SNP标志物、应用及引物、探针、肺移植物排斥风险试剂盒制造技术

技术编号:29387379 阅读:44 留言:0更新日期:2021-07-23 22:20
本发明专利技术涉及生物技术领域,公开了SNP标志物、应用及引物、探针、肺移植物排斥风险试剂盒,具体提供了32个SNP位点在评估肺移植术后移植物排斥风险中的应用,通过对移植后受体总游离DNA的32个特定SNP位点进行检测,获得GcfDNA供受比,根据GcfDNA供受比快速而准确地判断移植排斥的程度,无需任何侵入式的检测,准确性和灵敏度高,为临床检测器官移植术后移植物排斥风险提供了一种简单而有效的辅助手段。

【技术实现步骤摘要】
SNP标志物、应用及引物、探针、肺移植物排斥风险试剂盒
本专利技术涉及生物
,具体涉及SNP标志物、应用及引物、探针、肺移植物排斥风险试剂盒。
技术介绍
目前肺器官移植术后移植物的健康监测常采用抽血进行肺功能检查,或穿刺针采集组织进行病理学检查。对于常规抽血功能检查,其各项指标如肌酐、ALT、AST、胆红素等等灵敏度和特异性均不高,无法准确的反应移植物的健康状况。对于目前金标准的组织活检,其虽可直接的反应移植物的健康状况。但存在以下重大缺点:1)侵入式检测,对病人造成较大痛苦,同时对移植物造成损伤;2)检出异常时,移植物实质性损伤已经发生,并且损伤往往已经较为严重,这时对于临床医生来说拯救移植物往往已经太晚;3)若穿刺针未采集到移植物的病灶组织部分,会对结果准确性造成较大影响,因此准确性和灵敏度不高。
技术实现思路
有鉴于此,本申请提SNP标志物、应用及引物、探针、肺移植物排斥风险试剂盒,通过对移植后受体总游离DNA的32个特定SNP位点进行检测,最终获得受体游离DNA中供体游离DNA的含量,即GcfDNA供受比,根据GcfDNA供受比快速而准确地判断移植排斥的程度,使得该试剂盒能够灵敏、特异、准确的评估肺移植物的排斥风险,无需进行创伤检测。为解决以上技术问题,本申请提供的技术方案是一种评估肺移植术后移植物排斥风险的SNP标记物为SNP位点rs2074533、rs1700189、rs977624、rs2075152、rs2075755、rs572846、rs2075910、rs691057、rs1860263、rs2271715、rs2271730、rs894039、rs303815、rs1460355、rs2271971、rs748384、rs260502、rs1039322、rs820094、rs1049437、rs2281913、rs1893061、rs881803、rs1805794、rs943199、rs599437、rs948119、rs678209、rs704329、rs2282772、rs1603022、rs1845430的组合。本专利技术还提供了SNP位点在制备评估肺移植术后移植物排斥风险的产品中的应用,所述SNP位点为:rs2074533、rs1700189、rs977624、rs2075152、rs2075755、rs572846、rs2075910、rs691057、rs1860263、rs2271715、rs2271730、rs894039、rs303815、rs1460355、rs2271971、rs748384、rs260502、rs1039322、rs820094、rs1049437、rs2281913、rs1893061、rs881803、rs1805794、rs943199、rs599437、rs948119、rs678209、rs704329、rs2282772、rs1603022、rs1845430。优选的,所述产品通过检测待测样品中的受体游离DNA中供体游离DNA含量来评估肺移植术后移植物排斥风险。优选的,所述待测样品为血液,所述产品通过检测待测样品中的受体游离DNA中供体游离DNA含量,计算GcfDNA供受比来评估肺移植术后移植物排斥风险,GcfDNA供受比≤8.2%,表示受者肺移植物排斥风险低;GcfDNA供受比>8.2%,表示受者肺移植物排斥风险高;或所述待测样品为尿液,所述产品通过检测待测样品中的受体游离DNA中供体游离DNA含量,计算GcfDNA供受比来评估肺移植术后移植物排斥风险,GcfDNA供受比≤3.3%,表示受者肺移植物排斥风险低;GcfDNA供受比>3.3%,表示受者肺移植物排斥风险高。