用于完成序列同源性检测的方法和装置制造方法及图纸

在本发明专利技术的序列同源性检测方面，一种基于计算机的检测一数据库中多个序列和一查询序列之间同源性的方法包含以下步骤。首先，该方法包括访问与该数据库关联的模式，每个模式代表该数据库中一个或多个序列的至少一部分，接下来，将该查询序列与这些模式比较，以检测是否该查询序列的一个或多个部分与这些模式代表的数据库序列中的一些部分有同源性。然后，对检测到的与该查询序列有同源性的每个序列产生一个评分，这里的序列评分是基于根据所检测到的序列每个同源部分产生的单个评分，而且该序列评分代表该查询序列与检测到的序列之间的同源性程度。（*该技术在2019年保护过期，可自由使用*）

【技术实现步骤摘要】

一般而言，本专利技术涉及数据库搜索，更具体而言，涉及与给定的应用(例如遗传研究)相联系的检测一查询序列和一数据库中若干序列之间的序列同源性的方法和装置。
技术介绍
在遗传研究领域中，在对一个新的基因进行测序之后要进行的第一步工作是试图识别那个基因的功能。达到这一目的的最流行和直接的方法利用了如下生物学事实-如果两个肽片段在序列水平上显示出足够的相似性(即通过少量的插入、缺失和／或氨基酸突变，便可从一个肽片段得到另一个)，那么它们可能在生物学上相互关联。这种途径的实例描述见A．M．Lesk的“计算分子生物学”(计算机科学与技术百科全书，A．Kent和J．G．Williams编辑，31101-165，Marcel Dekker，New York，1994)；R．F．Doolittle的“我们从序列数据库中知道了什么和将要知道什么”(计算机和DNA，G．Bell和T．Marr编辑，21-31，Addison-Wesley，1990)；C．Caskey，R．Eisenberg，E．Lander和J．Straus的“关于DNA专利权的Hugo声明”(基因组文摘，26-9，1995)；以及W．本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种基于计算机的检测数据库中多个序列和一个查询序列之间同源性的方法，该方法包含如下步骤： 访问与该数据库关联的模式，每个模式代表数据库中一个或多个序列的至少一部分； 比较查询序列和这些模式，以检测该查询序列的一个或多个部分是否与这些模式所代表的数据库序列的一些部分具有同源性；以及 对检测到与该查询序列具有同源性的每个序列产生一个评分，这里的序列评分是基于根据检测到的序列的每个同源部分所产生的单个评分，而且该序列评分代表该查询序列和检测到的序列之间的同源性程度。

【技术特征摘要】
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【专利技术属性】
技术研发人员：阿里斯福劳拉特斯，艾塞德勒若高瑟斯，
申请(专利权)人：国际商业机器公司，
类型：发明
国别省市：US[美国]