基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法技术

本发明专利技术公开基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，涉及临床医疗领域，该基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法的操作步骤具体如下：步骤一：收集患者肿瘤组织；步骤二：进行RNA提取；步骤三：进行RT‑PCR检测；步骤四：通过计算公式得到患者风险值；步骤五：根据风险值评估患者为高风险组或低风险组；该基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法可提供患者预后和免疫治疗疗效的准确预测，通过穿刺少量组织进行检测，可在术前进行预测，方便确定治疗方案，能够提高预测患者生存时间和免疫治疗反应的准确性，且通过预测筛选对免疫治疗可能无效的患者，避免不必要的治疗，同时操作时间短，能够减少患者住院等待时间。

【技术实现步骤摘要】
基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法
本专利技术涉及临床医疗领域，尤其涉及基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法。
技术介绍
乳腺是全球女性发病率最高的恶性肿瘤，也是女性患者死亡的主要原因，根据分子分型，乳腺癌分为LuminalA型，LuminalB型，HER2过表达型和三阴性乳腺癌，其中三阴性乳腺癌患者预后最差，肿瘤恶性程度高，转移率高，并且没有相应的靶向药物的治疗，近年来，免疫治疗在肿瘤临床治疗获得显著疗效，成为继靶向药物以来最有前途的新方案，但是由于三阴性乳腺癌具有较高的肿瘤异质性，只有部分患者可受益于免疫治疗；而传统的检测方法，例如病理常规免疫组化检测仅包括ER,PR,HER2等分子检测，以及FISH检测HER2基因扩增情况，ER或PR阳性患者使用内分泌治疗，HER2过表达型患者使用靶向药物进行治疗，而三者均不表达的患者只能依靠传统的放疗和化疗手段，治疗效果差，因此传统的临床检测手段无法判读三阴性乳腺癌患者是否适合免疫治疗，并且该检测方法时间长，一般通过免疫组化进行初筛，如果HER2表达为1+或2+阳性，还需要辅助FISH进行基因检测，不仅增加等待时间，而且增加患者的经济负担，更重要的是，该传统检测流程是基于传统的治疗方案设置的，无法应用到新型的免疫治疗方案上，如果对所有三阴性乳腺癌患者进行免疫治疗，会有一部分患者对治疗不敏感，甚至加重病情，且需要支付昂贵的治疗费用；而让所有患者都不使用免疫治疗，则可能导致一部分可能受益的患者错过最佳治疗时间，为此，我们提出了基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法。
技术实现思路
本专利技术的目的是为了解决现有技术中存在的缺陷，而提出的基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法。为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，该基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法的操作步骤具体如下：步骤一：收集患者肿瘤组织；步骤二：进行RNA提取；步骤三：进行RT-PCR检测；步骤四：通过计算公式得到患者风险值；步骤五：根据风险值评估患者为高风险组或低风险组。作为本专利技术进一步的方案，步骤一中所述肿瘤组织包括新鲜组织或石蜡组织，步骤二中所述RNA提取的具体方式为通过RNA提取试剂盒进行提取。作为本专利技术进一步的方案，步骤三中所述进行RT-PCR检测的目的在于：检测模型中的13个免疫相关长链非编码RNA(LncRNA)的表达水平，得到13个lncRNA的表达值。作为本专利技术进一步的方案，步骤四中所述计算公式如下：Exp(DLGAP-AS1)×(-0.61)+Exp(AC104083.1)×(0.08)+Exp(LINC00472)×(0.63)+Exp(YTHDF3-AS1)×(-0.62)+Exp(CA3-AS1)×(1.21)+Exp(AC104958.2)×(0.86)+Exp(LINC00839)×(0.23)+Exp(AC245297.4)×(-0.87)+Exp(BRWD1-AS2)×(2.26)+Exp(USP30-AS1)×(-0.44)+Exp(AL133338.1)×(-0.69)+Exp(NIFK-AS1)×(-1.15)+Exp(AC016888.1)×(0.34)；其中，Exp为表达量。作为本专利技术进一步的方案，步骤五中所述高风险组或低风险组的评估方式具体如下：风险值大于5为高风险组；风险值小于等于5为低风险组，其中，风险值大于5时，患者从免疫治疗中无法获益，不建议进行免疫治疗；风险值小于等于5时，患者对免疫治疗敏感，建议进行免疫治疗。