用于与特定疾病相关的患者分类的蛋白质的功能特性的方法技术

本发明专利技术描述了一种用于蛋白质的功能特性的方法，该方法用于通过将生物物理参数作为输入值应用于标记物线性组合，在计算装置中进行对与特定疾病相关的患者的分类，其中，所述标记物线性组合包括至少两个生物物理参数的预定组合，使用所述标记物线性组合来确定与一种或多种所述预定疾病相关的输入参数，并根据所述标记物线性组合输出结果，其中，所述标记物线性组合包括至少一个生物物理参数：自旋探针的结合常数，自旋探针周围的极性，自旋探针的序参数，自旋探针的旋转相关时间，来自游离自旋探针的光谱分量，血清脂质组分上自旋探针的光谱分量或几何因数。光谱分量或几何因数。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】Patients with Decompensated Cirrhosis is Associated with Increased Mortality”，Hepatology，50，555
‑
564)。特别是，白蛋白的结合系数及其解毒效率可以提供信息，以区分与无肝病患者相关的样品，与具有ACLF的人相关的样品和/或与无器官功能障碍的具有肝硬化的人相关的样品。
[0013]通过指标和/或诊断评分，可以将样品分类为与特定疾病相关。特定方法的质量，即评分是否将样品正确分类，确定了方法的性能。换句话说，这意味着性能是方法质量的度量。性能取决于方法的灵敏度以及方法的特异性，尤其取决于将健康人分类为健康的并将患病人分类为患病的方法的质量。
[0014]灵敏度，也称为真实阳性率，给出与某种特定疾病相关的样品数量被分类为与该特定疾病相关的数量。例如，这意味着灵敏度可以使那些已被正确识别出疾病的病人部分。正确分类的样品(人)越多，灵敏度越高。灵敏度尤其取决于真实阳性的数目。
[0015]特异性，也称为真实阴性率，确定了正确分类的样品部分未显示出特定疾病(即与健康人有关)。例如，这意味着将健康人分类为健康的(即未显示特定疾病)。特异性取决于真实阴性的数目。另一个衡量标准是假阳性率(FPR)，其计算方法为1
‑
特异性(或100％
‑
特异性)。FPR取决于误报的数量。它确定分类为阳性的阴性样品部分。例如，它给出了被归类为疾病的健康人的比例。
[0016]取决于特定的医学问题，具有高灵敏度可能很重要，这样(几乎)所有患者都可以通过该方法进行检测。在不同的情况下，具有较高的特异性可能更为重要，而灵敏度则不那么重要。
[0017]既要考虑灵敏度又要考虑特异性的措施是接收器工作特性(ROC)曲线，尤其是ROC曲线下的面积(AUROC)。总的来说，认为AUROC越接近一，性能就越好。
[0018]可以以简单且可靠的方式对与特定的肝病，肝病的阶段和/或预定的肝功能相关的样品(尤其是血液样品)进行分类的方法是令人感兴趣的。需要基于当前样品可以提供关于疾病进程的概率，特别是关于疾病恶化的风险的预后信息，特别是关于肝病恶化的风险，即肝病的阶段和/或预定义的肝功能的预后信息的方法。这包括可能从一种疾病阶段转移到另一种疾病阶段，即从AD到ACLF的转变。它还包括给出特定疗法是否成功的概率。特别是，需要一种具有良好性能的方法。
[0019]换句话说，这意味着令人感兴趣的方法是：可以提供一种容易获得且可靠的诊断信息的方法。特别是，令人感兴趣的方法是：提供关于肝病的容易获得且可靠的诊断信息的方法。令人感兴趣的方法是：提供关于肝衰竭分类的信息。
[0020]这由权利要求1所述的方法提供。本专利技术的实施方式在相应的从属权利要求中陈述，并在下面进行描述。
[0021]在计算装置中执行的第一方面方法，该方法包括以下步骤：
[0022]在计算装置处接收多个光谱，所述多个光谱获取自包含生物生理学载体蛋白的相应多个等分试样，其中，生物生理学载体是白蛋白，特别是血清白蛋白，其中，自旋探针的浓度和极性试剂的浓度中的至少一个在等分试样之间变化；
[0023]其中，极性试剂是醇或DMSO，
[0024]基于接收到的光谱由计算装置确定生物物理参数；
[0025]由所述计算装置将所述生物物理参数作为输入值，应用于标记物线性组合，其中，
所述标记物线性组合包括至少两个生物物理参数的预定义组合，
[0026]计算装置使用标记物线性组合来确定与一种或多种所述预定疾病有关的输入参数，以及
[0027]根据标记物线性组合输出结果。
[0028]所述标记物线性组合包括以下生物物理参数中的至少一个：
[0029]‑
自旋探针的结合常数(KB)，
[0030]‑
自旋探针周围的极性(H)，
[0031]‑
自旋探针的序参数(S)，
[0032]‑
自旋探针的旋转相关时间(T)，
[0033]‑
游离自旋探针分子的光谱分量(C3)，
[0034]‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)，或
[0035]‑
几何因数(α)。
[0036]多个光谱可以是多个ESR光谱。ESR光谱仪可用于测量ESR光谱，特别是多个ESR光谱。
[0037]生物生理载体蛋白是白蛋白，特别是血清白蛋白。在本申请的上下文中，为了方便起见，血清白蛋白也称为白蛋白。
[0038]白蛋白在肝脏中产生。如果发生肝病，白蛋白浓度会降低。此外，如果发生肝病，白蛋白可能具有异常功能。例如，结合特定配体(例如激素、脂肪酸和/或药物)的能力可发送改变。
[0039]白蛋白结合配体的性质可以通过ESR光谱，特别是通过多个ESR光谱来确定。可以使用特定的ESR光谱和/或从ESR光谱导出的特征生物物理参数。
