号。这些M2巨噬细胞称为肿瘤相关巨噬细胞(TAM)或肿瘤浸润性巨噬细胞。肿瘤微环境中的TAM是癌症进展和转移的重要调控因子(Pollard(2004)Nat.Rev.Cancer4：71-78)。已经研究了设计用于抑制巨噬细胞基因靶标(例如CSF1R和CCR2)的小分子和单克隆抗体作为巨噬细胞表型的调节剂，例如通过调节促肿瘤生成巨噬细胞(例如TAM)和可抑制肿瘤形成的促炎巨噬细胞的平衡。调节单核细胞和巨噬细胞的募集、极化、激活和/或功能以调节巨噬细胞群体的平衡的疗法称为巨噬细胞免疫疗法。尽管巨噬细胞生物学的领域已取得进展，然而，仍需要用于调节巨噬细胞发炎表型的新靶标(例如基因和/或基因产物)和用于巨噬细胞免疫疗法中的药剂。
技术实现思路
本专利技术至少部分地基于以下发现：可通过调节本文所述的一种或多种生物标志物(例如表1、表2、实施例等中所列出的靶标)的拷贝数、量和/或活性来调控单核细胞和/或巨噬细胞的发炎表型，以及使用所述生物标志物和/或调节剂来用于治疗、诊断、预后和筛选目的。例如，在一个方面，提供了生成在与至少一种药剂接触之后具有增加的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞的方法，所述方法包括使单核细胞和/或巨噬细胞与有效量的所述至少一种药剂接触，其中所述至少一种药剂是a)下调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂和/或b)上调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。还提供了可应用于本专利技术的任何方面和/或与本文所述的任何其他实施方案组合的众多实施方案。例如，在一个实施方案中，具有增加的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞在与一种或多种药剂接触之后表现出下列性质中的一者或多者：a)分化簇80(CD80)、CD86、MHCII、MHCI、白介素1-β(IL-1β)、IL-6、CCL3、CCL4、CXCL10、CXCL9、GM-CSF和/或肿瘤坏死因子α(TNF-α)的表达和/或分泌增加；b)CD206、CD163、CD16、CD53、VSIG4、PSGL-1、TGFb和/或IL-10的表达和/或分泌减少；c)至少一种选自由IL-1β、TNF-α、IL-12、IL-18、GM-CSF、CCL3、CCL4和IL-23组成的组的细胞因子或趋化因子的分泌增加；d)IL-1β、IL-6和/或TNF-α的表达对IL-10表达的比率增加；e)增加的CD8+细胞毒性T细胞活化；f)增加的CD8+细胞毒性T细胞活化的募集；g)增加的CD4+辅助T细胞活性；h)增加的CD4+辅助T细胞活性的募集；i)增加的NK细胞活性；j)增加的NK细胞募集；k)增加的嗜中性粒细胞活性；l)增加的巨噬细胞活性；和/或m)增加的纺锤形形态、外观平坦性和/或树突数量，如通过显微术所评价。在另一个实施方案中，与一种或多种药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且所述药剂增加了细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞的数量，和/或降低了2型和/或M2巨噬细胞的数量。在再一个实施方案中，与一种或多种药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且所述一种或多种药剂增加了i)对ii)的比率，其中i)是细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞并且ii)是2型和/或M2巨噬细胞。在另一方面，提供了生成在与至少一种药剂接触之后具有降低的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞的方法，所述方法包括使单核细胞和/或巨噬细胞与有效量的至少一种药剂接触，其中所述药剂是a)上调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂和/或b)下调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。如上文所述，还提供了可应用于本专利技术的任何方面和/或与本文所述的任何其他实施方案组合的众多实施方案。例如，在一个实施方案中，具有降低的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞在与一种或多种药剂接触之后表现出下列性质中的一者或多者：a)分化簇80(CD80)、CD86、MHCII、MHCI、白介素1-β(IL-1β)、IL-6、CCL3、CCL4、CXCL10、CXCL9、GM-CSF和/或肿瘤坏死因子α(TNF-α)的表达和/或分泌减少；b)CD206、CD163、CD16、CD53、VSIG4、PSGL-1和/或IL-10的表达和/或分泌增加；c)至少一种选自由IL-1β、TNF-α、IL-12、IL-18和IL-23组成的组的细胞因子的分泌减少；d)IL-1β、IL-6和/或TNF-α的表达对IL-10表达的比率降低；e)降低的CD8+细胞毒性T细胞活化；f)降低的CD4+辅助T细胞活性；g)降低的NK细胞活性；h)降低的促炎性嗜中性粒细胞活性；i)降低的巨噬细胞活性；和/或j)降低的纺锤形形态、外观平坦性和/或树突数量，如通过显微术所评价。在另一个实施方案中，与一种或多种药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且所述药剂降低了细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞的数量，和/或增加了2型和/或M2巨噬细胞的数量。在再一个实施方案中，与一种或多种药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且一种或多种药剂降低了i)对ii)的比率，其中i)是细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞并且ii)是2型和/或M2巨噬细胞。在又一个本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种生成在与至少一种药剂接触之后具有增加的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞的方法，所述方法包括使单核细胞和/或巨噬细胞与有效量的所述至少一种药剂接触，其中所述至少一种药剂是a)下调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂和/或b)上调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20180629 US 62/692463;20190226 US 62/810683;2019061.一种生成在与至少一种药剂接触之后具有增加的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞的方法，所述方法包括使单核细胞和/或巨噬细胞与有效量的所述至少一种药剂接触，其中所述至少一种药剂是a)下调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂和/或b)上调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。