相比于现有技术，本专利技术的有益效果在于：该基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法可提供患者预后和免疫治疗疗效的准确预测，通过穿刺少量组织进行检测，可在术前进行预测，方便确定治疗方案，能够提高预测患者生存时间和免疫治疗反应的准确性，且通过预测筛选对免疫治疗可能无效的患者，减轻患者负担，避免不必要的治疗，同时操作时间短，能够减少患者住院等待时间。附图说明附图用来提供对本专利技术的进一步理解，并且构成说明书的一部分，与本专利技术的实施例一起用于解释本专利技术，并不构成对本专利技术的限制。图1为本专利技术的流程框图；图2为本专利技术中高、低风险组患者的PD-L1表达差异图；图3为本专利技术中风险评分及临床病理特征的5年ROC曲线及AUC值展示图；图4为本专利技术中免疫相关lncRNA多因素分析的森林图；图5为本专利技术中风险模型3、5、10年的ROC曲线及AUC值展示图；图6为本专利技术中高、低风险组患者的kaplan-Meier生存风险图。具体实施方式下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。在本专利技术的描述中，需要理解的是，术语“上”、“下”、“前”、“后”、“左”、“右”、“顶”、“底”、“内”、“外”等指示的方位或位置关系为基于附图所示的方位或位置关系，仅是为了便于描述本专利技术和简化描述，而不是指示或暗示所指的装置或元件必须具有特定的方位、以特定的方位构造和操作，因此不能理解为对本专利技术的限制。参照图1-6，基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，该基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法的操作步骤具体如下：步骤一：收集患者肿瘤组织；步骤二：进行RNA提取；步骤三：进行RT-PCR检测；步骤四：通过计算公式得到患者风险值；步骤五：根据风险值评估患者为高风险组或低风险组。步骤一中肿瘤组织包括新鲜组织或石蜡组织，步骤二中RNA提取的具体方式为通过RNA提取试剂盒进行提取。步骤三中进行RT-PCR检测的目的在于：检测模型中的13个免疫相关长链非编码RNA(LncRNA)的表达水平，得到13个lncRNA的表达值，如图4所示。作为本专利技术进一步的方案，步骤四中计算公式如下：Exp(DLGAP-AS1)×(-0.61)+Exp(AC104083.1)×(0.08)+Exp(LINC00472)×(0.63)+Exp(YTHDF3-AS1)×(-0.62)+Exp(CA3-AS1)×(1.21)+Exp(AC104958.2)×(0.86)+Exp(LINC00839)×(0.23)+Exp(AC245297.4)×(-0.87)+Exp(BRWD1-AS2)×(2.26)+Exp(USP30-AS1)×(-0.44)+Exp(AL133338.1)×(-0.69)+Exp(NIFK-AS1)×(-1.15)+Exp(AC016888.1)×(0.34)；其中，Exp为表达量，具体数据如下表：步骤五中高风本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，其特征在于，该基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法的操作步骤具体如下：/n步骤一：收集患者肿瘤组织；/n步骤二：进行RNA提取；/n步骤三：进行RT-PCR检测；/n步骤四：通过计算公式得到患者风险值；/n步骤五：根据风险值评估患者为高风险组或低风险组。/n

【技术特征摘要】
1.基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，其特征在于，该基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法的操作步骤具体如下：
步骤一：收集患者肿瘤组织；
步骤二：进行RNA提取；
步骤三：进行RT-PCR检测；
步骤四：通过计算公式得到患者风险值；
步骤五：根据风险值评估患者为高风险组或低风险组。


2.根据权利要求1所述的基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，其特征在于，步骤一中所述肿瘤组织包括新鲜组织或石蜡组织，步骤二中所述RNA提取的具体方式为通过RNA提取试剂盒进行提取。


3.根据权利要求1所述的基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，其特征在于，步骤三中所述进行RT-PCR检测的目的在于：检测模型中的13个免疫相关长链非编码RNA(LncRNA)的表达水平，得到13个lncRNA的表达值。


4.根据权利要求1所述的基于免疫相关lncRNA构建三阴性乳腺癌风险预测方法，其特征在于，步骤四中所述患者风险值的计算公式如下：<...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨文琳，张瑞，王磊，王婷，赵丽华，
申请(专利权)人：杨文琳，
类型：发明
国别省市：山东;37