实体瘤甲基化标志物及其用途制造技术

本申请涉及实体瘤甲基化标志物及其用途。本申请公开了用于将受试者鉴别为患有食管癌、胰腺癌或胃癌的方法和试剂盒。本申请还提供了用于生成与食管癌、胰腺癌或胃癌相关的生物标志物的甲基化谱的方法和试剂盒。

【技术实现步骤摘要】
实体瘤甲基化标志物及其用途本申请是申请日为2017年7月6日，申请号为201780002263.8，专利技术名称为“实体瘤甲基化标志物及其用途”的申请的分案申请。交叉引用本申请要求于2016年7月6日提交的美国临时申请号62/358,795的权益，该申请通过引用并入本文。专利技术背景癌症是世界范围内死亡的主要原因，预计在今后二十年内，每年的病例将从2012年的1400万上升至2200万(WHO)。在一些情况下，仅在患者已经出现症状之后才开始针对实体瘤如食管癌、胰腺癌或胃癌的诊断程序，从而导致程序是昂贵的、侵入性的并且有时是耗时的。此外，无法接近的区域有时会妨碍准确的诊断。另外，高癌症发病率和死亡率与较晚的诊断相关。
技术实现思路
本文提供了用于将受试者鉴别为患有食管癌、胰腺癌或胃癌的方法和试剂盒。在某些实施方案中，本文提供了选择疑似患有实体瘤的受试者进行治疗的方法，该方法包括：(a)采用脱氨剂对提取的基因组DNA进行处理以生成包含脱氨核苷酸的基因组DNA样品，其中所述提取的基因组DNA从来自疑似患有实体瘤的受试本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种生成有需要的受试者的生物标志物的甲基化谱的方法，该方法包括：/na)采用脱氨剂对提取的基因组DNA进行处理以生成包含脱氨核苷酸的基因组DNA样品，其中所述提取的基因组DNA从来自所述受试者的生物样品获得；/nb)检测所述提取的基因组DNA与探针之间的杂交，其中所述探针与cg10673833(肌球蛋白IG)杂交；以及/nc)根据在所述提取的基因组DNA与所述探针之间所检测到的杂交来生成甲基化谱。/n

【技术特征摘要】
20160706 US 62/358,7951.一种生成有需要的受试者的生物标志物的甲基化谱的方法，该方法包括：
a)采用脱氨剂对提取的基因组DNA进行处理以生成包含脱氨核苷酸的基因组DNA样品，其中所述提取的基因组DNA从来自所述受试者的生物样品获得；
b)检测所述提取的基因组DNA与探针之间的杂交，其中所述探针与cg10673833(肌球蛋白IG)杂交；以及
c)根据在所述提取的基因组DNA与所述探针之间所检测到的杂交来生成甲基化谱。


2.如权利要求1所述的方法，其中所述探针包含式I的结构：



其中：
A为第一靶标结合区；
B为第二靶标结合区；并且
L为连接区；
其中A具有与从SEQIDNO:1的5’末端的位置1开始的至少30个连续核苷酸至少70％、80％、90％、95％或99％的序列同一性；B具有与从SEQIDNO:1的3’末端的位置1’开始的至少12个连续核苷酸至少70％、80％、90％、95％或99％的序列同一性；并且
其中L与A相连接；并且B与A或L相连接。


3.如权利要求2所述的方法，其中所述探针包含式Ia的结构：





4.如权利要求2所述的方法，其中A具有与从SEQIDNO:1的5’末端的位置1开始的至少40个连续核苷酸至少70％、80％、90％、95...

【专利技术属性】
技术研发人员：张康，侯睿，郑良宏，
申请(专利权)人：优美佳肿瘤技术有限公司，加利福尼亚大学董事会，
类型：发明
国别省市：开曼群岛;KY