2.如权利要求1所述的方法，其中所述具有增加的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞在与所述一种或多种药剂接触后展现下列性质中的一者或多者：
a)分化簇80(CD80)、CD86、MHCII、MHCI、白介素1-β(IL-1β)、IL-6、CCL3、CCL4、CXCL10、CXCL9、GM-CSF和/或肿瘤坏死因子α(TNF-α)的表达和/或分泌增加；
b)CD206、CD163、CD16、CD53、VSIG4、PSGL-1、TGFb和/或IL-10的表达和/或分泌减少；
c)至少一种选自由IL-1β、TNF-α、IL-12、IL-18、GM-CSF、CCL3、CCL4和IL-23组成的组的细胞因子或趋化因子的分泌增加；
d)IL-1β、IL-6和/或TNF-α的表达对IL-10表达的比率增加；
e)CD8+细胞毒性T细胞活化增加；
f)CD8+细胞毒性T细胞活化的募集增加；
g)CD4+辅助T细胞活性增加；
h)CD4+辅助T细胞活性的募集增加；
i)NK细胞活性增加；
j)NK细胞的募集增加；
k)嗜中性粒细胞活性增加；
l)巨噬细胞活性增加；和/或
m)纺锤形形态、外观平坦性和/或树突数量增加，如通过显微术所评价。


3.如权利要求1或2所述的方法，其中与所述一种或多种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且所述药剂使所述细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞的数量增加，和/或使2型和/或M2巨噬细胞的数量降低。


4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中与所述一种或多种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且所述一种或多种药剂使i)对ii)的比率增加，其中i)是所述细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞并且ii)是2型和/或M2巨噬细胞。


5.一种生成在与至少一种药剂接触后具有降低的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞的方法，所述方法包括使单核细胞和/或巨噬细胞与有效量的所述至少一种药剂接触，其中所述药剂是a)上调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂和/或b)下调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。


6.如权利要求5所述的方法，其中所述具有降低的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞在与所述一种或多种药剂接触后展现下列性质中的一者或多者：
a)分化簇80(CD80)、CD86、MHCII、MHCI、白介素1-β(IL-1β)、IL-6、CCL3、CCL4、CXCL10、CXCL9、GM-CSF和/或肿瘤坏死因子α(TNF-α)的表达和/或分泌减少；
b)CD206、CD163、CD16、CD53、VSIG4、PSGL-1和/或IL-10的表达和/或分泌增加；
c)至少一种选自由IL-1β、TNF-α、IL-12、IL-18和IL-23组成的组的细胞因子的分泌减少；
d)IL-1β、IL-6和/或TNF-α的表达对IL-10表达的比率降低；
e)CD8+细胞毒性T细胞活化降低；
f)CD4+辅助T细胞活性降低；
g)NK细胞活性降低；
h)促炎性嗜中性粒细胞活性降低；
i)巨噬细胞活性降低；和/或
j)纺锤形形态、外观平坦性和/或树突数量降低，如通过显微术所评价。


7.如权利要求5或6所述的方法，其中与所述一种或多种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且所述药剂使所述细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞的数量降低，和/或使2型和/或M2巨噬细胞的数量增加。


