一种检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法技术

本发明专利技术涉及生物技术领域，具体是一种检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法及临床应用。本发明专利技术发现，与癌旁组织相比，尽管肝癌组织中存在广泛的遗传和表观遗传变化，但肝癌组织中的肝癌干细胞只存在少量但关键的遗传和表观遗传变化。针对这些肿瘤干细胞中发生的关键的遗传和表观遗传变化的治疗，对癌症的治疗效果可能会更好。本发明专利技术为肝癌的治疗提供了新的靶标发现方法。新的靶标发现方法。

【技术实现步骤摘要】
一种检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法


[0001]本专利技术涉及生物
，具体地说，是一种检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法及临床应用。

技术介绍

[0002]肿瘤干细胞(CSC)在肿瘤细胞群中占比非常少，但它在肿瘤发生中起关键作用。肿瘤生物学中的一个基本问题是CSC中发生了哪些遗传和表观遗传变化，以及这些变化是否与该肿瘤的其他肿瘤实质细胞中的变化相似。
[0003]癌症发生是一个复杂的进化的过程，目前我们知道，与正常细胞相比，肿瘤细胞中发生了许多多种原因导致的显著的遗传和表观遗传变化。很多癌症被认为起源于CSC，它们带来了肿瘤治疗的耐药性和复发的高风险。了解人类CSC的遗传和表观遗传学变化可为设计新的、更好的癌症治疗方法提供启发。但是，研究人类CSC总是很困难，因为它们通常只占临床患者肿瘤标本的很小一部分。因此，人们对人类CSC中发生的遗传和表观遗传学变化以及这些变化是否与该肿瘤的其它肿瘤实质细胞一样，仍知之甚少。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法，其特征在于，包括以下步骤：(A)免疫组织化学方法处理肿瘤组织；(B)激光捕获显微切割方法捕获所需细胞；(C)单细胞测序技术分析人类肿瘤干细胞的少量但关键的遗传和表观遗传变化。2.根据权利要求1所述的检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法，其特征在于，所述的肿瘤为肝癌、肺癌、胃癌、结直肠癌、脑胶质瘤、乳腺癌、食管癌、胰腺癌、淋巴瘤、宫颈癌、头颈鳞癌、皮肤癌。3.根据权利要求1所述的检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法，其特征在于，所述的步骤A免疫组织化学方法中对肿瘤组织采用冷冻切片或石蜡包埋切片的处理方法。4.根据权利要求1所述的检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法，其特征在于，所述的步骤C采用全外显子测序分析人类肿瘤干细胞的关键遗传变化，采用全基因组亚硫酸氢盐测序分析人类肿瘤干细胞的少量的关键表观遗传变化。5.根据权利要求4所述的检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法，其特征在于，所述的人类肿瘤干细胞的少量的关键表观遗传变化为DNA甲基化变化。6.根据权利要求1所述的检测肿瘤干细胞中遗传和表观遗传变化的方法，其特征在于，包括以下步骤：a)免疫组织化学和激光捕获显微切割：将OCT包埋的冷冻肿瘤组织和癌旁组织切成10μm厚的切片，然后贴在PEN膜载玻片上；EpCAM的IHC后，通过在50ml无菌离心管中增加乙醇浓度使组织脱水，分别为50、75、85、95、100和100％乙醇，每次60s；当膜片完全干燥后，用Leica LMD 7000激光显微切割系统启动LCM程序；所有捕获的样品收集在0.2ml PCR管中；最后，膜片经过二甲苯透明，封片后长期保存；b)遗传文库：通过Quick
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【专利技术属性】
技术研发人员：贺宇飞，王红阳，
申请(专利权)人：中国人民解放军海军军医大学，
类型：发明
国别省市：