[0040]这意味着，借助于多个ESR光谱，可以确定白蛋白的结合性质，其可以指示特定的肝病。
[0041]多个等分试样可以包括三个等分试样。
[0042]在一个实施方式中，极性试剂是醇，特别是C1‑
C6醇。C1‑
C6醇是具有烃链长度的醇，其包含1、2、3、4、5或6个碳原子。根据一个实施方式，极性试剂是乙醇。在另一个实施方式中，极性试剂是DMSO。极性试剂可以充当自旋探针的溶剂，并可以用于改变混合物的极性。
[0043]在一个实施方式中，多个等分试样的每个等分试样中的乙醇浓度是不同的。
[0044]对于多个等分试样中的每个等分试样，测量多个ESR光谱中的各个ESR光谱。
[0045]在一个实施方式中，自旋探针可以是具有未配对电子的有机分子。自旋探针可以具有与另一个分子结合的能力。在一个实施方式中，自旋探针是16
‑
氮氧自由基硬脂酸。16
‑
氮氧自由基硬脂酸具有以下结构：
[0046][0047]在一个替代的实施方式中，自旋探针是替代的自旋标记的脂肪酸。自旋探针可以是5
‑
,7
‑
,12
‑
或16
‑
氮氧自由基硬脂酸或16
‑
氮氧自由基硬脂酸酯。根据一个实施方式，自旋
探针是氮氧自由基月桂酸，特别是7
‑
氮氧自由基月桂酸。在本申请的上下文中，自旋探针也称为自旋标记。
[0048]在不同等分试样中，自旋标记的浓度可以不同。
[0049]在本申请的上下文中，具有最低浓度的极性试剂和/或最低浓度的自旋探针的溶液称为溶液A。具有中等浓度的极性试剂和/或中等浓度的自旋标记的溶液称为溶液B。最有最高浓度的极性试剂和/或具有最高浓度的自旋标记的溶液称为溶液C。
[0050]在本申请的上下文中，第一自旋标记(第一自旋探针)也称为自旋标记1(自旋探针1)，其反映了结合本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种在计算装置中执行的方法，该方法包括以下步骤：在所述计算装置处接收多个光谱，所述多个光谱获取自包含生物生理学载体蛋白的相应的多个等分试样，其中，所述生物生理学载体蛋白是白蛋白，特别是血清白蛋白，其中，自旋探针的浓度和极性试剂的浓度中的至少一个在等分试样之间变化；其中，极性试剂是醇或DMSO，基于所接收的光谱由计算装置确定生物物理参数；由计算装置将所述生物物理参数作为输入值，应用于标记物线性组合，其中，所述标记物线性组合包括至少两个生物物理参数的预定义组合，所述计算装置使用所述标记物线性组合来确定与一种或多种所述预定疾病相关的输入参数，以及根据标记物线性组合输出结果，其特征在于，所述标记物线性组合包括以下生物物理参数中的至少一个：
‑
自旋探针的结合常数(KB)，
‑
自旋探针周围的极性(H)，
‑
自旋探针的序参数(S)，
‑
自旋探针的旋转相关时间(T)，
‑
游离自旋探针分子的光谱分量(C3)，
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)，或
‑
几何因数(α)。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述标记物线性组合包括以下生物物理参数中的至少一个：
‑
自旋探针的结合常数(KB)，
‑
自旋探针周围的极性(H)，
‑
自旋探针的序参数(S)，
‑
自旋探针的旋转相关时间(T)，
‑
游离自旋探针分子的光谱分量(C3)，或
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)。3.如权利要求1或2中任一项所述的方法，其特征在于，所述标记物线性组合包括以下生物物理参数中的至少一个：
‑
游离自旋探针分子的光谱分量(C3)，
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)，
‑
自旋探针的旋转相关时间(T)，
‑
自旋探针的序参数(S)，或
‑
自旋探针周围的极性(H)，特别是
‑
游离自旋探针分子的光谱分量(C3)，
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)，或
‑
自旋探针周围的极性(H)。4.如权利要求1至3中任一项所述的方法，其特征在于，所述标记物线性组合包括以下中的至少一个：
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)和游离自旋探针分子的光谱分量(C3)的组合，
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)和几何因数(α)的组合，
‑
游离自旋探针分子的光谱分量(C3)和几何因数(α)的组合，
‑
自旋探针的序参数(S)，或
‑
自旋探针周围的极性(H)。5.如权利要求1至4中任一项所述的方法，其特征在于，所述标记物线性组合包括以下中的至少一个：
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)和游离自旋探针分子的光谱分量(C3)的组合，
‑
血清脂质组分上自旋探针的光谱分量(C5)和几何因数(α)的组合，
‑
游离自旋探针分子的光谱分量(C3)和几何因数(α)的组合，
‑
自旋探针周围的极性(H)和自旋探针的旋转相关时间(T)的组合，
‑
自旋探针周围的极性(H)和自旋探针的序参数(S)的组合，
‑
自旋探针周围的极性(H)和自...

【专利技术属性】
技术研发人员：K，
申请(专利权)人：艾斯皮雷科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：