8.如权利要求5-7中任一项所述的方法，其中与所述一种或多种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞包含于细胞群体内并且所述一种或多种药剂使i)对ii)的比率降低，其中i)是所述细胞群体中的1型和/或M1巨噬细胞并且ii)是2型和/或M2巨噬细胞。


9.如权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述一种或多种下调表1和/或表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂是小分子抑制剂、CRISPR向导RNA(gRNA)、RNA干扰剂、反义寡核苷酸、单链核酸、双链核酸、适体、核酶、DNA酶、肽、肽模拟物、抗体、细胞内抗体或细胞。


10.如权利要求9所述的方法，其中所述RNA干扰剂是小干扰RNA(siRNA)、小发夹RNA(shRNA)、微RNA(miRNA)或piwi相互作用RNA(piRNA)。


11.如权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述一种或多种下调表1和/或表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂包含特异性结合至表1和/或表2中列出的所述至少一种靶标的抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段。


12.如权利要求11所述的方法，其中所述抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段是骆驼科的、鼠类的、嵌合的、人源化的、人类的、可检测地标记的，包含效应结构域，包含Fc结构域，和/或选自由以下组成的组：Fv、Fav、F(ab′)2、Fab′、dsFv、scFv、sc(Fv)2和双价抗体片段。


13.如权利要求11或12所述的方法，其中所述抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段缀合至细胞毒性剂。


14.如权利要求13所述的方法，其中所述细胞毒性剂是选自由以下组成的组：化学治疗剂、生物剂、毒素和放射性同位素。


15.如权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述一种或多种上调表1和/或表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂是编码表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的核酸分子或其片段，表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的多肽或其片段，结合至表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的活化抗体和/或细胞内抗体，或结合至表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的小分子。


16.如权利要求1-15中任一项所述的方法，其中所述巨噬细胞包括1型巨噬细胞、M1巨噬细胞、2型巨噬细胞、M2巨噬细胞、M2c巨噬细胞、M2d巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、CD11b+细胞、CD14+细胞和/或CD11b+/CD14+细胞，任选地其中所述细胞和/或巨噬细胞表达所述靶标。


17.如权利要求1-16中任一项所述的方法，其中在体外或离体接触所述单核细胞和/或巨噬细胞。


18.如权利要求17所述的方法，其中所述单核细胞和/或巨噬细胞是原代单核细胞和/或原代巨噬细胞。


19.如权利要求17或18所述的方法，其中在与所述一种或多种药剂接触之前纯化和/或培养所述单核细胞和/或巨噬细胞。


20.如权利要求1-16中任一项所述的方法，其中在体内接触所述单核细胞和/或巨噬细胞。


21.如权利要求20所述的方法，其中通过全身性、肿瘤周围或肿瘤内施用所述药剂在体内接触所述单核细胞和/或巨噬细胞。


22.如权利要求20或21所述的方法，其中在组织微环境中接触所述单核细胞和/或巨噬细胞。


23.如权利要求1-22中任一项所述的方法，所述方法还包括使所述单核细胞和/或巨噬细胞与至少一种调节所述发炎表型的免疫治疗剂接触，任选地其中所述免疫治疗剂包括免疫检查点抑制剂、免疫刺激性激动剂、发炎剂、细胞、癌症疫苗和/或病毒。


24.一种组合物，所述组合物包含i)根据如权利要求1-23中任一项所述的方法所生成的单核细胞和/或巨噬细胞；和/或ii)下调表1和/或表2中列出的至少一种靶标的量和/或活性的siRNA。


25.一种使受试者中的单核细胞和/或巨噬细胞在与至少一种药剂接触后增加其发炎表型的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效量的所述至少一种药剂，其中所述至少一种药剂是a)下调所述单核细胞和/或巨噬细胞中或其上的表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂；和/或b)上调所述单核细胞和/或巨噬细胞中或其上的表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。


26.如权利要求25所述的方法，其中所述具有增加的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞在与所述一种或多种药剂接触后展现下列性质中的一者或多者：
a)分化簇80(CD80)、CD86、MHCII、MHCI、白介素1-β(IL-1β)、IL-6、CCL3、CCL4、CXCL10、CXCL9、GM-CSF和/或肿瘤坏死因子α(TNF-α)的表达和/或分泌增加；
b)CD206、CD163、CD16、CD53、VSIG4、PSGL-1和/或IL-10的表达和/或分泌减少；
c)至少一种选自由IL-1β、TNF-α、IL-12、IL-18和IL-23组成的组的细胞因子的分泌增加；
d)IL-1β、IL-6和/或TNF-α的表达对IL-10表达的比率增加；
e)CD8+细胞毒性T细胞活化增加；
f)CD4+辅助T细胞活性增加；
g)NK细胞活性增加；
h)嗜中性粒细胞活性增加；
i)巨噬细胞活性增加；和/或
j)纺锤形形态、外观平坦性和/或树突数量增加，如通过显微术所评价。