本专利技术还提供了一种用于评估肺移植术后移植物排斥风险的引物和探针,所述引物为:用于检测rs2074533的引物,其序列为SEQIDNo:1和SEQIDNo:2;用于检测rs1700189的引物,其序列为SEQIDNo:3和SEQIDNo:4;用于检测rs977624的引物,其序列为SEQIDNo:5和SEQIDNo:6;用于检测rs2075152的引物,其序列为SEQIDNo:7和SEQIDNo:8;用于检测rs2075755的引物,其序列为SEQIDNo:9和SEQIDNo:10;用于检测rs572846的引物,其序列为SEQIDNo:11和SEQIDNo:12;用于检测rs2075910的引物,其序列为SEQIDNo:13和SEQIDNo:14;用于检测rs691057的引物,其序列为SEQIDNo:15和SEQIDNo:16;用于检测rs1860263的引物,其序列为SEQIDNo:17和SEQIDNo:18;用于检测rs2271715的引物,其序列为SEQIDNo:19和SEQIDNo:20;用于检测rs2271730的引物,其序列为SEQIDNo:21和SEQIDNo:22;用于检测rs894039的引物,其序列为SEQIDNo:23和SEQIDNo:24;用于检测rs303815的引物,其序列为SEQIDNo:25和SEQIDNo:26;用于检测rs1460355的引物,其序列为SEQIDNo:27和SEQIDNo:28;用于检测rs2271971的引物,其序列为SEQIDNo:29和SEQIDNo:30;用于检测rs748384的引物,其序列为SEQIDNo:31和SEQIDNo:32;用于检测rs260502的引物,其序列为SEQIDNo:33和SEQIDNo:34;用于检测rs1039322的引物,其序列为SEQIDNo:35和SEQIDNo:36;用于检测rs820094的引物,其序列为SEQIDNo:37和SEQIDNo:38;用于检测rs1049437的引物,其序列为SEQIDNo:39和SEQIDNo:40;用于检测rs2281913的引物,其序列为SEQIDNo:41和SEQIDNo:42;用于检测rs1893061的引物,其序列为SEQIDNo:43和SEQIDNo:44;用于检测rs881803的引物,其序列为SEQIDNo:45和SEQIDNo:46;用于检测rs1805794的引物,其序列为SEQIDNo:47和SEQIDNo:48;用于检测rs943199的引物,其序列为SEQIDNo:49和SEQIDNo:50;用于检测rs599437的引物,其序列为SEQIDNo:51和SEQIDNo:52;用于检测rs948119的引物,其序列为SEQIDNo:53和SEQIDNo:54;用于检测rs678209的引物,其序列为SEQIDNo:55和SEQIDNo:56;用于检测rs704329的引物,其序列为SEQIDNo:57和SEQI本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种评估肺移植术后移植物排斥风险的SNP标记物,其特征在于,所述SNP标记物为SNP位点rs2074533、rs1700189、rs977624、rs2075152、rs2075755、rs572846、rs2075910、rs691057、rs1860263、rs2271715、rs2271730、rs894039、rs303815、rs1460355、rs2271971、rs748384、rs260502、rs1039322、rs820094、rs1049437、rs2281913、rs1893061、rs881803、rs1805794、rs943199、rs599437、rs948119、rs678209、rs704329、rs2282772、rs1603022、rs1845430的组合。/n

