一种去除动物总RNA中的核糖体RNA的方法技术

本发明专利技术公开了一种去除动物总RNA中的核糖体RNA的方法。本发明专利技术提供了一种去除动物总RNA样本中的rRNA的方法，依次包括如下步骤：(1)取动物总RNA样本，进行变性，然后采用特异引物组进行反转录；所述特异引物组由若干条rRNA特异性反转录引物组成；(2)采用RNase H酶进行处理；(3)采用DNase I进行处理；(4)回收RNA。本发明专利技术提供的方法具有以下优势：(1)从动物总RNA样本中特异性去除rRNA，保留了其他目标RNA如mRNA、LncRNA等，适宜于LncRNA测序；(2)物种耐受度高，广泛适用于哺乳类、鸟类、爬行类、两栖类、鱼类及昆虫类等总RNA样本中rRNA的去除；(3)操作简单、成本低廉且适宜于批量自动化工作站操作。作站操作。

A method of removing ribosomal RNA from total RNA of animals

【技术实现步骤摘要】
一种去除动物总RNA中的核糖体RNA的方法


[0001]本专利技术涉及一种去除动物总RNA中的核糖体RNA(rRNA)的方法。

技术介绍

[0002]转录组测序或者RNA测序作为一种强有力的工具，在现今的生命科学研究中有着广泛的应用。但是目前的RNA测序面临着极大的挑战。核糖体RNA，即rRNA，细胞中含量最多的一类RNA，占总RNA的80％以上，它的存在会使总RNA中其他目标RNA(如mRNA或LncRNA)的研究变得困难，如不去除还会消耗大量宝贵的测序资源。因此一般进行RNA测序时，均会从总RNA中去除rRNA，再进行测序和分析。
[0003]目前，动物总RNA样本中rRNA的去除方法主要有：(1)Poly(A)调取法，真核生物中mRNA均具有poly(A)尾巴结构，利用poly(T)对真核生物的mRNA进行富集，可以间接去除rRNA；(2)利用带有链霉亲和素基团的磁珠结合rRNA-DNA探针(生物素基团标记)杂交产物，从而在总RNA中去除rRNA；(3)利用RNase H酶特异性降解rRNA-DNA探针杂交双链中的rRNA。...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种去除动物总RNA样本中的rRNA的方法，依次包括如下步骤：(1)取动物总RNA样本，进行变性，然后采用特异引物组进行反转录；所述特异引物组由若干条rRNA特异性反转录引物组成；(2)采用RNase H酶进行处理；(3)采用DNase I进行处理；(4)回收RNA。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于：所述特异引物组由40种引物组成，依次如序列表的序列1至序列表的序列40所示。3.权利要求1或2所述方法在制备RNA文库中的应用。4.权利要求1或2所述方法在RNA测序中的应用。5.特异引物组，由40种引物组成，依次如序列表的序列1至序列表的序列40所示。6.权利要求5所述特异引物组在去除动物总RNA样本中的rRNA中的应用。7.权利要求5所述特异...

【专利技术属性】
技术研发人员：冯兵，张东，
申请(专利权)人：深圳华大基因股份有限公司，
类型：发明
国别省市：