27.如权利要求25或26所述的方法，其中所述一种或多种药剂使所述受试者中1型和/或M1巨噬细胞的数量增加，使2型和/或M2巨噬细胞的数量降低，和/或使i)对ii)的比率增加，其中i)是1型和/或M1巨噬细胞并且ii)是2型和/或M2巨噬细胞。


28.如权利要求25-27中任一项所述的方法，其中在施用所述一种或多种药剂之后所述受试者中的细胞毒性CD8+T细胞的数量和/或活性有所增加。


29.一种使受试者中的单核细胞和/或巨噬细胞在与至少一种药剂接触后降低其发炎表型的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效量的所述至少一种药剂，其中所述至少一种药剂是a)上调所述单核细胞和/或巨噬细胞中或其上的表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂；和/或b)下调所述单核细胞和/或巨噬细胞中或其上的表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。


30.如权利要求29所述的方法，其中所述具有降低的发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞在与所述一种或多种药剂接触后展现下列性质中的一者或多者：
a)分化簇80(CD80)、CD86、MHCII、MHCI、白介素1-β(IL-1β)、IL-6、CCL3、CCL4、CXCL10、CXCL9、GM-CSF和/或肿瘤坏死因子α(TNF-α)的表达和/或分泌减少；
b)CD206、CD163、CD16、CD53、VSIG4、PSGL-1和/或IL-10的表达和/或分泌增加；
c)至少一种选自由IL-1β、TNF-α、IL-12、IL-18和IL-23组成的组的细胞因子的分泌减少；
d)IL-1β、IL-6和/或TNF-α的表达对IL-10表达的比率降低；
e)CD8+细胞毒性T细胞活化降低；
f)CD4+辅助T细胞活性降低；
g)NK细胞活性降低；
h)嗜中性粒细胞活性降低；
i)巨噬细胞活性降低；和/或
j)纺锤形形态、外观平坦性和/或树突数量降低，如通过显微术所评价。


31.如权利要求29或30所述的方法，其中所述一种或多种药剂使所述受试者中1型和/或M1巨噬细胞的数量降低，使2型和/或M2巨噬细胞的数量增加，和/或使i)对ii)的比率降低，其中i)是1型和/或M1巨噬细胞并且ii)是2型和/或M2巨噬细胞。


32.如权利要求29-31中任一项所述的方法，其中在施用所述药剂之后所述受试者中的细胞毒性CD8+T细胞的数量和/或活性有所降低。


33.如权利要求25-32中任一项所述的方法，其中所述下调表1和/或表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂是小分子抑制剂、CRISPR向导RNA(gRNA)、RNA干扰剂、反义寡核苷酸、肽或肽模拟物抑制剂、适体、抗体、细胞内抗体或细胞。


34.如权利要求33所述的方法，其中所述RNA干扰剂是小干扰RNA(siRNA)、小发夹RNA(shRNA)、微RNA(miRNA)或piwi相互作用RNA(piRNA)。


35.如权利要求25-32中任一项所述的方法，其中所述下调表1和/或表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂包含特异性结合至表1和/或表2中列出的所述至少一种靶标的抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段。


36.如权利要求35所述的方法，其中所述抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段是骆驼科的、鼠类的、嵌合的、人源化的、人类的、可检测地标记的，包含效应结构域，包含Fc结构域，和/或选自由以下组成的组：Fv、Fav、F(ab′)2、Fab′、dsFv、scFv、sc(Fv)2和双价抗体片段。


37.如权利要求35或36所述的方法，其中所述抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段缀合至细胞毒性剂。


38.如权利要求37所述的方法，其中所述细胞毒性剂是选自由以下组成的组：化学治疗剂、生物剂、毒素和放射性同位素。


39.如权利要求25-32中任一项所述的方法，其中所述上调表1和/或表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂是编码表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的核酸分子或其片段，表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的多肽或其片段，结合至表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的活化抗体和/或细胞内抗体，或结合至表1和/或表2中列出的所述一种或多种靶标的小分子。