【技术特征摘要】
1.一种评估肺移植术后移植物排斥风险的SNP标记物,其特征在于,所述SNP标记物为SNP位点rs2074533、rs1700189、rs977624、rs2075152、rs2075755、rs572846、rs2075910、rs691057、rs1860263、rs2271715、rs2271730、rs894039、rs303815、rs1460355、rs2271971、rs748384、rs260502、rs1039322、rs820094、rs1049437、rs2281913、rs1893061、rs881803、rs1805794、rs943199、rs599437、rs948119、rs678209、rs704329、rs2282772、rs1603022、rs1845430的组合。


2.SNP位点在制备评估肺移植术后移植物排斥风险的产品中的应用,所述SNP位点为:rs2074533、rs1700189、rs977624、rs2075152、rs2075755、rs572846、rs2075910、rs691057、rs1860263、rs2271715、rs2271730、rs894039、rs303815、rs1460355、rs2271971、rs748384、rs260502、rs1039322、rs820094、rs1049437、rs2281913、rs1893061、rs881803、rs1805794、rs943199、rs599437、rs948119、rs678209、rs704329、rs2282772、rs1603022、rs1845430。


3.根据权利要求2所述应用,其特征在于,所述产品通过检测待测样品中的受体游离DNA中供体游离DNA含量来评估肺移植术后移植物排斥风险。


4.根据权利要求3所述应用,其特征在于,所述待测样品为血液,所述产品通过检测待测样品中的受体游离DNA中供体游离DNA含量,计算GcfDNA供受比来评估肺移植术后移植物排斥风险,GcfDNA供受比≤8.2%,表示受者肺移植物排斥风险低;GcfDNA供受比>8.2%,表示受者肺移植物排斥风险高;或
所述待测样品为尿液,所述产品通过检测待测样品中的受体游离DNA中供体游离DNA含量,计算GcfDNA供受比来评估肺移植术后移植物排斥风险,GcfDNA供受比≤3.3%,表示受者肺移植物排斥风险低;GcfDNA供受比>3.3%,表示受者肺移植物排斥风险高。


5.一种用于评估肺移植术后移植物排斥风险的引物和探针,其特征在于,
所述引物为:
用于检测rs2074533的引物,其序列为SEQIDNo:1和SEQIDNo:2;
用于检测rs1700189的引物,其序列为SEQIDNo:3和SEQIDNo:4;
用于检测rs977624的引物,其序列为SEQIDNo:5和SEQIDNo:6;
用于检测rs2075152的引物,其序列为SEQIDNo:7和SEQIDNo:8;
用于检测rs2075755的引物,其序列为SEQIDNo:9和SEQIDNo:10;
用于检测rs572846的引物,其序列为SEQIDNo:11和SEQIDNo:12;
用于检测rs2075910的引物,其序列为SEQIDNo:13和SEQIDNo:14;
用于检测rs691057的引物,其序列为SEQIDNo:15和SEQIDNo:16;
用于检测rs1860263的引物,其序列为SEQIDNo:17和SEQIDNo:18;
用于检测rs2271715的引物,其序列为SEQIDNo:19和SEQIDNo:20;
用于检测rs2271730的引物,其序列为SEQIDNo:21和SEQIDNo:22;
用于检测rs894039的引物,其序列为SEQIDNo:23和SEQIDNo:24;
用于检测rs303815的引物,其序列为SEQIDNo:25和SEQIDNo:26;
用于检测rs1460355的引物,其序列为SEQIDNo:27和SEQIDNo:28;
用于检测rs2271971的引物,其序列为SEQIDNo:29和SEQIDNo:30;
用于检测rs748384的引物,其序列为SEQIDNo:31和SEQIDNo:32;
用于检测rs260502的引物,其序列为SEQIDNo:33和SEQIDNo:34;
用于检测rs1039322的引物,其序列为SEQIDNo:35和SEQIDNo:36;
用于检测rs820094的引物,其序列为SEQIDNo:37和SEQIDNo:38;
用于检测rs1049437的引物,其序列为SEQIDNo:39和SEQIDNo:40;
用于检测rs2281913的引物,其序列为SEQIDNo:41和SEQIDNo:42;
用于检测rs1893061的引物,其序列为SEQIDNo:43和SEQIDNo:44;
用于检测rs881803的引物,其序列为SEQIDNo:45和SEQIDNo:46;
用于检测rs1805794的引物,其序列为SEQIDNo:47和SEQIDNo:48;
用于检测rs943199的引物,其序列为SEQIDNo:49和SEQIDNo:50;
用于检测rs599437的引物,其序列为SEQIDNo:51和SEQIDNo:52;
用于检测rs948119的引物,其序列为SEQIDNo:53和SEQIDNo:54;
用于检测rs678209的引物,其序列为SEQIDNo:55和SEQIDNo:56;
用于检测rs704329的引物,其序列为SEQIDNo:57和SE...

【专利技术属性】
技术研发人员:魏亮
申请(专利权)人:成都仕康美生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:四川;51

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