40.如权利要求25-39中任一项所述的方法，其中所述巨噬细胞包括1型巨噬细胞、M1巨噬细胞、2型巨噬细胞、M2巨噬细胞、M2c巨噬细胞、M2d巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、CD11b+细胞、CD14+细胞和/或CD11b+/CD14+细胞，任选地其中所述细胞和/或巨噬细胞表达所述靶标。


41.如权利要求40所述的方法，其中通过全身性、肿瘤周围或肿瘤内施用所述药剂来体内施用所述一种或多种药剂。


42.如权利要求40或41所述的方法，其中所述一种或多种药剂在组织微环境中接触所述单核细胞和/或巨噬细胞。


43.如权利要求25-42中任一项所述的方法，所述方法还包括使所述单核细胞和/或巨噬细胞与至少一种调节所述发炎表型的免疫治疗剂接触，任选地其中所述免疫治疗剂包括免疫检查点抑制剂、免疫刺激性激动剂、发炎剂、细胞、癌症疫苗和/或病毒。


44.一种增加受试者的发炎的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效量的a)与至少一种下调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞；和/或b)与至少一种上调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞。


45.如权利要求44所述的方法，其中所述巨噬细胞包括1型巨噬细胞、M1巨噬细胞、2型巨噬细胞、M2巨噬细胞、M2c巨噬细胞、M2d巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、CD11b+细胞、CD14+细胞和/或CD11b+/CD14+细胞，任选地其中所述细胞和/或巨噬细胞表达所述靶标。


46.如权利要求44或45所述的方法，其中所述单核细胞和/或巨噬细胞相对于所述受试者的单核细胞和/或巨噬细胞是经基因工程化的、自体的、同基因的或同种异体的。


47.如权利要求44-46中任一项所述的方法，其中与a)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞不同于与b)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞。


48.如权利要求44-46中任一项所述的方法，其中与a)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞与同b)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞相同。


49.如权利要求44-48中任一项所述的方法，其中全身性、经肿瘤周围或经肿瘤内施用所述一种或多种药剂。


50.一种降低受试者的发炎的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效量的a)与至少一种上调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞；和/或b)与至少一种下调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂接触的单核细胞和/或巨噬细胞。


51.如权利要求50所述的方法，其中所述巨噬细胞包括1型巨噬细胞、M1巨噬细胞、2型巨噬细胞、M2巨噬细胞、M2c巨噬细胞、M2d巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、CD11b+细胞、CD14+细胞和/或CD11b+/CD14+细胞，任选地其中所述细胞和/或巨噬细胞表达所述靶标。


52.如权利要求50或51所述的方法，其中所述单核细胞和/或巨噬细胞相对于所述受试者的单核细胞和/或巨噬细胞是经基因工程化的、自体的、同基因的或同种异体的。


53.如权利要求50-52中任一项所述的方法，其中与a)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞不同于与b)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞。


54.如权利要求50-52中任一项所述的方法，其中与a)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞与同b)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞相同。


55.如权利要求50-54中任一项所述的方法，其中全身性、经肿瘤周围或经肿瘤内施用所述一种或多种药剂。


56.一种使受试者中的癌细胞对细胞毒性CD8+T细胞介导的杀伤和/或免疫检查点疗法敏感的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的a)至少一种下调单核细胞和/或巨噬细胞中或其上的表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂，和/或b)至少一种上调单核细胞和/或巨噬细胞中或其上的表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。


57.如权利要求56所述的方法，所述方法包括施用至少一种下调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。


58.如权利要求57所述的方法，其中所述药剂是小分子抑制剂、CRISPR向导RNA(gRNA)、RNA干扰剂、反义寡核苷酸、肽或肽模拟物抑制剂、适体、抗体、细胞内抗体或细胞。


59.如权利要求58所述的方法，其中所述RNA干扰剂是小干扰RNA(siRNA)、小发夹RNA(shRNA)、微RNA(miRNA)或piwi相互作用RNA(piRNA)。


60.如权利要求58所述的方法，其中所述药剂包含特异性结合至表1中列出的所述至少一种靶标的抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段。


61.如权利要求60所述的方法，其中所述抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段是骆驼科的、鼠类的、嵌合的、人源化的、人类的、可检测地标记的，包含效应结构域，包含Fc结构域，和/或选自由以下组成的组：Fv、Fav、F(ab′)2、Fab′、dsFv、scFv、sc(Fv)2和双价抗体片段。


62.如权利要求60或61所述的方法，其中所述抗体和/或细胞内抗体或其抗原结合片段缀合至细胞毒性剂。


63.如权利要求62所述的方法，其中所述细胞毒性剂是选自由以下组成的组：化学治疗剂、生物剂、毒素和放射性同位素。


64.如权利要求56所述的方法，所述方法包括施用至少一种上调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂。


65.如权利要求64所述的方法，其中所述药剂是编码表2中列出的所述一种或多种靶标的核酸分子或其片段，表2中列出的所述一种或多种靶标的多肽或其片段，结合至表2中列出的所述一种或多种靶标的活化抗体和/或细胞内抗体，或结合至表2中列出的所述一种或多种靶标的小分子。


66.一种使患有癌症的受试者中的癌细胞对细胞毒性CD8+T细胞介导的杀伤和/或免疫检查点疗法敏感的方法，所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的a)与至少一种下调表1中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂接触的单核细胞细胞和/或巨噬细胞；和/或b)与至少一种上调表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的药剂接触的单核细胞细胞和/或巨噬细胞。


67.如权利要求66所述的方法，其中所述巨噬细胞包括1型巨噬细胞、M1巨噬细胞、2型巨噬细胞、M2巨噬细胞、M2c巨噬细胞、M2d巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、CD11b+细胞、CD14+细胞和/或CD11b+/CD14+细胞，任选地其中所述细胞和/或巨噬细胞表达所述靶标。


68.如权利要求66或67所述的方法，其中所述单核细胞和/或巨噬细胞相对于所述受试者的单核细胞和/或巨噬细胞是经基因工程化的、自体的、同基因的或同种异体的。


69.如权利要求66-68中任一项所述的方法，其中与a)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞不同于与b)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞。


70.如权利要求66-68中任一项所述的方法，其中与a)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞与同b)的所述至少一种药剂接触的所述单核细胞和/或巨噬细胞相同。


71.如权利要求56-70中任一项所述的方法，其中全身性、经肿瘤周围或经肿瘤内施用所述一种或多种药剂。


72.如权利要求56-71中任一项所述的方法，所述方法还包括通过向所述受试者施用至少一种免疫疗法来治疗所述受试者的癌症，任选地其中所述免疫疗法包含免疫检查点抑制剂、免疫刺激性激动剂、发炎剂、细胞、癌症疫苗和/或病毒。


73.如权利要求72所述的方法，其中所述免疫检查点是选自由以下组成的组：PD-1、PD-L1、PD-L2和CTLA-4。


74.如权利要求73所述的方法，其中所述免疫检查点是PD-1。


75.如权利要求56-74中任一项所述的方法，其中所述一种或多种药剂使所述癌症中的增殖性细胞的数量减少和/或使包含所述癌细胞的肿瘤的体积或大小减小。


76.如权利要求56-75中任一项所述的方法，其中所述一种或多种药剂使浸润包含所述癌细胞的肿瘤的CD8+T细胞的量和/或活性增加。


77.如权利要求56-76中任一项所述的方法，其中所述一种或多种药剂使a)浸润包含所述癌细胞的肿瘤的M1巨噬细胞的量和/或活性增加，和/或使b)浸润包含所述癌细胞的肿瘤的M2巨噬细胞的量和/或活性降低。


78.如权利要求56-77中任一项所述的方法，所述方法还包括向所述受试者施用至少一种用于治疗所述癌症的其他疗法或方案。


79.如权利要求51-63中任一项所述的方法，其中所述疗法是在所述药剂之前、同时或之后施用。


80.一种鉴定可通过调节至少一种靶标来增加发炎表型的单核细胞和/或巨噬细胞的方法，所述方法包括：
a)测定来自所述单核细胞和/或巨噬细胞的表1和/或表2中列出的至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性；
b)测定对照中所述至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性；以及
c)比较在步骤a)和b)中检测的所述至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性；
其中相对于所述至少一种靶标的对照拷贝数、量和/或活性，在所述单核细胞和/或巨噬细胞中表1中列出的所述至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的存在或增加和/或表2中列出的所述至少一种靶标的拷贝数、量和/或活性的不存在或降低指示，所述单核细胞和/或巨噬细胞可通过调节所述至少一...

【专利技术属性】
技术研发人员：T·I·诺沃布兰塞瓦，I·费尔德曼，
申请(专利权)人：维西欧制药公司，
类型：发明
国别省市：美国;US